VarScan.v2.3.9.jar로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 VarScan이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 VarScan이라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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바스캔
기술
대규모 병렬 시퀀싱에서 변이 탐지. 하나의 샘플에 대해 SNP, indel 및 컨센서스 유전자형을 호출합니다. 종양-정상 쌍의 경우 각 변이체를 생식계열, 체세포 또는 LOH로 추가 분류하고 체세포 복제 수 변화도 감지합니다. 최신 버전은 Github에서 사용할 수 있습니다.
특징
- SAMtools 파일업 파일에서 SNP 및 Indel 호출
- 적용 범위, 읽기 깊이, 변형 빈도 및 기본 품질별로 변형을 필터링합니다.
- 종양-정상 쌍의 체세포 상태(체세포, 생식계열, LOH) 결정
- 두 변형 목록을 비교, 병합 및 교차합니다.
- 일련의 대상 위치 또는 대상 지역에 대한 변형 호출을 제한합니다.
- 비상업적 용도의 경우 무료입니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
자바
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/varscan/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
