ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gt-chseqids ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
gt-chseqids - ປ່ຽນ ids ລຳດັບໂດຍການສ້າງແຜນທີ່ໃນໄຟລ໌ແຜນທີ່.
ສະຫຼຸບສັງລວມ
gt chseqids [ທາງເລືອກ ...] mapping_file [GFF3_file]
ລາຍລະອຽດ
- ຄັດ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຈັດຮຽງລັກສະນະ GFF3 ຫຼັງຈາກການປ່ຽນແປງ ids ລໍາດັບ (ການບໍລິໂພກຫນ່ວຍຄວາມຈໍາແມ່ນ
ອັດຕາສ່ວນກັບຂະໜາດໄຟລ໌ທີ່ປ້ອນເຂົ້າ) (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-v [ແມ່ນ|ບໍ່]
be verbose (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-o [ຊື່ເອກະສານ]
ປ່ຽນເສັ້ນທາງຜົນຜະລິດໄປຫາໄຟລ໌ທີ່ລະບຸ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ)
-gzip [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຂຽນ gzip ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ຖືກບີບອັດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-bzip2 [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຂຽນໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ຖືກບີບອັດ bzip2 (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
- ຜົນບັງຄັບໃຊ້ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ບັງຄັບໃຫ້ຂຽນເປັນໄຟລ໌ອອກ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)
-ຊ່ວຍ
ສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອແລະອອກ
-ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງຂໍ້ມູນສະບັບແລະອອກ
ຮູບແບບໄຟລ໌ສໍາລັບ mapping_file:
ໄຟລ໌ແຜນທີ່ທີ່ສະໜອງໃຫ້ກໍານົດຕາຕະລາງການສ້າງແຜນທີ່ທີ່ມີຊື່ວ່າ "chseqids". ມັນສ້າງແຜນທີ່
ລາຍການຕາມລຳດັບພາກພື້ນທີ່ມອບໃຫ້ຢູ່ໃນ GFF3_file ໃຫ້ກັບຊື່ອື່ນ. ມັນສາມາດຖືກກໍານົດເປັນ
ຕໍ່ໄປນີ້:
chseqids = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
ເມື່ອຕົວຢ່າງນີ້ຖືກນໍາໃຊ້, ids ລໍາດັບ "chr1" ທັງຫມົດຈະຖືກປ່ຽນເປັນ "seq1" ແລະທັງຫມົດ.
sequence ids "chr2" ຫາ "seq2".
ການລາຍງານ ບັກ
ລາຍງານບັກຫາ[email protected]>.
ໃຊ້ gt-chseqids ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
