이것은 최신 릴리스를 Javamony.jar로 다운로드할 수 있는 Javamony라는 Windows 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks가 포함된 Javamony라는 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행해 보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 모든 OS OnWorks 온라인 에뮬레이터를 시작하지만 더 나은 Windows 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Windows OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 애플리케이션을 다운로드하여 설치합니다.
- 7. Linux 배포 소프트웨어 저장소에서 Wine을 다운로드합니다. 설치가 완료되면 앱을 두 번 클릭하여 Wine과 함께 실행할 수 있습니다. 인기 있는 Windows 프로그램 및 게임을 설치하는 데 도움이 되는 Wine을 통한 멋진 인터페이스인 PlayOnLinux를 사용해 볼 수도 있습니다.
Wine은 Linux에서 Windows 소프트웨어를 실행하는 방법이지만 Windows가 필요하지 않습니다. Wine은 모든 Linux 데스크탑에서 직접 Windows 프로그램을 실행할 수 있는 오픈 소스 Windows 호환성 계층입니다. 본질적으로 Wine은 Windows가 필요하지 않고 모든 Windows 응용 프로그램을 실행할 수 있도록 Windows를 처음부터 충분히 다시 구현하려고 합니다.
스크린 샷
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기술
성공하지 못한 Pysimony(https://sourceforge.net/projects/pysimony/), 같은 단호한 학생이 계통 발생 문제에 대해 또 다른 시도를 합니다.
Javamony는 다음과 같이 호출됩니다.
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [random / stepwise (starting tree)] [부트스트랩 수] [외군 분류군 #1] [외군 분류군 #2] ...
경쟁적인 계통 발생 추론 프로그램이 아니라 Javamony는 계통 발생의 근본적인 문제를 해결하고 해결하는 방법을 배우면서 Java 언어를 습득할 수 있는 기회입니다. 따라서 내 교육상의 이점을 위해 모든 코드는 원본입니다. 물론 많은 실수도 있을 수 있습니다.
나는 Pysimony와 마찬가지로 Javamony를 배포합니다. Javamony가 다른 사람에게 교육적 가치가 있거나 적어도 모호하게는 재미있기를 바라는 마음입니다.
향후 기능은 다음과 같습니다.
- 아미노산 서열 지원
- 추가 파일 형식 지원(예: Nexus)
- 멀티스레딩
- 추가 채점 방법(예: 최대 가능성)
특징
- 최대한의 절제력을 사용합니다
- FASTA 입력 파일 읽기(DNA만 해당)
- 사용자 설정 외부 그룹
- 무작위 및 단계적 추가 시작 트리
- SPR(subtree pruning and regrafting) 트리 검색 사용
- 부트스트랩 수행
- 부트스트랩 지원 및 분기 길이를 사용하여 표준 Newick 형식을 출력합니다.
- 부트스트랩 지원으로 최종 트리를 그립니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구, 교육
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
자바
카테고리
https://sourceforge.net/projects/javamony/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 우리의 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
