이것은 BiomeNet.zip으로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 BiomeNet이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks를 사용하여 Linux 온라인에서 무료로 실행하려면 BiomeNet이라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
BiomeNet은 Linux 온라인에서 실행됩니다.
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기술
Metagenomics는 대사 기능을 할당할 수 있는 엄청난 수의 미생물 서열을 생성합니다. 이러한 데이터를 사용하여 지역사회 수준의 대사 차이를 추론하는 것은 적절한 통계 프레임워크가 부족하여 방해를 받습니다. 여기에서는 미생물 군집 간 대사 네트워크의 차별적 유병률을 추론하기 위한 BiomeNet(Bayesian 대사 네트워크 추론)이라는 새로운 계층적 베이지안 모델을 설명합니다. 커뮤니티 수준의 대사 상호 작용 구조를 추론하기 위해 BiomeNet은 효소 풍부 정보에 혼합 구성원 모델링 프레임워크를 적용합니다. 기본 아이디어는 모델의 혼합 구성 요소(대사 반응, 하위 네트워크 및 네트워크)가 모든 그룹(미생물군집 샘플)에서 공유되지만 혼합 비율은 그룹마다 다르다는 것입니다. 이 프레임워크를 통해 모델은 데이터 내의 중첩 구조를 캡처할 수 있습니다. BiomeNet은 각 메타게놈 샘플을 복잡한 대사 시스템(메타보시스템)의 혼합물로 모델링하는 데 있어 독특합니다.오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
C++, S/R
이는 https://sourceforge.net/projects/biomenet/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 시스템 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
