HPCmapper - 클라우드에서의 온라인

프로그램:

이름

HPCmapper - 읽기 매핑을 위한 스크립트 생성

개요

HPC매퍼 [-vb] [-kINT(20)] [-wINT(6)] [-hINT(50)] [-tINT] [-MINT]
[-e더블(.85)][-lINT(1000)] [-sINT(100)] [-HINT] [-m선로]+ [-달INT(4)] [-도INT(25)]
참조:db|댐 읽기:db|댐 [첫 번째:정수[-마지막:정수]]

기술

HPC매퍼 일련의 내용으로 구성된 표준 출력에 UNIX 쉘 스크립트를 작성합니다.
DB의 모든 읽기를 효과적으로 "매핑"하는 명령 읽기 참조 세트에 대한
DB의 시퀀스 심판, 발견된 모든 로컬 정렬을 파일 시퀀스에 기록합니다.
ref.reads.1.las, ref.reads.2.las, 등등, 어디에서 ref.reads.k.las 정렬이 포함되어 있습니다
모두 사이 심판 그리고 k번째 블록은 읽기. 매개변수는 다음과 정확히 동일합니다.
for HPCdaligner(1) 저장 -k, -h및 -e 기본값은 적절하게 설정되어 있습니다.
매핑 및 -A 과 -I 옵션은 의미가 없습니다 심판 과 읽기 될 것으로 예상된다
고유한 데이터 세트.

정수인 경우 먼저 과 지난 누락된 경우 생성된 스크립트는 다음의 모든 블록에 대한 것입니다.
데이터베이스 읽기. 면 먼저 그때 존재해 HPC매퍼 비교하는 스크립트를 생성합니다.
블록 먼저 을 통하여 지난 (지난 = 먼저 존재하지 않는 경우) DAM에 대해 심판.

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