ນີ້ແມ່ນ command fox ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
fox - ການກໍານົດໂຄງສ້າງ ab-initio ຈາກຂໍ້ມູນ diffraction
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ຈິ້ງຈອກ [ທາງເລືອກໃນການ] [file.xml]
ລາຍລະອຽດ
ໄດ້ ຈິ້ງຈອກ (Free Objects for Crystallography) ໂຄງການໄດ້ຖືກສ້າງຂຶ້ນສໍາລັບການ ab initio crystal
ການແກ້ໄຂໂຄງສ້າງຈາກຂໍ້ມູນການບິດເບືອນ. ລັກສະນະທີ່ຫນ້າສົນໃຈທີ່ສຸດຂອງມັນສໍາລັບ ab initio
ການກໍານົດໂຄງສ້າງແມ່ນ:
* ລາຍລະອຽດ versatile ຂອງເນື້ອໃນໄປເຊຍກັນ;
* ການແກ້ໄຂອັດຕະໂນມັດສໍາລັບຕໍາແຫນ່ງພິເສດແລະປະລໍາມະນູຮ່ວມກັນລະຫວ່າງ polyhedra;
* ຄວາມສາມາດໃນການນໍາໃຊ້ຮູບແບບຜົງຫຼາຍໃນເວລາດຽວກັນ;
* ສູດການຄິດໄລ່ການເພີ່ມປະສິດທິພາບທົ່ວໂລກທີ່ສະຫຼາດ;
* ການໂຕ້ຕອບຮູບພາບທີ່ມີການເບິ່ງໂຄງສ້າງໄປເຊຍກັນ 3D ແລະການປັບປຸງທີ່ມີຊີວິດໃນລະຫວ່າງການ
ຂະບວນການເພີ່ມປະສິດທິພາບ.
OPTIONS
ໂຄງການນີ້ຂ້າພະເຈົ້າໄດ້ຮັບການປະຕິບັດໂດຍມີຫຼືບໍ່ມີທາງເລືອກໃນບັນຊີຄໍາສັ່ງຫຼືໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ (file.xml).
ມັນປະຕິບັດຕາມ syntax ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ GNU ປົກກະຕິ, ມີທາງເລືອກຍາວເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍສອງ dashes
(`-'). ສະຫຼຸບຂອງທາງເລືອກແມ່ນລວມຢູ່ຂ້າງລຸ່ມນີ້. ສໍາລັບລາຍລະອຽດຄົບຖ້ວນສົມບູນ, ເບິ່ງ fox ໄດ້
ວິກີ http://objcryst.sourceforge.net/Fox/Manual
- ຊ່ວຍ ສະແດງສະຫຼຸບຂອງທາງເລືອກ.
--loadfouriergrd map.grd
ໂຫລດແລະສະແດງ 'map.grd' ແຜນທີ່ fourier ກັບ (ທໍາອິດ) ໂຄງສ້າງໄປເຊຍກັນ
--loadfourierdsn6 ແຜນທີ່.DN6
ໂຫລດແລະສະແດງແຜນທີ່ສີ່ຫລ່ຽມ DSN6 ທີ່ມີໂຄງສ້າງຜລຶກ (ທໍາອິດ).
--nogui
ດໍາເນີນການໂດຍບໍ່ມີ GUI, ອັດຕະໂນມັດເປີດຕົວການເພີ່ມປະສິດທິພາບ --nogui ອາດຈະມາພ້ອມກັບ
ຕົວເລືອກຕໍ່ໄປນີ້:
-n 10000
ດໍາເນີນການສໍາລັບ 10000 ການທົດລອງຫຼາຍທີ່ສຸດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1000000)
--nbrun 5
ເຮັດ 5 ແລ່ນ, randomizing ກ່ອນແຕ່ລະໄລຍະ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1), ໃຊ້ -1 ເພື່ອແລ່ນບໍ່ມີກໍານົດ.
-o out.xml
ຜົນຜະລິດໃນ 'out.xml'
--randomize
Randomize ການຕັ້ງຄ່າເບື້ອງຕົ້ນ
--ງຽບ
ຜະລິດ (ເກືອບ) ບໍ່ມີຂໍ້ຄວາມອອກ
--ລາຄາສຸດທ້າຍ 0.15
ດໍາເນີນການເພີ່ມປະສິດທິພາບຈົນກ່ວາຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ <0.15
--cif2 ຮູບແບບ 1.5406 170 5000 .1
ຈໍາລອງຮູບແບບສໍາລັບການປ້ອນຂໍ້ມູນໄປເຊຍກັນ, ລວງຍາວຄື້ນ = 1.5406 ສູງເຖິງ 170° ມີ 500 ຈຸດ
ແລະຄວາມກວ້າງສູງສຸດຂອງ 0.1°
ຕົວຢ່າງ
Fox silicon.xml
ໂຫລດໄຟລ໌ 'silicon.xml' ແລະເປີດ GUI.
Fox Cimetidine-powder.xml --nogui --randomize -n 1000000 -o best.xml
ໂຫລດໄຟລ໌ 'ktartrate.xml', randomize, ຈາກນັ້ນເຮັດໃຫ້ 1 optimization ຂອງ 1 ລ້ານທົດລອງ,
ແລະບັນທຶກໂຄງສ້າງທີ່ດີທີ່ສຸດໃນ 'best.xml'.
Fox Cimetidine-powder.xml --nogui --randomize -n 10000000 --nbrun 10 -o best.xml
ໂຫລດໄຟລ໌ 'Cimetidine-powder.xml', ຈາກນັ້ນເຮັດ 10 ແລ່ນ (ເລີ່ມຈາກການສຸ່ມ.
ໂຄງປະກອບການ) ຂອງ 10 ລ້ານການທົດລອງ (ແຕ່ລະໄລຍະຈະຊ່ວຍປະຢັດຫນຶ່ງໄຟລ໌ xml), ແລະປະຫຍັດທີ່ດີທີ່ສຸດ
ໂຄງສ້າງໃນ 'best.xml'.
Fox Cimetidine-powder.xml --nogui --ງຽບ --randomize -n 10000000 --nbrun 10 --ລາຄາສຸດທ້າຍ
200000 -o best.xml
ໂຫລດໄຟລ໌ 'Cimetidine-powder.xml', ຈາກນັ້ນເຮັດໃຫ້ 10 ແລ່ນງຽບ 10 ລ້ານທົດລອງ
(ແຕ່ລະການແລ່ນຈະຊ່ວຍປະຢັດໄຟລ໌ xml ຫນຶ່ງ), ແລະບັນທຶກໂຄງສ້າງທີ່ດີທີ່ສຸດໃນ 'best.xml'. ສໍາລັບແຕ່ລະຄົນ
ແລ່ນ, ການເພີ່ມປະສິດທິພາບຢຸດເຊົາຖ້າຄ່າໃຊ້ຈ່າຍຕໍ່າກວ່າ 200000.
ໃຊ້ fox ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
