이것은 최신 릴리스를 gen3d.cpp로 다운로드할 수 있는 Gen3D라는 Windows 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks가 포함된 Gen3D라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행해 보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 모든 OS OnWorks 온라인 에뮬레이터를 시작하지만 더 나은 Windows 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Windows OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 애플리케이션을 다운로드하여 설치합니다.
- 7. Linux 배포 소프트웨어 저장소에서 Wine을 다운로드합니다. 설치가 완료되면 앱을 두 번 클릭하여 Wine과 함께 실행할 수 있습니다. 인기 있는 Windows 프로그램 및 게임을 설치하는 데 도움이 되는 Wine을 통한 멋진 인터페이스인 PlayOnLinux를 사용해 볼 수도 있습니다.
Wine은 Linux에서 Windows 소프트웨어를 실행하는 방법이지만 Windows가 필요하지 않습니다. Wine은 모든 Linux 데스크탑에서 직접 Windows 프로그램을 실행할 수 있는 오픈 소스 Windows 호환성 계층입니다. 본질적으로 Wine은 Windows가 필요하지 않고 모든 Windows 응용 프로그램을 실행할 수 있도록 Windows를 처음부터 충분히 다시 구현하려고 합니다.
스크린 샷
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Gen3D
기술
Gen3D는 XNUMX차원 게놈 및 염색체 모델을 결정하도록 설계된 응용 프로그램입니다. 염색체 접촉 데이터를 사용하여 XNUMX차원 형태를 구성합니다. 이 방법은 염색체 접촉의 많은 부분을 만족시키는 XNUMX차원 염색체 모델을 생성할 수 있습니다.
이 소프트웨어는 미국 미주리 대학교 컴퓨터 공학부의 Jianlin Cheng 교수의 생물정보학, 데이터 마이닝 및 기계 학습 연구실에서 개발되었습니다. 이 프로젝트는 국립 과학 재단(보조금 번호 DBI1149224)의 지원을 받습니다.
연구에 Gen3D를 사용하는 경우 다음을 인용하십시오.
Nowotny, Jackson, Sharif Ahmed, Lingfei Xu, Oluwatosin Oluwadare, Hannah Chen, Noelan Hensley, Tuan Trieu, Renzhi Cao 및 Jianlin Cheng. "염색체 접촉 데이터에서 인간 염색체의 16차원 모델을 반복적으로 재구성합니다." BMC 생물정보학 1, no. 2015(338): XNUMX.
특징
- Hi-C 기술을 사용하여 획득한 염색체 접촉 데이터 사용
- 염색체 접촉 데이터에서 3D 구조 게놈 및 염색체 모델 구축
- 확률적 접근을 사용하여 좌표 초기화
- 히트 맵 매트릭스에서 만족된 접촉을 나타내는 새로운 방법
- 장거리 및 단거리 접촉을 파악하기 위한 점수 체계
- 기존의 다른 방법과 비교하여 게놈 특징 검증
오디언스 (Audience)
과학/연구, 공학
프로그래밍 언어
C + +
카테고리
https://sourceforge.net/projects/gen3d/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
