cmtk-convertx - 클라우드에서의 온라인

프로그램:

이름

Convertx - 이미지 파일 형식과 데이터 유형 간을 변환합니다.

개요

Convertx [옵션] 인파일 아웃파일

기술

이 도구는 이미지 파일 형식과 픽셀 데이터 유형 간에 변환합니다. 적용할 수도 있습니다
프로세스에서 간단한 범용 이미지 작업을 수행합니다. 임의의 수의 작업
명령줄에서 지정할 수 있으며, 이는 주어진 순서대로 정확하게 적용됩니다.

옵션

글로벌 툴킷 옵션 (이들 are 공유 by 모든 CMTK 도구)
--도움
기본 명령줄 옵션 목록을 표준 출력에 씁니다.

--도움말
기본 및 고급 명령줄 옵션의 전체 목록을 표준 출력에 씁니다.

--위키
MediaWiki 마크업의 표준 출력에 명령줄 옵션 목록을 씁니다.

--남성
표준 출력에 대한 'nroff' 마크업의 매뉴얼 페이지 소스를 작성하십시오.

--번역
툴킷 버전을 표준 출력으로 작성하십시오.

--에코
현재 명령줄을 표준 출력에 씁니다.

--상세 수준
상세 수준을 설정합니다.

--말 수가 많은, -v
자세한 표시 수준을 1씩 증가시킵니다(더 이상 사용되지 않음, 이전 버전과의 호환성을 위해 지원됨).

--스레드
최대 병렬 스레드 수를 설정합니다(POSIX 스레드 및 OpenMP의 경우).

이미지/변환 데이터베이스
--db
새로 생성된 데이터베이스로 업데이트해야 하는 이미지/변환 데이터베이스의 경로
영상. [기본: 없음]

입력 영상 Controls
--세트 패딩
패딩 값 설정: 이 값을 갖는 입력 이미지의 모든 픽셀은 무시됩니다.
모든 후속 작업에서.

--unset-padding
설정되지 않은 패딩 값: 모든 후속 작업에 대해 모든 픽셀이 처리됩니다.
그들의 가치에 따라.

--레이블
이미지 값이 개별 레이블로 처리되도록 지정합니다. 이로 인해
NIfTI 형식의 출력 파일에 설정할 적절한 의도 코드에 있습니다.

--회색
이미지 값이 연속적인 회색 레벨로 처리되도록 지정합니다. 이것은
NIfTI 형식에서 읽은 파일의 인텐트 코드를 재설정합니다.

Data 타입 매출 상승
--숯
8비트, 부호 있는 정수

--바이트
8비트, 부호 없는 정수

--짧은
16비트, 부호 있는 정수

--ushort
16비트, 부호 없는 정수

--정수
32비트 부호 있는 정수

--단위
32비트 부호 없는 정수

--뜨다
32비트 부동 소수점

--더블
64비트 부동 소수점

가치관 매핑
--맵 값
픽셀 값에 매핑 기능을 적용합니다. 매핑은 다음과 같이 정의됩니다.
'VAL0[,VAL1,...][:NEWVAL]' - VAL0, VAL1 등의 값을 새 값 NEWVAL에 매핑합니다. 만약에
NEWVAL이 제공되지 않고 값이 패딩으로 설정됩니다.

--맵 값만
픽셀 값에 매핑 기능을 적용하고 매핑되지 않은 픽셀을 패딩으로 바꿉니다.
이러한 여러 매핑 규칙은 RULE0+RULE1[+...]로 연결될 수 있습니다. 모두
연결된 규칙은 동시에 적용됩니다. 매핑은 다음과 같이 정의됩니다.
'VAL0[,VAL1,...][:NEWVAL]' - VAL0, VAL1 등의 값을 새 값 NEWVAL에 매핑합니다. 만약에
NEWVAL이 제공되지 않고 값이 패딩으로 설정됩니다. 이러한 매핑 규칙은 여러 개일 수 있습니다.
RULE0+RULE1[+...]로 연결됩니다. 연결된 모든 규칙이 적용됩니다.
동시에.

--대체 패딩
패딩된 픽셀 데이터를 주어진 값으로 바꿉니다.

--replace-inf-nan
무한하고 숫자가 아닌 픽셀을 모두 주어진 값으로 바꿉니다.

영상 뒤집기
--플립-x
X 방향을 따라 뒤집기(거울)

--플립-y
Y 방향을 따라 뒤집기(거울)

--플립-z
Z 방향을 따라 뒤집기(거울)

영상 마스킹 과 임계값
--마스크
바이너리 마스크 파일 이름: 마스크가 0인 모든 이미지 픽셀을 제거합니다. 마스크 아웃된 픽셀
XNUMX으로 설정되지 않고 대신 현재 설정된 패딩으로 대체됩니다.
값. 강제로 0으로 설정하려면 '--mask' 앞에 '--set-padding XNUMX'을 사용하세요.

--마스크 역
역 이진 마스크 ​​파일 이름은 마스크가 0이 아닌 모든 이미지 픽셀을 제거합니다.
위의 '--mask' 아래 패딩에 관한 참고 사항도 있습니다.

--thresh 이하
임계값 아래의 모든 값을 임계값으로 설정합니다.

--임계값 이상
임계값 이상의 모든 값을 임계값으로 설정합니다.

--thresh-아래-패딩
임계값 아래의 모든 값을 패딩 값으로 설정합니다.

--thresh-위-패딩
임계값 이상의 모든 값을 패딩 값으로 설정합니다.

--binarize-thresh
임계값 미만의 모든 값을 0으로 설정하고, 같거나 그 이상의 모든 값을 1로 설정합니다.

--otsu-thresh
Otsu의 방법으로 계산된 임계값을 사용하여 이미지를 0/1로 이진화합니다. 인수는 숫자입니다.
임계값 계산을 위한 히스토그램 저장소.

--otsu-thresh-nbins
사용자가 정의한 수의 히스토그램 빈을 사용하여 Otsu 방법을 사용한 이진화
임계값 계산.

--prune-히스토그램
'강도 히스토그램 정리'에 의한 임계값 이미지, 즉 주어진 인수 n에 대한
[히스토그램 빈]은 최고 및
가장 낮은 복셀이 임계값으로 지정됩니다.

--프룬-히스토그램-높음
'--prune-histograms'와 유사하지만 높은 강도만 제거합니다.

--prune-히스토그램-낮음
'--prune-histograms'와 유사하지만 낮은 강도만 제거합니다.

강렬 변환
--범위에 따른 규모
바이트로 변환하기 전에 이미지 강도를 'from:to' 범위(예: '0:255')로 조정합니다.
데이터입니다.

--히스토그램 균등화
히스토그램 평준화를 적용합니다.

--히스토그램 균등화-nbins
히스토그램 균등화 적용 쓰레기통의 수.

--일치 히스토그램
인수로 제공된 이미지의 분포와 일치하도록 강도를 변환합니다.
이 명령에 대해.

--일치-평균-sdev
강도의 평균 및 표준 분포와 일치하도록 강도를 조정합니다.
이 명령의 인수로 제공된 이미지입니다.

형태학적 행정부
--돌아가는 것
바이너리 마스크를 되돌립니다. 즉, 전경과 배경을 교환합니다.

--좀먹다
형태학적 침식 연산자(픽셀 단위)

--넓히다
형태학적 팽창 연산자(픽셀 단위)

--침식 거리
형태학적 침식 연산자(거리별). 이방성 데이터에 선호되는 경우가 많습니다.

--침식-거리-다중 라벨
다중 레이블 맵에 대한 형태학적 침식 연산자(거리별)입니다. 결과는 다음과 같습니다
인덱스에 따라 바이트, unsigned short 또는 unsigned int 데이터 중 하나입니다.
입력에서 가장 많이 사용된 레이블입니다.

--확장 거리
형태학적 팽창 연산자(거리별). 종종 이방성에 바람직함
데이터입니다.

--연결된 구성 요소
구성 요소 크기를 줄여 번호가 매겨진 영역으로 연결된 구성 요소 맵 만들기

--경계 지도
경계 지도 생성

--다중 경계 지도
다중 값 경계 맵 생성

--거리 지도
부호 없는 유클리드 거리 맵을 계산합니다. 입력 이미지는 바이너리 마스크로 해석됩니다.

--서명 거리 지도
부호 있는 계산(내부=음수, 외부=양수) 유클리드 거리 맵

필터 행정부
--중앙값 필터
중앙 필터. 이 작업은 필터 반경(픽셀 단위)을 매개변수로 사용합니다. ㅏ
단일 정수는 XNUMX차원 모두에서 커널 반경을 정의합니다. 쉼표 세 개-
분리된 정수는 XNUMX차원에 대해 별도의 반경을 정의합니다.

--평균 필터
지역 평균 필터. 이 작업은 픽셀 단위의 필터 반경을
매개변수. 단일 정수는 XNUMX차원 모두에서 커널 반경을 정의합니다. 삼
쉼표로 구분된 정수는 XNUMX차원에 대해 별도의 반경을 정의합니다.

--빠른 평균 필터
지역 평균 필터(빠른 선형 시간 구현) 이 작업에는
매개변수로 반경을 픽셀 단위로 필터링합니다. 단일 정수가 커널 반경을 정의합니다.
세 가지 차원 모두에서. 쉼표로 구분된 세 개의 정수는 각각의 반경을 정의합니다.
세 가지 차원.

--variance-filter
지역 변동 필터. 이 작업은 픽셀 단위의 필터 반경을
매개변수. 단일 정수는 XNUMX차원 모두에서 커널 반경을 정의합니다. 삼
쉼표로 구분된 정수는 XNUMX차원에 대해 별도의 반경을 정의합니다.

--빠른 분산 필터
빠른(선형 시간) 지역 분산 필터입니다. 이 작업은 필터 반경을 사용합니다.
매개변수로 픽셀 단위입니다. 단일 정수는 세 가지 모두의 커널 반경을 정의합니다.
치수. 세 개의 쉼표로 구분된 정수는 세 개의 개별 반경을 정의합니다.
치수.

--XNUMX번째 순간 필터
지역적 XNUMX차 모멘트 필터. 이 작업은 픽셀 단위의 필터 반경을
매개변수. 단일 정수는 XNUMX차원 모두에서 커널 반경을 정의합니다. 삼
쉼표로 구분된 정수는 XNUMX차원에 대해 별도의 반경을 정의합니다.

--표준편차 필터
지역 표준 편차 필터. 이 작업은 필터 반경을 픽셀 단위로 사용합니다.
매개변수로. 단일 정수는 XNUMX차원 모두에서 커널 반경을 정의합니다.
쉼표로 구분된 세 개의 정수는 세 차원에 대한 별도의 반경을 정의합니다.

--부드러움 필터
지역적 '부드러움' 필터. 이 작업은 픽셀 단위의 필터 반경을
매개변수. 단일 정수는 XNUMX차원 모두에서 커널 반경을 정의합니다. 삼
쉼표로 구분된 정수는 XNUMX차원에 대해 별도의 반경을 정의합니다.

--가우스-필터-시그마
가우스 커널을 사용하여 이미지를 필터링합니다. 이 작업은 단일 실수 값을 사용합니다.
커널 계수 시그마를 월드 단위[예: mm]로 지정하는 매개변수
매개변수.

--gaussian-필터-fwhm
가우스 커널을 사용하여 이미지를 필터링합니다. 이 작업은 단일 실수 값을 사용합니다.
커널 전체 폭을 월드 단위로 최대 절반으로 지정하는 매개변수
[예: mm].

--라플라스 필터
가장자리를 강화하는 라플라시안 커널로 이미지를 필터링합니다.

그리드 행정부
--다운샘플 선택
축별 인자 'Fx,Fy,Fz'를 사용하거나 단일을 사용하여 픽셀 선택별로 이미지를 다운샘플링합니다.
요인 'Fxyz'

--다운샘플 평균
축당 인자 'Fx,Fy,Fz'를 사용하거나 단일 사용하여 평균화하여 이미지를 다운샘플링합니다.
요인 'Fxyz'

--리샘플
이미지 시야를 유지하면서 이미지를 거의 등방성 픽셀로 리샘플링합니다.
인수 하나를 취합니다. 목표 해상도는 월드 단위(예: mm)입니다.

--재샘플-정확함
이미지를 일치시키면서 주어진 해상도의 정확히 등방성 픽셀로 이미지를 리샘플링합니다.
이미지 시야각을 최대한 가깝게 합니다. 하나의 인수, 즉 목표 해상도를 취합니다.
세계 단위 [예: mm]

--인덱스별로 자르기
다음과 같이 주어진 XNUMX개의 그리드 인덱스 좌표 세트로 지정된 영역으로 이미지를 자릅니다.
comma-separated integers x0,y0,z0,x1,y1,z1

--임계값별 자르기
주어진 임계값을 통해 결정된 영역으로 이미지를 자릅니다. 결과 이미지는
주어진 매개변수보다 큰 모든 픽셀을 포함합니다.

--임계값별-쓰기-지역 자르기
지정된 임계값을 통해 결정된 영역으로 이미지를 자르고 자르기 영역을
표준 출력.

--임계값별 자르기-쓰기-xform
지정된 임계값을 통해 결정된 영역으로 이미지를 자르고 자르기 쓰기
표준 출력으로 변환.

작가

Torsten Rohlfing, Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
마우러, 다니엘 B. 루사코프, 야로슬라프 할첸코

onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 cmtk-convertx를 사용하세요.