이것은 SWAPHI-LS라는 이름의 Linux 앱입니다. 최신 릴리스를 swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행하기 위한 Xeon Phi 클러스터의 정렬입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 실행하여 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
SWAPHI-LS: 온라인 Linux에서 실행되도록 Xeon Phi 클러스터에 정렬
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기술
Intel Xeon Phi 클러스터를 활용하여 긴 DNA 서열의 정렬을 가속화하는 최초의 병렬 Smith-Waterman 알고리즘입니다. 이 알고리즘은 C++(SIMD 내장 확장 세트 포함), OpenMP 및 MPI로 작성되었습니다. 성능 평가 결과 우리의 알고리즘은 매우 안정적인 성능을 달성했으며 단일 Xeon Phi에서 최대 30.1GCUPS의 성능을, 호스트를 공유하는 111.4개의 Xeon Phi에서 최대 XNUMXGCUPS의 성능을 제공하는 것으로 나타났습니다.오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
콘솔/터미널, 명령줄
프로그래밍 언어
C + +
이것은 https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
