이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 mia-3dmotioncompica-nonrigid 명령입니다.
프로그램:
이름
mia-3dmotioncompica-nonrigid - 일련의 3D 이미지의 비선형 등록입니다.
개요
mia-3dmotioncompicica-nonrigid -i -o [옵션]
기술
mia-3dmotioncompicica-nonrigid 이 프로그램은 모션의 3D 버전을 구현합니다.
Wollny G, Kellman P, Santos A, Ledesma-Carbayo MJ,
"자유 호흡의 자동 움직임 보상은 다음을 통해 획득한 심근 관류 데이터입니다.
독립 구성 요소 분석을 사용하여", 의료 영상 분석, 2012,
DOI:10.1016/j.media.2012.02.004.
옵션
파일 IO
-i --in-file=(입력, 필수); 아이오
연속된 번호의 파일(nameXXXX.ext)의 입력 이미지 지원
파일 형식은 PLUGINS:3dimage/io를 참조하십시오.
-o --out-file=(출력, 필수); 아이오
출력 이미지 이름(정의하기 위해 %04d를 포함하는 C 형식 문자열)
파일 번호 지정) 지원되는 파일 형식은 PLUGINS:3dimage/io를 참조하세요.
--저장 참조=
참조 이미지를 저장하면 주어진 문자열이 파일 이름 기반으로 사용됩니다.
숫자 패턴은 입력 이미지를 따르며 출력 형식은 항상
'추억'
--저장-regs=
중간에 등록된 이미지를 저장하면, 주어진 문자열이 파일 이름으로 사용됩니다.
기본적으로 숫자 패턴은 입력 이미지를 따르며 출력 형식은 다음과 같습니다.
언제나 '비스타'
--저장-계수=
혼합 행렬을 텍스트 파일에 저장
--저장 기능=
특징 이미지를 PNG로 저장
도움말 & 정보
-V --verbose=경고
자세한 출력, 주어진 수준 및 더 높은 우선 순위의 메시지를 인쇄합니다.
가장 낮은 수준에서 시작하여 지원되는 우선 순위는 다음과 같습니다.
정보 - 낮은 수준의 메시지
더듬다 ‐ 함수 호출 추적
실패 - 테스트 실패 보고
경고 - 경고
오류 - 오류 보고
디버그 - 디버그 출력
메시지 - 일반 메시지
치명적인 - 치명적인 오류만 보고
--저작권
인쇄 저작권 정보
-h --도움말
이 도움말 인쇄
-? --용법
짧은 도움말 인쇄
--번역
버전 번호를 출력하고 종료
ICA
-C --구성요소=0
ICA 구성 요소 0 = 자동 추정ICA 구성 요소 0 = 자동
견적
--노노말라이즈
IC를 정규화하지 않음
--노-메인스트립
혼합 곡선에서 평균을 제거하지 마십시오.
-k --건너뛰기=0
시리즈 시작 부분에서 이미지를 건너뜁니다. 예를 들어 다른 이미지이기 때문에
형식은 시리즈 시작 부분에서 이미지를 건너뜁니다. 예를 들어
다른 양식이다
-m --max-ica-iter=400
ICA의 최대 반복 횟수ICA의 최대 반복 횟수
처리
--스레드=-1
처리에 사용할 최대 스레드 수, 이 수는 더 낮아야 합니다.
또는 시스템의 논리적 프로세서 코어 수와 동일합니다. (-1:
자동 추정). 처리에 사용할 최대 스레드 수, 이
number는 논리적 프로세서 코어 수보다 작거나 같아야 합니다.
기계. (-1: 자동 추정).
등록
-O --optimizer=gsl:opt=gd,단계=0.1
최소화에 사용되는 옵티마이저
-a --시작-c-속도=32
척추에서 계수를 시작하고 --c-rate-divider로 나눕니다.
스파인의 모든 패스스타트 계수는 --c-rate-divider로 나뉩니다.
모든 패스와 함께
--c-레이트-디바이더=4
각 패스에 대한 cofficient 비율 분배기 각 패스에 대한 cofficient 비율 분배기
-d --start-divcurl=20
시작 divcurl 가중치, 모든 passstart와 함께 --divcurl-divider로 나눕니다.
divcurl 가중치는 모든 패스에서 --divcurl-divider로 나뉩니다.
--divcurl-디바이더=4
divcurl weight scaling with each new passdivcurl weight scaling with each new passdivcurl weight scaling with each new
새로운 패스
-w --imagecost=이미지:무게=1,비용=ssd,
이미지 비용
-l --mg-레벨=3
다중 해상도 수준다중 해상도 수준
-P --통과=3
등록 패스등록 패스
플러그인 : 3d 이미지/io
분석하다 7.5 이미지 분석
인식되는 파일 확장자: .HDR, .hdr
지원되는 요소 유형:
부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트, 부호 있는 32비트, 부동 소수점 32비트,
부동 소수점 64비트
데이터 풀 내부 데이터 풀과의 가상 IO
인식되는 파일 확장자: .@
디컴 3D로서의 Dicom 이미지 시리즈
인식되는 파일 확장자: .DCM, .dcm
지원되는 요소 유형:
부호 있는 16비트, 부호 없는 16비트
HDF5 HDF5 3D 이미지 IO
인식되는 파일 확장자: .H5, .h5
지원되는 요소 유형:
이진 데이터, 부호 있는 8비트, 부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트, 부호 없는 16비트,
부호 있는 32비트, 부호 없는 32비트, 부호 있는 64비트, 부호 없는 64비트, 부동
소수점 32비트, 부동 소수점 64비트
인리아 인리아 이미지
인식되는 파일 확장자: .INR, .inr
지원되는 요소 유형:
부호 있는 8비트, 부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트, 부호 없는 16비트, 부호 있는 32
비트, 부호 없는 32비트, 부동 소수점 32비트, 부동 소수점 64비트
mhd VTK 구현을 사용하는 MetaIO 3D 이미지 IO(실험적).
인식되는 파일 확장자: .MHA, .MHD, .mha, .mhd
지원되는 요소 유형:
부호 있는 8비트, 부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트, 부호 없는 16비트, 부호 있는 32
비트, 부호 없는 32비트, 부동 소수점 32비트, 부동 소수점 64비트
멋진 NIFTI-1 3D 이미지 IO
인식되는 파일 확장자: .NII, .nii
지원되는 요소 유형:
부호 있는 8비트, 부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트, 부호 없는 16비트, 부호 있는 32
비트, 부호 없는 32비트, 부호 있는 64비트, 부호 없는 64비트, 부동 소수점 32
비트, 부동 소수점 64비트
vff VFF 태양 래스터 형식
인식되는 파일 확장자: .VFF, .vff
지원되는 요소 유형:
부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트
비스타 3D 뷰
인식되는 파일 확장자: .V, .VISTA, .v, .vista
지원되는 요소 유형:
이진 데이터, 부호 있는 8비트, 부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트, 부호 없는 16비트,
부호 있는 32비트, 부호 없는 32비트, 부동 소수점 32비트, 부동 소수점 64
비트
vti 3D 이미지 VTK-XML 입력 및 출력(실험).
인식되는 파일 확장자: .VTI, .vti
지원되는 요소 유형:
부호 있는 8비트, 부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트, 부호 없는 16비트, 부호 있는 32
비트, 부호 없는 32비트, 부동 소수점 32비트, 부동 소수점 64비트
vtk 3D VTK 이미지 레거시 입력 및 출력(실험).
인식되는 파일 확장자: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage
지원되는 요소 유형:
이진 데이터, 부호 있는 8비트, 부호 없는 8비트, 부호 있는 16비트, 부호 없는 16비트,
부호 있는 32비트, 부호 없는 32비트, 부동 소수점 32비트, 부동 소수점 64
비트
예
4-class ICA를 사용하여 imageXXXX.v 이미지에 제공된 관류 시리즈를 등록합니다.
견적. 처음에는 두 개의 이미지를 건너뛰고 최대 4개의 등록 스레드, nlopt를 사용합니다.
기반 최적화 프로그램을 사용하고 그렇지 않으면 기본 매개변수를 사용합니다. 결과를 다음 위치에 저장하세요.
등록된XXXX.v
mia-3dmotioncompica-nonrigid -i 이미지0000.v -o 등록%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300
저자
게르트 월니
저작권
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절대적으로 보증하지 않으며 GNU의 조건에 따라 재배포할 수 있습니다.
일반 공용 라이센스 버전 3(또는 그 이상). 자세한 내용은 다음을 사용하여 프로그램을 실행하십시오.
옵션 '--저작권'.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 mia-3dmotioncompica-nonrigid를 사용하세요.