이것은 EigenMS.zip으로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 EigenMS라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
EigenMS라는 이름의 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하여 무료로 OnWorks와 함께 Linux에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
EigenMS, 온라인 Linux에서 실행
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기술
EigenMS는 R(및 Matlab의 이전 버전)에서 구현된 정규화 방법으로 시퀀스에서 사용해야 하는 두 가지 기능 세트로 제공됩니다.EigenMS.zip 파일(최신 버전)을 다운로드하십시오.
2017년 XNUMX월에 업로드된 최신 버전에는 단일 치료 그룹 정규화에 대한 버그 수정이 있습니다.
2015년부터는 스케일링이 생략되었습니다.
EigenMS는 SVD를 활용하여 데이터의 편향 경향을 감지하고 제거합니다. EigenMS는 알려진 요소와 알려지지 않은 요소의 영향을 제거하고 모든 -omic 플랫폼에 사용할 수 있습니다.
다음 두 논문에서 LC-MS/MS 및 대사체학에서의 유용성을 보여주었습니다.
1) PMID: 19602524. "특이값 분해를 사용한 상향식 MS 기반 단백질체학의 피크 강도 정규화".
Karpievitch YV, Taverner T, Adkins JN, Callister SJ, Anderson GA, Smith RD, Dabney AR.
생물정보학 2009
2) "EigenMS를 사용한 대사체학 데이터 정규화"
Karpievitch YV, Nikolic SB, Wilson R, Sharman JE, Edwards LM.
플로스원 2014
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
매트랩, S/R
https://sourceforge.net/projects/eigenms/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 우리의 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
