이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 명령 mipe2dbSTS입니다.
프로그램:
이름
mipe2dbSTS.pl - dbSTS에 제출할 입력 파일을 생성합니다.
출력에 포함됨: dbSTS 제출의 STS 섹션
MIPE 버전 v1.1 기반
인수: * mipe_file
* 구성 파일
* (선택 사항) PCR ID 목록
구성 파일은 등호('=')로 구분된 키와 값을 포함하는 행으로 구성됩니다.
키는 NCBI 제출 파일의 소문자 이름으로 구성되며(웹사이트 dbSTS 참조)
해당 파일에 있는 필드의 밑줄 및 소문자 이름.
구성 파일에 다음 필드를 정의해야 합니다.
pub_title=
pub_authors=
소스 이름=
소스_유기체=
계속 이름=
계속 팩스=
계속 전화=
계속 이메일=
계속_실험실=
계속_inst=
cont_addr=
프로토콜 이름=
프로토콜_프로토콜=
버퍼 이름=
버퍼_버퍼=
sts_pcr_profile=
protocol_protocol, buffer_buffer 및 sts_pcr_profile의 경우 더 많은 줄이 필요합니다(예제 참조).
구성 파일의 예는 다음과 같습니다.
pub_title=닭 SNP의 유전적 매핑
pub_authors=Aerts,JA; Veenendaal,T.; 크루이만스,RPMA; 그로넨,MAM
source_name=닭 게놈 DNA
source_organism=갈루스 갈루스
cont_name=얀 에어츠
cont_fax=+31 317 483929
cont_tel=+31 317 483397
계속 이메일=[이메일 보호]
cont_lab=동물 사육 및 유전체학 그룹
cont_inst=바게닝겐 대학교
cont_addr=PO Box 338, 6700 AH Wageningen, 네덜란드
protocol_name=프로토콜_Aerts
protocol_protocol=템플릿: 30-60ng
protocol_protocol=프라이머: 각 4 uM
protocol_protocol=dNTPs: 각 200uM
protocol_protocol=Taq: 0.3 단위
protocol_protocol=볼륨: 12ul
buffer_name=Buffer_Aerts
buffer_buffer=MgCl2: 1.5mM
buffer_buffer=(NH4)2SO4: 20mM
buffer_buffer=Tris-HCl: 75mM
buffer_buffer=트윈 20: 0.01%(w/v)
버퍼_버퍼=pH: 8.8
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 mipe2dbSTS 사용
