이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 fuzztrane 명령입니다.
프로그램:
이름
fuzztran - 단백질 서열의 패턴 검색(번역됨)
개요
퍼즈트란 -순서 시퀄 -무늬 무늬 [-틀 명부] [-표 명부] -아웃파일 신고
퍼즈트란 -도움
기술
퍼즈트란 EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈"의 명령줄 프로그램입니다.
소프트웨어 제품군”). "Nucleic:Motifs,Protein:Motifs" 명령 그룹의 일부입니다.
옵션
입력 섹션에 있어야 합니다.
-순서 시퀄
-무늬 무늬
아미노산에 대한 표준 IUPAC 한 글자 코드가 사용됩니다. 기호 'x'는
아미노산이 허용되는 위치에 사용됩니다. 모호성은 다음으로 표시됩니다.
대괄호 '[
]'. 예: [ALT]는 Ala 또는 Leu 또는 Thr을 나타냅니다. 모호성도 다음과 같이 표시됩니다.
한 쌍의 중괄호 '{ }' 사이에 허용되지 않는 아미노산 나열
주어진 위치에서. 예: {AM}은 Ala 및 Met를 제외한 모든 아미노산을 나타냅니다.
패턴의 각 요소는 '-'로 인접 요소와 구분됩니다. (선택 사항
fuzztran) 패턴 요소의 반복은 다음과 같이 나타낼 수 있습니다.
괄호 사이에 숫자 값 또는 숫자 범위가 있는 요소입니다. 예:
x(3)은 xxx에 해당하고 x(2,4)는 xx 또는 xxx 또는 xxxx에 해당합니다. 언제
패턴은 시퀀스의 N 또는 C 터미널로 제한됩니다.
'<' 기호로 시작하거나 각각 '>' 기호로 끝납니다. 기간이 종료됩니다
패턴. (fuzztran에서 선택 사항). 예: [DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C
추가 섹션에 있어야 합니다.
-틀 명부
기본값: 1
-표 명부
산출 섹션에 있어야 합니다.
-아웃파일 신고
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 fuzztrane 사용
