FusionCatcher라는 Linux 앱으로, Linux 온라인에서 실행 가능하며 최신 버전은 fusioncatcher_v1.20.zip 파일로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서도 온라인으로 실행할 수 있습니다.
FusionCatcher라는 앱을 온라인에서 무료로 다운로드하여 OnWorks와 함께 Linux에서 온라인으로 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
Linux에서 온라인으로 실행되는 FusionCatcher
Ad
기술
FusionCatcher는 질병이 있는 샘플의 RNA-seq 데이터(Solexa 및 HiSeq와 같은 Illumina NGS 플랫폼의 paired-end 읽기)에서 신규/알려진 체세포 융합 유전자, 전위 및 키메라를 검색합니다.FusionCatcher의 목표는 다음과 같습니다.
- 후보 융합 유전자를 찾기 위한 매우 우수한 검출률,
- 사용이 매우 간편함(즉, FusionCatcher를 실행하기 위해 데이터베이스 및 생물정보학에 대한 사전 지식이 필요하지 않음),
- IGH 융합, CIC 융합, DUX4 융합, CRLF2 융합, TCF3 융합 등과 같은 까다로운 융합 유전자의 매우 우수한 검출
- 가능한 한 자동(예: 자동으로 어댑터 찾기, 입력 읽기 길이에 따라 자동으로 엑손-엑손 접합 구축 등) 융합 유전자를 찾기 위한 최상의 검출 속도를 제공합니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
Python
https://sourceforge.net/projects/fusioncatcher/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
