이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 명령 pacoxph입니다.
프로그램:
이름
pacoxph - Cox의 비례 위험 모델을 사용하여 게놈 전체 연관 분석 수행
개요
파콕프 [ 명령 줄 옵션 ]
기술
파콕프 효율적인 방식으로 대치된 대규모 데이터 세트에 대해 선형 회귀를 실행합니다.
옵션
필수 명령 선 옵션
-NS, --페노 FILE
에서 표현형 데이터 읽기 FILE
-NS, --정보 FILE
다음에서 SNP 정보 읽기 FILE (예: MLINFO 파일).
-NS, --정량 FILE
SNP 예측기(예: MLDOSE/MLPROB) 파일 이름.
Optional 명령 선 옵션
-미디엄, --지도 FILE
각 SNP에 대한 염기쌍 위치를 포함하는 맵 파일 이름.
-N, --니드 NUMBER
분석할 사람의 수입니다.
-씨, --크롬 FILE
염색체(출력으로 전달됨).
-영형, --밖 FILE
출력 파일 이름(기본값은 회귀.out.txt ).
-에스, --건너뛰기 NUMBER
예측자(용량/확률) 파일에서 건너뛸 열 수(기본값은 2).
-NS, --특성 NUMBER
분석되는 특성의 수(기본값은 2)입니다.
-NS, --ngpreds NUMBER
마커당 예측자 열 수(기본값 1 = MLDOSE, 그렇지 않으면 MLPROB에 2 사용).
-ㅏ --분리 FILE
필드를 구분하는 문자입니다(기본값은 공백).
-NS, --점수
점수 테스트를 사용합니다.
-이자형, --머리가 없다
출력에서 헤더 행을 보고하지 마십시오.
-l --allcov
모든 공변량에 대한 추정치를 보고합니다(큰 출력!).
-NS, --상호 작용
SNP 분석과의 상호 작용에 사용할 공변량(기본값은 no
상호 작용, 0).
-케이, --상호작용만
처럼 --상호 작용 그러나 SNP와 상호 작용하는 공변량 없이(기본값은
상호 작용 없음, 0).
--도움 도움말을 인쇄합니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 pacoxph 온라인 사용
