이것은 최신 릴리스가 BRIG-0.95-dist.zip으로 다운로드될 수 있는 BLAST Ring Image Generator라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 BLAST Ring Image Generator라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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BLAST 링 이미지 생성기
기술
BRIG는 게놈 어셈블리 데이터 처리에 중점을 두고 많은 게놈 간의 순환 비교를 표시할 수 있는 크로스 플랫폼(Windows/Mac/Unix) 응용 프로그램입니다.BRIG가 출판물의 수치를 생성하는 데 사용되는 경우 BRIG 논문을 인용하십시오: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator(BRIG): 단순 원핵생물 게놈 비교, BMC Genomics, 12:402. PMID: 21824423
기능
- 이미지는 중심 참조 시퀀스와 다른 시퀀스 간의 유사성을 동심원 고리로 보여줍니다.
- BRIG는 간단한 GUI를 통해 모든 BLAST 비교 및 파일 구문 분석을 자동으로 수행합니다.
- 초안 게놈에 대해 Contig 경계 및 읽기 범위를 표시할 수 있습니다. 사용자 정의 그래프 및 주석을 표시할 수 있습니다.
- 사용자 정의 유전자 세트를 입력으로 사용하여 BRIG는 완전한 게놈 세트, 초안 게놈 또는 조립되지 않은 원시 서열 데이터에서 유전자 존재, 부재, 절단 또는 서열 변이를 표시할 수 있습니다.
- BRIG는 또한 여러 샘플의 조립되지 않은 시퀀스 데이터에 있는 게놈 영역을 동시에 비교할 수 있도록 하는 SAM 형식 읽기 매핑 파일을 허용합니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
자바
이것은 https://sourceforge.net/projects/brig/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 우리의 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
