ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ fuzztrane ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຟຣີຫຼາຍອັນຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
fuzztran - ຄົ້ນຫາຮູບແບບໃນລໍາດັບທາດໂປຼຕີນ (ແປ)
ສະຫຼຸບສັງລວມ
fuzztran - ລໍາດັບ seqall - ຮູບແບບ ຮູບແບບ [-Frame ບັນຊີລາຍຊື່] [- ຕາຕະລາງ ບັນຊີລາຍຊື່] -outfile ບົດລາຍງານ
fuzztran -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
fuzztran ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "Nucleic: Motifs, Protein: Motifs".
OPTIONS
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqall
- ຮູບແບບ ຮູບແບບ
ລະຫັດ IUPAC ມາດຕະຖານຕົວອັກສອນດຽວສໍາລັບອາຊິດ amino ແມ່ນຖືກນໍາໃຊ້. ສັນຍາລັກ 'x' ແມ່ນ
ໃຊ້ສໍາລັບຕໍາແຫນ່ງທີ່ອາຊິດ amino ໃດຖືກຍອມຮັບ. ຄວາມບໍ່ແນ່ນອນແມ່ນຊີ້ໃຫ້ເຫັນໂດຍ
ລາຍຊື່ອາຊິດ amino ທີ່ຍອມຮັບໄດ້ສໍາລັບຕໍາແຫນ່ງທີ່ກໍານົດ, ລະຫວ່າງວົງເລັບສີ່ຫຼ່ຽມ '[
]'. ຕົວຢ່າງ: [ALT] ຫຍໍ້ມາຈາກ Ala ຫຼື Leu ຫຼື Thr. ຄວາມບໍ່ແນ່ນອນຍັງຊີ້ໃຫ້ເຫັນໂດຍ
ລາຍຊື່ລະຫວ່າງຄູ່ຂອງວົງເລັບ curly '{ }' ອາຊິດ amino ທີ່ບໍ່ໄດ້ຮັບການຍອມຮັບ
ໃນຕໍາແຫນ່ງທີ່ກໍານົດໄວ້. ຕົວຢ່າງ: {AM} ຫຍໍ້ມາຈາກອາຊິດອາມິໂນໃດໆ ຍົກເວັ້ນ Ala ແລະ Met.
ແຕ່ລະອົງປະກອບຢູ່ໃນຮູບແບບແມ່ນແຍກອອກຈາກເພື່ອນບ້ານດ້ວຍ '-'. (ທາງເລືອກໃນ
fuzztran) ການຊໍ້າຄືນຂອງອົງປະກອບຂອງຮູບແບບສາມາດຊີ້ບອກໄດ້ໂດຍການປະຕິບັດຕາມນັ້ນ
ອົງປະກອບທີ່ມີຄ່າຕົວເລກ ຫຼືໄລຍະຕົວເລກລະຫວ່າງວົງເລັບ. ຕົວຢ່າງ:
x(3) ເທົ່າກັບ xxx, x(2,4) ເທົ່າກັບ xx ຫຼື xxx ຫຼື xxxx. ເມື່ອ ກ
ຮູບແບບແມ່ນຈໍາກັດບໍ່ວ່າຈະ N- ຫຼື C-terminal ຂອງລໍາດັບ, ຮູບແບບນັ້ນ
ເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍສັນຍາລັກ '<' ຫຼືຕາມລໍາດັບລົງທ້າຍດ້ວຍສັນຍາລັກ '>'. ໄລຍະເວລາສິ້ນສຸດ
ຮູບແບບ. (ທາງເລືອກໃນ fuzztran). ຕົວຢ່າງ, [DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C
ເພີ່ມເຕີມ ສ່ວນ
-Frame ບັນຊີລາຍຊື່
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
- ຕາຕະລາງ ບັນຊີລາຍຊື່
ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-outfile ບົດລາຍງານ
ໃຊ້ fuzztrane ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
