dsr2xml - 클라우드의 온라인

프로그램:

이름

dsr2xml - DICOM SR 파일 및 데이터 세트를 XML로 변환

개요

dsr2xml [옵션] dsrfile-in [xmlfile-out]

기술

The dsr2xml 유틸리티는 DICOM 구조 보고(SR) 문서의 내용을 변환합니다.
(파일 형식 또는 원시 데이터 세트)를 XML(Extensible Markup Language)로 변환합니다. XML 스키마
dsr2xml.xsd 아직 표준 형식을 따르지 않습니다. 그러나, 그 dsr2xml 신청
향후 이 측면에서 향상될 수 있습니다(예: HL7/CDA 지원 - 임상
문서 아키텍처).

If dsr2xml 원시 데이터 세트(파일 형식 메타 헤더가 없는 DICOM 데이터)를 읽습니다.
파일의 처음 몇 바이트를 검사하여 전송 구문을 추측합니다. 그것은이다
전송 구문을 항상 정확하게 추측할 수 있는 것은 아니므로 변환하는 것이 좋습니다.
가능할 때마다 데이터를 파일 형식으로 설정합니다(사용 dcmconv 공익 사업). 그것은 또한
사용 가능 -f 그리고 -t[ieb] 강제 옵션 dsr2xml 데이터 세트를 읽으려면
특정 전송 구문.

매개 변수

dsrfile-in 변환할 DICOM SR 입력 파일 이름

xmlfile-out XML 출력 파일 이름(기본값: stdout)

옵션

일반 옵션
-h --도움말
이 도움말 텍스트를 인쇄하고 종료하십시오.

--번역
버전 정보를 출력하고 종료

--인수
확장된 명령줄 인수 인쇄

-q --조용한
자동 모드, 경고 및 오류 인쇄 없음

-v --장황
상세 모드, 인쇄 처리 세부 정보

-d --디버그
디버그 모드, 디버그 정보 인쇄

-ll --log-level [l]레벨: 문자열 상수
(치명적, 오류, 경고, 정보, 디버그, 추적)
로거에 레벨 l 사용

-lc --log-config [f]파일 이름: 문자열
로거에 구성 파일 f 사용

입력 옵션
입력 파일 형식:

+f --파일 읽기
파일 형식 또는 데이터 세트 읽기(기본값)

+fo --파일 읽기 전용
파일 형식만 읽기

-f --읽기 데이터 세트
파일 메타 정보 없이 데이터 세트 읽기

입력 전송 구문:

-t= --read-xfer-auto
TS 인식 사용(기본값)

-td --read-xfer-감지
파일 메타 헤더에 지정된 TS 무시

-te --read-xfer-little
명시적 VR 리틀 엔디안 TS로 읽기

-tb --read-xfer-big
명시적 VR 빅 엔디안 TS로 읽기

-ti --read-xfer-암시적
암시적 VR 리틀 엔디안 TS로 읽기

처리 옵션
오류 처리:

-Er --알 수 없는 관계
알 수 없는/누락된 관계 유형 수락

-Ev --무효 항목 값
잘못된 콘텐츠 항목 값 수락
(예: VR 또는 VM 정의 위반)

-Ec --무시-제약조건
관계 내용 제약 무시

-Ee --항목 오류 무시
콘텐츠 항목 오류에 대해 중단하지 말고 경고만 하십시오.
(예: 결측값 유형별 속성)

-Ei --무효 항목 건너뛰기
잘못된 콘텐츠 항목 건너뛰기(하위 트리 포함)

-Dv --비활성화-vr-체커
VR 준수 문자열 값 확인 비활성화

특정 문자 집합:

+Cr --charset-요구
확장 문자 집합 선언 필요(기본값)

+Ca --charset-assume [c]harset: 문자열
확장 문자 집합이 선언되지 않은 경우 문자 집합 c를 가정합니다.

+Cc --문자셋-체크-모두
문자열 값이 있는 모든 데이터 요소 확인
(기본값: PN, LO, LT, SH, ST 및 UT만)

# 이 옵션은 적절한 매핑에만 사용됩니다.
# XML 문자 인코딩, 하지만 UTF-8로의 변환은 아님

+U8 --utf8로 변환
영향을 받는 모든 요소 값 변환
특정 문자 집합(0008,0005)을 UTF-8로

# libiconv 툴킷의 지원이 필요합니다.

출력 옵션
부호화:

+Ea --attr-모두
모든 것을 XML 속성으로 인코딩
(+Ec, +Er, +Ev, +Et 단축키)

+Ec --attr-코드
인코딩 코드 값, 코딩 체계 지정자
및 코딩 체계 버전을 XML 속성으로

+Er --attr-관계
관계 유형을 XML 속성으로 인코딩

+Ev --attr-값 유형
값 유형을 XML 속성으로 인코딩

+Et --attr-템플릿-id
템플릿 ID를 XML 속성으로 인코딩

+Ee --템플릿 봉투
템플릿 요소는 콘텐츠 항목을 포함합니다.
(+Wt 필요, +Et 의미)

XML 구조:

+Xs --add-스키마-참조
XML 스키마 "dsr2xml.xsd"에 대한 참조 추가
(+Ea, +Ec, +Er, +Ev, +Et, +Ee, +We 제외)

+Xn --use-xml-네임스페이스
루트 요소에 XML 네임스페이스 선언 추가

쓰기:

+우리는 --write-empty-tags
값이 비어 있어도 모든 태그 쓰기

+Wi --쓰기 항목 ID
항상 항목 식별자 쓰기

+Wt --쓰기-템플릿-id
템플릿 식별 정보 쓰기

노트

디컴 적합성
The dsr2xml 유틸리티는 다음 SOP 클래스를 지원합니다.

SpectaclePrescriptionReportStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.78.6
MacularGridThicknessAndVolumeReportStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.79.1
BasicTextSR저장소 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.11
향상된SRStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.22
종합 SRStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.33
포괄적인 3DSR저장소 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.34
프로시저 로그 저장소 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.40
MammographyCADSR저장소 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.50
KeyObjectSelectionDocumentStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.59
ChestCADSR저장소 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.65
XRayRadiationDoseSRStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.67
방사성 의약품 방사선DoseSR저장 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.68
ColonCADSR저장소 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.69
ImplantationPlanSRDocumentStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.70

현재는 필수 속성과 일부 선택적 속성만 지원됩니다.

캐릭터 부호화
XML 인코딩은 DICOM 속성(0008,0005)에서 자동으로 결정됩니다.
다음 매핑을 사용하는 '특정 문자 집합':

ASCII(ISO_IR 6) => "UTF-8"
UTF-8 "ISO_IR 192" => "UTF-8"
ISO 라틴 1 "ISO_IR 100" => "ISO-8859-1"
ISO 라틴 2 "ISO_IR 101" => "ISO-8859-2"
ISO 라틴 3 "ISO_IR 109" => "ISO-8859-3"
ISO 라틴 4 "ISO_IR 110" => "ISO-8859-4"
ISO 라틴 5 "ISO_IR 148" => "ISO-8859-9"
키릴 자모 "ISO_IR 144" => "ISO-8859-5"
아랍어 "ISO_IR 127" => "ISO-8859-6"
그리스어 "ISO_IR 126" => "ISO-8859-7"
히브리어 "ISO_IR 138" => "ISO-8859-8"

이 DICOM 속성이 입력 파일에 없으면 필요하지만 옵션 --문자셋-
취하다 적절한 문자 집합을 수동으로 지정하는 데 사용할 수 있습니다(다음 중 하나를 사용하여
DICOM 정의 용어).

다중 문자 집합은 지원되지 않습니다(첫 번째 속성 값만
값 다중성의 경우). 필요한 경우 옵션 --utf8로 변환 변환하는 데 사용할 수 있습니다
XML 형식으로 변환하기 전에 UTF-8 인코딩으로 설정된 DICOM 파일 또는 데이터.

ERROR 손질
처리 옵션에 주의하십시오. --알 수 없는 관계, --무효 항목-
가치, --제약 무시, --항목 오류 무시 그리고 --무효 항목 건너뛰기 그들은 이후
DICOM SR 입력 파일에 대한 특정 유효성 검사를 비활성화하므로 결과가 발생할 수 있습니다.
비표준 준수 출력에서. 그러나 하나 이상의 사용에 대한 이유가 있을 수 있습니다.
예를 들어 잘못 인코딩된 SR 문서를 읽고 처리하기 위해 이러한 옵션 중.

제한 사항
XML 스키마 dsr2xml.xsd 의 모든 변형을 지원하지는 않습니다. dsr2xml 출력 형식.
그러나 기본 출력 형식(추가 옵션 --use-xml-네임스페이스) 작동해야 합니다.

벌채 반출

다양한 명령줄 도구 및 기본 라이브러리의 로깅 출력 수준은
사용자가 지정해야 합니다. 기본적으로 오류와 경고만 표준에 기록됩니다.
오류 스트림. 옵션 사용 --말 수가 많은 처리 세부 정보와 같은 정보 메시지
보고된다. 옵션 -디버그 내부 활동에 대한 자세한 정보를 얻는 데 사용할 수 있습니다.
예를 들어 디버깅 목적으로. 옵션을 사용하여 다른 로깅 수준을 선택할 수 있습니다. --통나무-
수평. 에 --조용한 모드에서만 치명적인 오류가 보고됩니다. 이러한 매우 심각한 오류 이벤트에서,
응용 프로그램은 일반적으로 종료됩니다. 다양한 로깅 수준에 대한 자세한 내용은
모듈 'oflog'의 문서를 참조하십시오.

로깅 출력을 파일에 기록해야 하는 경우(선택적으로 로그 파일 회전 포함),
syslog(Unix) 또는 이벤트 로그(Windows) 옵션 --로그 구성 사용할 수 있습니다. 이것
구성 파일은 또한 특정 메시지만 특정 출력으로 보낼 수 있습니다.
스트림 및 모듈 또는 애플리케이션을 기반으로 특정 메시지 필터링
생성됩니다. 예제 구성 파일은 다음에서 제공됩니다. /로거.cfg.

COMMAND LINE

모든 명령줄 도구는 매개변수에 대해 다음 표기법을 사용합니다.
선택적 값(0-1), 세 개의 후행 점은 여러 값이 허용됨을 나타냅니다.
(1-n), 둘의 조합은 0에서 n 값을 의미합니다.

명령줄 옵션은 선행 '+' 또는 '-' 기호로 매개변수와 구별됩니다.
각기. 일반적으로 명령줄 옵션의 순서와 위치는 임의적입니다(즉,
어디에나 나타날 수 있음). 그러나 옵션이 상호 배타적인 경우 가장 오른쪽 모양
사용. 이 동작은 일반적인 Unix 셸의 표준 평가 규칙을 따릅니다.

또한 '@' 기호를 접두사로 사용하여 하나 이상의 명령 파일을 지정할 수 있습니다.
파일 이름(예: @명령.txt). 이러한 명령 인수는 다음 내용으로 대체됩니다.
해당 텍스트 파일(여러 공백은
추가 평가 전에 두 개의 따옴표 사이에 나타납니다. 점에 유의하시기 바랍니다
명령 파일은 다른 명령 파일을 포함할 수 없습니다. 이 간단하지만 효과적인 접근 방식
옵션/매개변수의 일반적인 조합을 요약하고 길고
혼란스러운 명령줄(예는 파일 /dumppat.txt).

환경

The dsr2xml 유틸리티는 파일에 지정된 DICOM 데이터 사전을 로드하려고 시도합니다.
DCMDICT경로 환경 변수. 기본적으로, 즉 DCMDICT경로 환경 변수
설정되지 않은 파일 /dicom.dic 사전이 빌드되지 않으면 로드됩니다.
응용 프로그램에 추가합니다(Windows의 경우 기본값).

기본 동작이 선호되어야 하며 DCMDICT경로 환경 변수만
대체 데이터 사전이 필요할 때 사용됩니다. NS DCMDICT경로 환경 변수
유닉스 쉘과 같은 형식을 가짐 PATH 콜론(':')으로 구분되는 변수
항목. Windows 시스템에서는 세미콜론(';')이 구분 기호로 사용됩니다. 데이터 사전
코드는 지정된 각 파일을 로드하려고 시도합니다. DCMDICT경로 환경 변수. 그것
데이터 사전을 로드할 수 없는 경우 오류입니다.

onworks.net 서비스를 사용하여 dsr2xml 온라인 사용