BLAST Ring Image Generator๋ผ๋ ์ด๋ฆ์ Windows ์ฑ์ผ๋ก ์ต์ ๋ฆด๋ฆฌ์ค๋ฅผ BRIG-0.95-dist.zip์ผ๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ ์ ์์ต๋๋ค. ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ฉ ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์ธ OnWorks์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
OnWorks์ ํจ๊ป BLAST Ring Image Generator๋ผ๋ ์ด ์ฑ์ ๋ฌด๋ฃ๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ์ญ์์ค.
์ด ์ฑ์ ์คํํ๋ ค๋ฉด ๋ค์ ์ง์นจ์ ๋ฐ๋ฅด์ธ์.
- 1. ์ด ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ PC์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ต๋๋ค.
- 2. ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ ์ ๋ ฅํฉ๋๋ค.
- 3. ์ด๋ฌํ ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์์์ ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
- 4. ์ด ์น์ฌ์ดํธ์์ ๋ชจ๋ OS OnWorks ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํ์ง๋ง ๋ ๋์ Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํฉ๋๋ค.
- 5. ๋ฐฉ๊ธ ์์ํ OnWorks Windows OS์์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ผ๋ก ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX๋ก ์ด๋ํฉ๋๋ค.
- 6. ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์ค์นํฉ๋๋ค.
- 7. Linux ๋ฐฐํฌ ์ํํธ์จ์ด ์ ์ฅ์์์ Wine์ ๋ค์ด๋ก๋ํฉ๋๋ค. ์ค์น๊ฐ ์๋ฃ๋๋ฉด ์ฑ์ ๋ ๋ฒ ํด๋ฆญํ์ฌ Wine๊ณผ ํจ๊ป ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค. ์ธ๊ธฐ ์๋ Windows ํ๋ก๊ทธ๋จ ๋ฐ ๊ฒ์์ ์ค์นํ๋ ๋ฐ ๋์์ด ๋๋ Wine์ ํตํ ๋ฉ์ง ์ธํฐํ์ด์ค์ธ PlayOnLinux๋ฅผ ์ฌ์ฉํด ๋ณผ ์๋ ์์ต๋๋ค.
Wine์ Linux์์ Windows ์ํํธ์จ์ด๋ฅผ ์คํํ๋ ๋ฐฉ๋ฒ์ด์ง๋ง Windows๊ฐ ํ์ํ์ง ์์ต๋๋ค. Wine์ ๋ชจ๋ Linux ๋ฐ์คํฌํ์์ ์ง์ Windows ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์คํํ ์ ์๋ ์คํ ์์ค Windows ํธํ์ฑ ๊ณ์ธต์ ๋๋ค. ๋ณธ์ง์ ์ผ๋ก Wine์ Windows๊ฐ ํ์ํ์ง ์๊ณ ๋ชจ๋ Windows ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์คํํ ์ ์๋๋ก Windows๋ฅผ ์ฒ์๋ถํฐ ์ถฉ๋ถํ ๋ค์ ๊ตฌํํ๋ ค๊ณ ํฉ๋๋ค.
์คํฌ๋ฆฐ ์ท
Ad
BLAST ๋ง ์ด๋ฏธ์ง ์์ฑ๊ธฐ
๊ธฐ์
BRIG๋ ๊ฒ๋ ์ด์ ๋ธ๋ฆฌ ๋ฐ์ดํฐ ์ฒ๋ฆฌ์ ์ค์ ์ ๋๊ณ ๋ง์ ๊ฒ๋ ๊ฐ์ ์ํ ๋น๊ต๋ฅผ ํ์ํ ์ ์๋ ํฌ๋ก์ค ํ๋ซํผ(Windows/Mac/Unix) ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ๋๋ค.BRIG๊ฐ ์ถํ๋ฌผ์ ์์น๋ฅผ ์์ฑํ๋ ๋ฐ ์ฌ์ฉ๋๋ ๊ฒฝ์ฐ BRIG ๋ ผ๋ฌธ์ ์ธ์ฉํ์ญ์์ค: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator(BRIG): ๋จ์ ์ํต์๋ฌผ ๊ฒ๋ ๋น๊ต, BMC Genomics, 12:402. PMID: 21824423
ํน์ง
- ์ด๋ฏธ์ง๋ ์ค์ฌ ์ฐธ์กฐ ์ํ์ค์ ๋ค๋ฅธ ์ํ์ค ๊ฐ์ ์ ์ฌ์ฑ์ ๋์ฌ์ ๊ณ ๋ฆฌ๋ก ๋ณด์ฌ์ค๋๋ค.
- BRIG๋ ๊ฐ๋จํ GUI๋ฅผ ํตํด ๋ชจ๋ BLAST ๋น๊ต ๋ฐ โโํ์ผ ๊ตฌ๋ฌธ ๋ถ์์ ์๋์ผ๋ก ์ํํฉ๋๋ค.
- ์ด์ ๊ฒ๋์ ๋ํด Contig ๊ฒฝ๊ณ ๋ฐ ์ฝ๊ธฐ ๋ฒ์๋ฅผ ํ์ํ ์ ์์ต๋๋ค. ์ฌ์ฉ์ ์ ์ ๊ทธ๋ํ ๋ฐ ์ฃผ์์ ํ์ํ ์ ์์ต๋๋ค.
- ์ฌ์ฉ์ ์ ์ ์ ์ ์ ์ธํธ๋ฅผ ์ ๋ ฅ์ผ๋ก ์ฌ์ฉํ์ฌ BRIG๋ ์์ ํ ๊ฒ๋ ์ธํธ, ์ด์ ๊ฒ๋ ๋๋ ์กฐ๋ฆฝ๋์ง ์์ ์์ ์์ด ๋ฐ์ดํฐ์์ ์ ์ ์ ์กด์ฌ, ๋ถ์ฌ, ์ ๋จ ๋๋ ์์ด ๋ณ์ด๋ฅผ ํ์ํ ์ ์์ต๋๋ค.
- BRIG๋ ๋ํ ์ฌ๋ฌ ์ํ์ ์กฐ๋ฆฝ๋์ง ์์ ์ํ์ค ๋ฐ์ดํฐ์ ์๋ ๊ฒ๋ ์์ญ์ ๋์์ ๋น๊ตํ ์ ์๋๋ก ํ๋ SAM ํ์ ์ฝ๊ธฐ ๋งคํ ํ์ผ์ ํ์ฉํฉ๋๋ค.
์ค๋์ธ์ค (Audience)
๊ณผํ/์ฐ๊ตฌ
ํ๋ก๊ทธ๋๋ฐ ์ธ์ด
์๋ฐ
์ด๊ฒ์ https://sourceforge.net/projects/brig/์์๋ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋๋ค. ์ฐ๋ฆฌ์ ๋ฌด๋ฃ ์ด์ ์ฒด์ ์ค ํ๋์์ ๊ฐ์ฅ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ผ๋ก ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๊ธฐ ์ํด OnWorks์์ ํธ์คํ ๋์์ต๋๋ค.