이것은 SSRs.zip으로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 iMSAT라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
iMSAT라는 이 앱을 다운로드하여 온라인으로 실행하면 OnWorks를 통해 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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iMSAT는 Linux 온라인에서 실행됩니다.
기술
iMSAT는 vcf2MSAT 프로그램의 전체 업데이트를 나타냅니다. 이 명령줄 Python 프로그램을 사용하면 사용자는 SAM 및 BAM 도구와 .fasta 정렬 파일을 사용하여 생성된 다형성 데이터를 사용하여 다형성 미세 위성 마커(MSAT 또는 STR)를 검색할 수 있습니다. iMSAT는 이전 프로그램처럼 단순 반복 영역이 아닌 다형성 제작자를 식별함으로써 식별할 수 있는 다형성 MSAT의 속도를 크게 높여 연구자의 귀중한 시간과 비용을 절약합니다. 방문하다 http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract iMSAT의 유용성을 설명하는 PDF 기사를 보려면 이 기사를 다음과 같이 인용하십시오. Andersen and Mills: iMSAT: 바코드가 있는 Illumina 라이브러리를 사용하는 미세 위성 유전자좌 개발에 대한 새로운 접근 방식. BMC 유전체학 2014 15:858.특징
- 다형성 미세위성 식별
- 일루미나 시퀀싱
- 게놈 분석
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
Python
이는 https://sourceforge.net/projects/imsat/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 시스템 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
