마늘 - 클라우드 온라인

프로그램:

이름

마늘 - 분자 가시화 프로그램

개요

마늘 [참된 마늘 옵션] [X11 옵션] [파일 이름]

기술

이 매뉴얼 페이지는 간략하게 문서화 마늘, 무료 분자 시각화 프로그램.
HTML 형식 및 소스의 광범위한 문서는 마늘 집에서 찾을 수 있습니다.
<URL :http://garlic.mefos.hr/garlic/>. 물리적 위치: 대학교 의과대학
Osijek, 크로아티아, 유럽. 다수의 GNU/Linux 배포판을 위한 사전 컴파일된 패키지
사용할 수 있습니다. 여기에는 Debian, SuSE, Mandriva, Linspire 및 기타 여러 가지가 포함됩니다.
배포판. 로컬 사용을 위해 HTML 문서를 다운로드하고 압축을 풀 수 있습니다(권장
용법). 여기에서 프로그램에 대한 매우 짧은 설명과 명령 목록을 찾을 수 있습니다.
라인 옵션.

마늘 원래 조사를 위해 작성된 분자 시각화 프로그램입니다.
막 단백질. 이제 모든 단백질을 시각화하고 간단하게 편집하는 데 사용할 수 있습니다.
분자. 이 버전은 PDB 형식 버전 2.1을 인식합니다. 소스 파일을 참조하십시오 pdb_atom.c
이 형식에 대한 자세한 내용은

옵션

명령줄 옵션은 두 그룹으로 나눌 수 있습니다. 참된 (특정한) 마늘 옵션 과 X11
옵션. 옵션은 임의의 순서로 제공될 수 있습니다. 모든 옵션과 하드 코딩된 기본값은
아래 표에 나열되어 있습니다. 각 매개변수에 대해 명령줄을 통해 정의된 값은
가능한 경우 사용합니다. 그렇지 않은 경우에 정의된 값 .garlicrc 파일이 사용됩니다. 만약에 .garlicrc
파일을 사용할 수 없거나 이 파일에 해당 항목이 없으면 하드 코딩된
기본값이 사용됩니다. 샘플 .garlicrc 원래 패키지에 포함된 파일에는
하드 코딩된 기본값과 동일한 값입니다.

마늘 옵션 :
-시간, --도움
도움말을 인쇄하고 종료합니다.

-V, --번역
버전을 인쇄하고 종료합니다.

-NS, --등록하다
마늘 등록: 작성자에게 귀하의 사이트에 마늘이 설치되어 있고 누군가
이 프로그램을 사용할 예정입니다. 등록하면 작성자가 다음을 수행할 수 있습니다.
마늘의 지속적인 개발. 작성자가 다음에 대한 지원을 보장하도록 도울 수도 있습니다.
추가 개발. 이 옵션은 하나의 짧은 전자 메일 메시지를 보냅니다.
전자 메일 메시지 헤더와 'Hi!'라는 단어를[이메일 보호]>. 제발
이 프로그램을 사용하려면 마늘 -r을 실행하십시오. 에 연결되어 있지 않은 경우
다른 시스템에서 짧은 메시지를 보내는 것을 고려하십시오.

-노시스 좌표계 아이콘(왼쪽 위 모서리)을 숨깁니다.

-제어 불가
제어 창을 숨깁니다(오른쪽 위 모서리).

-스테레오
스테레오 이미지를 표시합니다.

-투수판 모드
기본 슬래브 모드. 사용 가능한 슬래브 모드는 꺼짐, 평면(기본값), 구형,
반구, 실린더 및 반 실린더.

-페이딩 모드
기본 색상 페이딩 모드. 사용 가능한 모드: 끄기, 평면(기본값), 구형,
반구, 실린더 및 반 실린더.

-같이 번호
기본 원자 그리기 스타일(하드 코딩된 기본값: 2).

-bs 번호
기본 본드 드로잉 스타일(하드 코딩된 기본값: 2).

-fs 번호
색이 바래는 표면의 기본 수입니다. 평행 평면, 동심 구 또는
동심 실린더는 페이딩 표면으로 사용될 수 있습니다. XNUMX개의 RGB 트리플렛은
각 표면에 할당됩니다. 표면의 간격이 균등합니다. 적어도 하나 그리고 최대
XNUMX을 정의해야 합니다. 최소 XNUMX가지 색상(왼쪽, 중간 및 오른쪽)은
보이는 각 원자에 할당됩니다. 이 세 가지 색상은
가장 가까운 페이딩 표면(들)과 할당된 색상에 상대적인 주어진 원자
이러한 표면. 색상은 선형 가중치를 사용하여 결합됩니다.

-lc 색
i번째 표면에 왼쪽 색상; i는 XNUMX에서 XNUMX 사이입니다. 색상 문자열
X11R5를 준수해야 합니다. 예를 들어 파란색은 파란색 또는 다음과 같이 정의될 수 있습니다.
RGB:0000/0000/FFFF 등. 예를 들어 -lc4 RGB:BBBB/8888/4444는 왼쪽 색상을 정의합니다.
지수가 XNUMX인 표면에서.

-mc 색
i번째 표면의 중간 색상.

-rc 색
i번째 표면에서 오른쪽 색상.

-PC, --인쇄 구성
구성 데이터를 인쇄하고 종료합니다.

-pcn 커서 이름을 stdout으로 출력하고 종료합니다.

-로그 로그 파일
명령 및 메시지를 로그 파일에 기록합니다. 파일은 현재
작업 디렉토리. 이것이 가능하지 않으면 사용자 홈에 로그 파일이 생성됩니다.
디렉토리.

X11 옵션 :
-디스플레이 이름 표시하기
연락할 X 서버.

-기하학 기하학
창 형상(기본값: 거의 전체 화면).

-bg 색
기본 창 배경색(기본값은 검은색).

-fg 색
기본 창 전경 색상(기본값: 흰색).

-fn 글꼴 이름
텍스트 글꼴; (기본값은 10x20입니다).

-tbg 색
텍스트 배경색(기본값은 검은색).

-tfg 색
텍스트 색상(기본값은 흰색).

-커서 커서 이름
커서 이름; 보다 /usr/include/X11/cursorfont.h 이름; XC_ 접두사를 제거하십시오.

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