이것은 최신 릴리스를 htdpinstaller.exe로 다운로드할 수 있는 High-Throughput Tabular Data Processor라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 High-Throughput Tableular Data Processor라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
Ad
고처리량 테이블 형식 데이터 프로세서
기술
HTDP(HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR)는 대량 병렬 시퀀싱 또는 마이크로어레이와 같은 높은 처리량 기술로 인해 대용량 텍스트 파일에서 데이터 탐색 및 축소 작업을 용이하게 하기 위한 Java 응용 프로그램입니다. 이 소프트웨어는 마이크로어레이 및 심층 병렬 시퀀싱 데이터에 최적화되어 있지만 모든 문자로 구분된 표 데이터 세트를 수용할 수 있습니다. HTDP는 또한 VCF(Variant Call Format) 파일 버전을 가져오고 처리하고 변환할 수 있습니다. 4.0, 4.1 및 4.2(http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP는 빠른 필터링 기능을 제공하며 단일 또는 다중 입력 파일로 구성된 데이터를 처리할 수 있습니다.
인용: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK 등 (2018) 높은 처리량 표 형식 데이터 프로세서 – 대규모 데이터 세트를 처리하기 위한 플랫폼 독립적인 그래픽 도구입니다. PLoS ONE 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
기능
- 모든 문자 구분 열 데이터(예: BED, GFF, GTF, WIG, VCF)에서 작동
- 테이블 형식 데이터 파일을 수직 및 수평으로 병합
- 게놈 위치 또는 공통 열을 사용하여 테이블 형식 데이터 파일 병합
- 무제한 필터링 및 데이터 축소 기능
- 형식과 내용이 다른 파일을 동시에 분석할 수 있습니다.
프로그래밍 언어
자바
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/htdp/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
