이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 명령 edialigne입니다.
프로그램:
이름
edialign - 시퀀스의 로컬 다중 정렬
개요
에디얼라인 - 시퀀스 시퀀스 세트 -누크모드 명부 -revcomp 부울 [-중복 선택]
[-결합 명부] [-maxfragl 정수] -프래그매트 부울 -프래그심 정수
[-점수 부울] [-한계점 뜨다] -마스크 부울 -도스타 부울
-스타넘 정수 -아웃파일 아웃파일 - outseq seqoutall
에디얼라인 -도움
기술
에디얼라인 EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈"의 명령줄 프로그램입니다.
소프트웨어 제품군”). "정렬:다중" 명령 그룹의 일부입니다.
옵션
입력 섹션에 있어야 합니다.
- 시퀀스 시퀀스 세트
추가 섹션에 있어야 합니다.
-누크모드 명부
핵산 서열 정렬 모드(단순, 번역 또는 혼합) 기본값: n
-revcomp 부울
기본값: N
-중복 선택
기본적으로 중첩 가중치는 Nseq =<35일 때 사용되지만 이를 'yes'로 설정할 수 있습니다.
'no' 기본값: 기본값(Nseq =< 35인 경우)
-결합 명부
시퀀스 트리를 구성하는 클러스터링 방법(UPGMA, 최소 연결 또는 최대
연결) 기본값: UPGMA
-maxfragl 정수
기본값: 40
-프래그매트 부울
기본값: N
-프래그심 정수
기본값: 4
-점수 부울
기본값: N
-한계점 뜨다
기본값: 0.0
산출 섹션에 있어야 합니다.
-마스크 부울
기본값: N
-도스타 부울
기본값: N
-스타넘 정수
기본값: 4
-아웃파일 아웃파일
- outseq seqoutall
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 edialigne 사용
