fpromlke - 클라우드 온라인

프로그램:

이름

fpromlk - 최대 가능성에 의한 단백질 계통 발생

개요

fpromlk -순서 시퀀스 -인트리파일 나무 [-n카테고리 정수] -율 정렬
-카테고리 속성 [-무게 속성] -길이 부울 [-모델 명부]
[-감마 명부] -감마 계수 뜨다 -n감마캣 정수 -불변계수 뜨다
-닌바캣 정수 -인바프랙 뜨다 -nhmm카테고리 정수 - 흠 속도 정렬
-흠확률 정렬 -adjsite 부울 -람다 뜨다 -njumble 정수
-씨 정수 -글로벌 부울 [- outgrno 정수] -아웃파일 아웃파일 [-송어 비녀장]
-아웃트리 파일 아웃파일 [-인쇄 데이터 부울] [-진전 부울] [-트리프린트 부울]
[-힙스테이트 부울]

fpromlk -도움

기술

fpromlk EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈"의 명령줄 프로그램입니다.
소프트웨어 제품군”). "계통 발생: 분자 서열" 명령 그룹의 일부입니다.

옵션

입력 섹션에 있어야 합니다.
-순서 시퀀스
하나 이상의 시퀀스 정렬을 포함하는 파일

-인트리파일 나무

-n카테고리 정수
기본값: 1

-율 정렬

-카테고리 속성

-무게 속성

추가 섹션에 있어야 합니다.
-길이 부울
기본값: N

-모델 명부
기본값: Jones-Taylor-Thornton

-감마 명부
기본값: n

-감마 계수 뜨다
기본값: 1

-n감마캣 정수
기본값: 1

-불변계수 뜨다
기본값: 1

-닌바캣 정수
기본값: 1

-인바프랙 뜨다
기본값: 0.0

-nhmm카테고리 정수
기본값: 1

- 흠 속도 정렬
기본값: 1.0

-흠확률 정렬
기본값: 1.0

-adjsite 부울
기본값: N

-람다 뜨다
기본값: 1.0

-njumble 정수

-씨 정수
기본값: 1

-글로벌 부울
기본값: N

- outgrno 정수

산출 섹션에 있어야 합니다.
-아웃파일 아웃파일

-송어 비녀장
기본값: Y

-아웃트리 파일 아웃파일

-인쇄 데이터 부울
기본값: N

-진전 부울
기본값: Y

-트리프린트 부울
기본값: Y

-힙스테이트 부울
기본값: N

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