ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ fasta2DB ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
fasta2DB - ສ້າງຖານຂໍ້ມູນ Dazzler ຈາກໄຟລ໌ fasta
ສະຫຼຸບສັງລວມ
fasta2DB [-v] ເສັ້ນທາງ: db {-fເອກະສານ | ວັດສະດຸປ້ອນ: ໄວ ...}
ລາຍລະອຽດ
ສ້າງຖານຂໍ້ມູນເບື້ອງຕົ້ນ, ຫຼືເພີ່ມໃສ່ຖານຂໍ້ມູນທີ່ມີຢູ່ແລ້ວ, ບັນຊີລາຍຊື່ຂອງໄຟລ໌ .fasta
ປະຕິບັດຕາມການໂຕ້ຖຽງຊື່ຖານຂໍ້ມູນ, ຫຼືຖ້າຫາກວ່າ -f ທາງເລືອກແມ່ນຖືກນໍາໃຊ້, ບັນຊີລາຍຊື່ຂອງ .fasta
ໄຟລ໌ໃນ ເອກະສານ. ໄຟລ໌ .fasta ທີ່ໃຫ້ນັ້ນສາມາດຖືກເພີ່ມໃສ່ DB ໄດ້ເທື່ອດຽວເທົ່ານັ້ນ (ອັນນີ້ຖືກກວດສອບໂດຍ
ຄໍາສັ່ງ). ສ່ວນຫົວ .fasta ຈະຕ້ອງຢູ່ໃນຮູບແບບ "Pacbio" (ເຊັ່ນ: ຜົນຜະລິດຂອງ
ເຄື່ອງມື Pacbio ຫຼືຂອງພວກເຮົາ dextract(1) ໂຄງການ) ແລະດີ, ໄລຍະຫ່າງກໍາມະຈອນ, ແລະຄຸນນະພາບການອ່ານ
ຖືກສະກັດອອກຈາກສ່ວນຫົວແລະເກັບໄວ້ດ້ວຍບັນທຶກການອ່ານແຕ່ລະຄົນ. ຖ້າຫາກວ່າໄຟລ໌ແມ່ນ
ເພີ່ມໃສ່ຖານຂໍ້ມູນທີ່ມີຢູ່ແລ້ວ, ແລະການຕັ້ງຄ່າການແບ່ງປັນຂອງ DB ໄດ້ຖືກຕັ້ງໄວ້ແລ້ວ
(ເບິ່ງ DBsplit(1)), ຫຼັງຈາກນັ້ນການແບ່ງສ່ວນຂອງຖານຂໍ້ມູນໄດ້ຖືກປັບປຸງເພື່ອປະກອບມີໃຫມ່
ຂໍ້ມູນ.
ໃຊ້ fasta2DB ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
