์ด๊ฒ์ ์ต์ ๋ฆด๋ฆฌ์ค๋ฅผ ipig_r5.zip์ผ๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ ์ ์๋ Linux ์จ๋ผ์ธ์ ํตํด Windows ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํ๋๋ iPiG๋ผ๋ Windows ์ฑ์ ๋๋ค. ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ฉ ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์ธ OnWorks์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
iPiG๋ผ๋ ์ด ์ฑ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๋ฉด OnWorks๋ฅผ ํตํด ๋ฌด๋ฃ๋ก Linux๋ฅผ ํตํด Windows์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
์ด ์ฑ์ ์คํํ๋ ค๋ฉด ๋ค์ ์ง์นจ์ ๋ฐ๋ฅด์ธ์.
- 1. ์ด ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ PC์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ต๋๋ค.
- 2. ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ ์ ๋ ฅํฉ๋๋ค.
- 3. ์ด๋ฌํ ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์์์ ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
- 4. ์ด ์น์ฌ์ดํธ์์ ๋ชจ๋ OS OnWorks ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํ์ง๋ง ๋ ๋์ Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํฉ๋๋ค.
- 5. ๋ฐฉ๊ธ ์์ํ OnWorks Windows OS์์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ผ๋ก ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX๋ก ์ด๋ํฉ๋๋ค.
- 6. ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์ค์นํฉ๋๋ค.
- 7. Linux ๋ฐฐํฌ ์ํํธ์จ์ด ์ ์ฅ์์์ Wine์ ๋ค์ด๋ก๋ํฉ๋๋ค. ์ค์น๊ฐ ์๋ฃ๋๋ฉด ์ฑ์ ๋ ๋ฒ ํด๋ฆญํ์ฌ Wine๊ณผ ํจ๊ป ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค. ์ธ๊ธฐ ์๋ Windows ํ๋ก๊ทธ๋จ ๋ฐ ๊ฒ์์ ์ค์นํ๋ ๋ฐ ๋์์ด ๋๋ Wine์ ํตํ ๋ฉ์ง ์ธํฐํ์ด์ค์ธ PlayOnLinux๋ฅผ ์ฌ์ฉํด ๋ณผ ์๋ ์์ต๋๋ค.
Wine์ Linux์์ Windows ์ํํธ์จ์ด๋ฅผ ์คํํ๋ ๋ฐฉ๋ฒ์ด์ง๋ง Windows๊ฐ ํ์ํ์ง ์์ต๋๋ค. Wine์ ๋ชจ๋ Linux ๋ฐ์คํฌํ์์ ์ง์ Windows ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์คํํ ์ ์๋ ์คํ ์์ค Windows ํธํ์ฑ ๊ณ์ธต์ ๋๋ค. ๋ณธ์ง์ ์ผ๋ก Wine์ Windows๊ฐ ํ์ํ์ง ์๊ณ ๋ชจ๋ Windows ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์คํํ ์ ์๋๋ก Windows๋ฅผ ์ฒ์๋ถํฐ ์ถฉ๋ถํ ๋ค์ ๊ตฌํํ๋ ค๊ณ ํฉ๋๋ค.
์คํฌ๋ฆฐ ์ท
Ad
iPiG๋ Linux ์จ๋ผ์ธ์ ํตํด Windows ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํ๋ฉ๋๋ค.
๊ธฐ์
iPiG๋ ์ง๋ ๋ถ์๋ฒ(MS)์์ ํฉํ์ด๋ ์คํํธ๋ผ ์ผ์น(PSM)์ ํตํฉ์ ๋ชฉํ๋ก ํฉ๋๋ค.UCSC ๊ฒ๋ ๋ธ๋ผ์ฐ์ ์ ๊ฐ์ ๊ฒ๋ ๋ธ๋ผ์ฐ์ ์์ ์ ๊ณตํ๋ ๊ฒ๋ ์๊ฐํ์ ๋ํ ํฉํฐ๋ ์๋ณ(http://genome.ucsc.edu/).
iPiG๋ MS ํ์ค ํ์ mzIdentML(*.mzid) ๋๋ ํ ์คํธ ํ์์์ PSM์ ๊ฐ์ ธ์ ๊ฒ๋ ๋ธ๋ผ์ฐ์ ๋ก ์ฝ๊ฒ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ๊ฒ๋ ํธ๋ ํ์(BED ๋ฐ GFF3 ํ์ผ)์ผ๋ก ๊ฒฐ๊ณผ๋ฅผ ์ ๊ณตํฉ๋๋ค.
iPiG ๋ฐ ๊ธฐ๋ฅ์ ๋ํ ์์ธํ ๋ด์ฉ์ ๋ค์์ ์ฐธ์กฐํ์ญ์์ค.
"iPiG: ํฉํฐ๋ ์คํํธ๋ผ ์ผ์น๋ฅผ ๊ฒ๋ ๋ธ๋ผ์ฐ์ ์๊ฐํ์ ํตํฉ"
Mathias Kuhring๊ณผ Bernhard Y. Renard
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
์ค๋์ธ์ค (Audience)
๊ณผํ/์ฐ๊ตฌ
์ฌ์ฉ์ ์ธํฐํ์ด์ค
์๋ฐ ์ค์, ์ฝ์/ํฐ๋ฏธ๋
ํ๋ก๊ทธ๋๋ฐ ์ธ์ด
์๋ฐ
์ด๊ฒ์ https://sourceforge.net/projects/ipig/์์๋ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋๋ค. ๋ฌด๋ฃ ์ด์ ์ฒด์ ์ค ํ๋์์ ๊ฐ์ฅ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ผ๋ก ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๊ธฐ ์ํด OnWorks์์ ํธ์คํ ๋์์ต๋๋ค.