이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 gt-chseqids 명령입니다.
프로그램:
이름
gt-chseqids - 매핑 파일에 제공된 매핑으로 시퀀스 ID를 변경합니다.
개요
gt chseqids [옵션...] mapping_file [GFF3_file]
기술
-종류 [예|아니요]
시퀀스 ID를 변경한 후 GFF3 기능을 정렬합니다(메모리 소비는
입력 파일 크기에 비례) (기본값: no)
-v [예|아니요]
장황하다(기본값: 아니오)
-o [파일 이름]
지정된 파일로 출력 리디렉션(기본값: 정의되지 않음)
-gzip [예|아니요]
gzip 압축 출력 파일 쓰기 (기본값: no)
-bzip2 [예|아니요]
bzip2 압축 출력 파일 쓰기 (기본값: no)
-힘 [예|아니요]
출력 파일에 강제 쓰기(기본값: no)
-도움
도움말 표시 및 종료
-번역
버전 정보 표시 및 종료
mapping_file의 파일 형식:
제공된 매핑 파일은 "chseqids"라는 매핑 테이블을 정의합니다. 그것은 매핑
GFF3_file에 지정된 시퀀스 영역 항목을 다른 이름으로 지정합니다. 다음과 같이 정의할 수 있습니다.
다음과 같습니다 :
chseqids = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
이 예를 사용하면 모든 시퀀스 ID "chr1"이 "seq1"로 변경되고 모든 시퀀스 ID가 "seqXNUMX"로 변경됩니다.
시퀀스 ID "chr2"에서 "seq2"까지.
보고 버그
버그 보고[이메일 보호]>.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인에서 gt-chseqids 사용
