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온웍스 파비콘

cmtk-reformatx - 클라우드의 온라인

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터를 통해 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 cmtk-reformatx 실행

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 cmtk-reformatx 명령입니다.

프로그램:

이름


reformatx - 볼륨 재포맷

개요


reformatx [옵션] --floating floatingImg 대상 x0 [x1 ...]
또는 reformatx [options] target [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
또는 WHERE x0 ... xN 및 xx0 ... xxN은 [{-i,--inverse}] 변환##입니다. (처음이면
시퀀스의 변환이 반전되면 '--inverse' 앞에 '--'가 와야 합니다.
즉, '-- --inverse xform.path' 사용).

기술


형식이 재지정된 이미지와 Jacobian 맵을 계산하기 위한 확장된 볼륨 재포맷 도구
연결된 변환의 임의 시퀀스

옵션


글로벌 툴킷 옵션 (이들 are 공유 by 모든 CMTK 도구)
--도움
기본 명령줄 옵션 목록을 표준 출력에 씁니다.

--도움말
기본 및 고급 명령줄 옵션의 전체 목록을 표준 출력에 씁니다.

--위키
MediaWiki 마크업의 표준 출력에 명령줄 옵션 목록을 씁니다.

--남성
표준 출력에 대한 'nroff' 마크업의 매뉴얼 페이지 소스를 작성하십시오.

--번역
툴킷 버전을 표준 출력으로 작성하십시오.

--에코
현재 명령줄을 표준 출력에 씁니다.

--상세 수준
상세 수준을 설정합니다.

--말 수가 많은, -v
자세한 표시 수준을 1씩 증가시킵니다(더 이상 사용되지 않음, 이전 버전과의 호환성을 위해 지원됨).

--스레드
최대 병렬 스레드 수를 설정합니다(POSIX 스레드 및 OpenMP의 경우).

--출력 유형
출력 이미지의 스칼라 데이터 유형입니다. 지원되는 값: "char", "byte", "short",
"ushort", "int", "uint", "float", "double" 또는 다음 중 하나를 사용하십시오.

--숯
8비트, 부호 있음

--바이트
8비트, 부호 없음

--짧은
16비트, 부호 있음

--ushort
16비트, 부호 없음

--정수
서명된 32비트

--단위
부호 없는 32비트

--뜨다
32비트 부동 소수점

--더블
64비트 부동 소수점

--패드 아웃 , -P
출력 이미지의 패딩 값 [기본: 0]

옵션 for 평원 다시 포맷팅
--보간
이미지 보간 방법. 지원되는 값: "linear", "nn", "cubic", "pv", "sinc-
cosine", "sinc-hamming", 여기서 기본값은 "linear"이거나 다음 중 하나를 사용하십시오.

--선의
삼선형 보간 [이것 is 전에, 기본]

--nn 최근접이웃 보간

--입방체
삼차 보간

--pv 부분 볼륨 보간

--sinc-코사인
코사인 창을 사용한 싱크 보간

--sinc-해밍
해밍 윈도우를 사용한 싱크 보간

--sinc-창-반경
Sinc 보간에 대한 창 반경 [기본: 3]

--보존 질량
대량 보존 재포맷: 재포맷된 모든 값에 Jacobian을 곱합니다.
적용된 변환의 결정자.

옵션 for 야 코비안 지도 다시 포맷팅
--jacobian-올바른-글로벌
전역 축척에 맞게 Jacobian 맵을 수정합니다.

--no-jacobian-올바른-글로벌
전역 축척에 대해 Jacobian 맵을 수정하지 마십시오. [이것 is 전에, 기본]

입력 옵션
--타겟 그리드
Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]로 재형식화할 대상 그리드를 정의합니다.
(흐림:픽셀:오프셋)

--마스크, -m
대상 픽셀 데이터를 바이너리 마스크로 사용합니다.

--수확고
자르기 대상 이미지: x0,y0,z0,x1,y1,z2

--대상 오프셋 , -O
대상 이미지 오프셋을 재정의하고 x,y,z mm로 설정

--타겟-오프셋-픽셀
대상 이미지 오프셋을 재정의하고 dx,dy,dz 픽셀로 설정

--떠 있는 , -F
플로팅 이미지의 형식 및 경로. [기본: 없음]

--패드 부동
플로팅 이미지의 패딩 값 [기본: 장애가있는]

산출 옵션
--아웃파일 , -o
출력 이미지의 형식 및 경로. [기본: reformat.nii ]

이미지/변환 데이터베이스
--db
새로 생성된 데이터베이스로 업데이트해야 하는 이미지/변환 데이터베이스의 경로
영상. [기본: 없음]

작가


Torsten Rohlfing, Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
마우러, 다니엘 B. 루사코프, 야로슬라프 할첸코

onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 cmtk-reformatx 사용


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