Name: Linux에서 실행되는 ViralFusionSeq [VFS] Linux용 온라인 다운로드
Brand: OnWorks
SKU: 0063b0b3d050587340a07b3c09108d8c
Availability: OnlineOnly
Rating: 4.84 (1544 reviews)

이것은 최신 릴리스를 vfs-2016-08-17.r2.tar.gz로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 ViralFusionSeq [VFS]라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.

ViralFusionSeq [VFS]라는 이름의 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 실행하여 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행하십시오.

이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.

- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.

- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.

- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.

- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.

- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.

- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.

App 다운로드 우분투에서 실행 페도라에서 실행 Windows Sim에서 실행 MACOS Sim에서 실행

스크린 샷

웹 도구 또는 웹 앱 ViralFusionSeq [VFS]를 다운로드하여 Linux에서 온라인으로 실행

온라인에서 Linux에서 실행되는 ViralFusionSeq [VFS]

기술

VFS는 Ubuntu/Debian 시스템에서 완전히 테스트되었습니다.

** 공지사항 1**: VFS는 Virus-Clip보다 우수합니다. https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/files/VFS.vs.Virus-Clip.pdf/download

2016년 현재 VFS는 NIH HPC 시스템에서 사용할 수 있는 유일한 바이러스 통합 도구입니다.
https://hpc.nih.gov/apps/ViralFusionSeq/

ViralFusionSeq(VFS)는 단일 염기 분해능에서 바이러스 통합 이벤트를 발견하고 융합 전사체를 재구성하기 위한 다목적 HTS(고처리량 시퀀싱) 도구입니다.

VFS는 바이러스-인간 융합 이벤트를 발견하고 주석을 달기 위해 소프트 클리핑 정보, 읽기 쌍 분석 및 대상 de novo 어셈블리를 결합합니다.

간단하지만 효과적인 경험적 통계 모델은 융합 중단점의 품질을 평가하는 데 사용됩니다.

최소한의 사용자 정의 매개변수가 필요합니다.

VFS의 사용 설명서 및 설치 가이드가 포함된 소스 코드는 sourceforge의 "파일" 섹션에서 사용할 수 있습니다.

인용 : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

특징

RNA-Seq 및 DNA-Seq 데이터를 사용하여 적용 가능하고 완전히 테스트됨
클리핑된 시퀀스(CS) 및 페어드 엔드(RP) 정보를 모두 활용하여 바이러스 통합 발견
CS 및 RP 정보를 이용한 융합 전사체 서열 재구성

오디언스 (Audience)

과학/연구

프로그래밍 언어

펄

이것은 https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.

ViralFusionSeq [VFS]는 L용 Linux 온라인 다운로드에서 실행됩니다.

스크린 샷

기술

특징

오디언스 (Audience)

프로그래밍 언어