최신 릴리스를 cloudclientID.zip으로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 ChIP-RNA-seqPRO라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
ChIP-RNA-seqPRO라는 이름의 이 앱을 다운로드하여 온라인으로 실행하면 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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Linux 온라인에서 실행되는 ChIP-RNA-seqPRO
기술
ChIP-RNA-seqPRO: 비정상적인 전사체 스플라이싱 및 RNA 편집 부위와 관련된 후생유전학적 규제 완화 영역을 식별하기 위한 전략. 맞춤형 주석 라이브러리, 데모 데이터 입력 및 README 가이드와 함께 패키징된 실행 가능한 Python 스크립트.9/26 : v1.1 더 이상 '하위 집합'을 지원하지 않는 Python pandas에서 발생한 오류를 디버그하도록 MAIN_IV를 업데이트했습니다.
이 코드는 더 이상 여기에서 적극적으로 유지/업데이트되지 않습니다. 이제 후생유전학, 서열 변이 및 발현 데이터 세트의 비교 분석을 위한 클라우드 기반 리소스를 사용할 수 있습니다. 클라우드 기반 리소스 프로젝트인 Cloudomics를 방문하십시오. https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
기능
- 다양한 후성유전학(ChIPseq, MBDseq 등) 및 RNA 기반 시퀀싱 쌍을 이룬 샘플 데이터세트의 비교 분석을 위한 도구
- 이 도구 또는 주석 라이브러리를 사용하는 경우 Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila 참조를 포함하십시오. J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. 및 H. Ho T.(2015). 비정상적인 전사 스플라이싱 및 RNA 편집과 관련된 후생유전학적 규제 완화 영역을 식별하기 위한 생물정보학 전략. 생물 정보학 모델, 방법 및 알고리즘에 관한 국제 회의 절차, 163-170페이지. DOI: 10.5220/0005248001630170
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
유닉스 쉘, 파이썬
이것은 https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
