ພາສາອັງກິດພາສາຝຣັ່ງແອສປາໂຍນ

ແລ່ນເຊີບເວີ | Ubuntu > | Fedora > |


OnWorks favicon

infoaligne - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ເປີດໃຊ້ infoaligne ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີຜ່ານ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator

ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ infoaligne ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຟຣີຫຼາຍອັນຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator

ໂຄງການ:

NAME


infoalign - ສະແດງຂໍ້ມູນພື້ນຖານກ່ຽວກັບການຈັດລໍາດັບຫຼາຍອັນ

ສະຫຼຸບສັງລວມ


infoalign - ລໍາດັບ seqset [- ມາຕຣິກເບື້ອງ matrix] [-refseq string] - ຫຼາຍ float
- ຕົວ​ຕົນ​ float -outfile outfile [-html ປຸ້ຍ] -ພຽງແຕ່ ປຸ້ຍ -ຫົວ​ຂໍ້ ປຸ້ຍ
-ອາ​ເມລິ​ກາ ປຸ້ຍ -yam ປຸ້ຍ - ຄວາມ​ຍາວ​ລໍາ​ດັບ​ ປຸ້ຍ - ຄວາມ​ຍາວ​ຈັດ​ຕັ້ງ​ ປຸ້ຍ - ຊ່ອງ​ຫວ່າງ​ ປຸ້ຍ
- ຊ່ອງ​ຫວ່າງ​ ປຸ້ຍ -idcount ປຸ້ຍ - ຈໍາ​ນວນ​ຈໍາ​ນວນ​ ປຸ້ຍ - ຄວາມ​ແຕກ​ຕ່າງ​ ປຸ້ຍ
- ການ​ປ່ຽນ​ແປງ​ ປຸ້ຍ - ນໍ້າໜັກ ປຸ້ຍ - ລາຍ​ລະ​ອຽດ​ ປຸ້ຍ

infoalign -ຊ່ວຍ

ລາຍລະອຽດ


infoalign ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນແມ່ນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງ "ການຈັດຕໍາແຫນ່ງ: ຫຼາຍ, ດຶງຂໍ້ມູນ: ຂໍ້ມູນລໍາດັບ"
ກຸ່ມຄໍາສັ່ງ.

OPTIONS


ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqset
ການຈັດລໍາດັບລໍາດັບທີ່ຈະສະແດງ.

- ມາຕຣິກເບື້ອງ matrix
ນີ້ແມ່ນໄຟລ໌ຕາຕະລາງຄະແນນທີ່ໃຊ້ໃນເວລາປຽບທຽບລໍາດັບ. ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນມັນແມ່ນ
ໄຟລ໌ 'EBLOSUM62' (ສໍາລັບທາດໂປຼຕີນ) ຫຼືໄຟລ໌ 'EDNAFULL' (ສໍາລັບລໍາດັບ nucleic). ເຫຼົ່ານີ້
ໄຟລ໌ຖືກພົບເຫັນຢູ່ໃນໄດເລກະທໍລີ 'ຂໍ້ມູນ' ຂອງການຕິດຕັ້ງ EMBOSS.

-refseq string
ຖ້າທ່ານໃຫ້ຕົວເລກໃນການຈັດລໍາດັບຫຼືຊື່ຂອງລໍາດັບ, ມັນຈະຖືກນໍາໄປ
ເປັນລໍາດັບອ້າງອີງ. ລໍາດັບການອ້າງອິງແມ່ນຫນຶ່ງຕໍ່ຕ້ານທີ່ທັງຫມົດ
ລໍາດັບອື່ນໆແມ່ນປຽບທຽບ. ຖ້າອັນນີ້ຖືກຕັ້ງເປັນ 0 ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ລໍາດັບຄວາມເຫັນດີນໍາຈະເປັນ
ໃຊ້ເປັນລໍາດັບອ້າງອີງ. ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ, ລໍາດັບຄວາມເຫັນດີນໍາຖືກນໍາໃຊ້ເປັນ
ລໍາດັບອ້າງອີງ.

ແບບ​ພິ​ເສດ ສ່ວນ
- ຫຼາຍ float
ກໍາ​ນົດ​ການ​ຕັດ​ອອກ​ສໍາ​ລັບ % ຂອງ​ການ​ແຂ່ງ​ຂັນ​ຄະ​ແນນ​ທາງ​ບວກ​ຂ້າງ​ລຸ່ມ​ນີ້​ທີ່​ບໍ່​ມີ​ຄວາມ​ເປັນ​ເອ​ກະ​ພາບ​.
ອັດຕາສ່ວນຫຼາຍໃນຕອນຕົ້ນແມ່ນປະຕິບັດເປັນ 50% ຂອງນ້ໍາຫນັກທັງຫມົດຂອງລໍາດັບທັງຫມົດໃນ
ການຈັດວາງ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 50.0

- ຕົວ​ຕົນ​ float
ສະ​ຫນອງ​ສະ​ຖານ​ທີ່​ຂອງ​ການ​ກໍາ​ນົດ​ຈໍາ​ນວນ​ທີ່​ຕ້ອງ​ການ​ຂອງ​ຕົວ​ຕົນ​ຢູ່​ໃນ​ຕໍາ​ແຫນ່ງ​ສໍາ​ລັບ​ການ
ມັນເພື່ອໃຫ້ເປັນເອກະສັນ. ດັ່ງນັ້ນ, ຖ້າອັນນີ້ຖືກຕັ້ງເປັນ 100% ພຽງແຕ່ຖັນຂອງຕົວຕົນ
ປະກອບສ່ວນ​ເຂົ້າ​ໃນ​ຄວາມ​ເຫັນ​ດີ​ເຫັນ​ພ້ອມ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.0

ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-outfile outfile
ຖ້າທ່ານໃສ່ຊື່ຂອງໄຟລ໌ທີ່ນີ້, ໂຄງການນີ້ຈະຂຽນລາຍລະອຽດລໍາດັບ
ເຂົ້າໄປໃນໄຟລ໌ນັ້ນ.

-html ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N

-ພຽງແຕ່ ປຸ້ຍ
ນີ້ແມ່ນວິທີການເຮັດໃຫ້ເສັ້ນຄໍາສັ່ງສັ້ນລົງຖ້າທ່ານຕ້ອງການພຽງແຕ່ສອງສາມຢ່າງ
ສະແດງ. ແທນທີ່ຈະລະບຸ: '-nohead -nousa -noname -noalign -nogaps -nogapcount
-nosimcount -noidcount -nodiffcount -noweight' ເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຜົນຜະລິດຄວາມຍາວຂອງລໍາດັບເທົ່ານັ້ນ,
ທ່ານສາມາດກໍານົດ '-only -seqlength' ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N

-ຫົວ​ຂໍ້ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

-ອາ​ເມລິ​ກາ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

-yam ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ຄວາມ​ຍາວ​ລໍາ​ດັບ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ຄວາມ​ຍາວ​ຈັດ​ຕັ້ງ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ຊ່ອງ​ຫວ່າງ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ຊ່ອງ​ຫວ່າງ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

-idcount ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ຈໍາ​ນວນ​ຈໍາ​ນວນ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ຄວາມ​ແຕກ​ຕ່າງ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ການ​ປ່ຽນ​ແປງ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ນໍ້າໜັກ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

- ລາຍ​ລະ​ອຽດ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @(!$(ເທົ່ານັ້ນ))

ໃຊ້ infoaligne ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net


Ad


Ad