ພາສາອັງກິດພາສາຝຣັ່ງແອສປາໂຍນ

ແລ່ນເຊີບເວີ | Ubuntu > | Fedora > |


OnWorks favicon

ipig - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ແລ່ນ ipig ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີຜ່ານ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator

ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ ipig ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຟຣີຫຼາຍອັນຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator

ໂຄງການ:

NAME


ipig - ການເຊື່ອມໂຍງ PSMs ເຂົ້າໃນການສະແດງພາບຂອງຕົວທ່ອງເວັບ Genome

ສະຫຼຸບສັງລວມ


ipig <psm ໄຟລ໌> |-g|-c|-cg [ ]

ລາຍລະອຽດ


iPiG ເປົ້າຫມາຍການລວມຕົວຂອງ peptide spectrum matches (PSMs) ຈາກ mass spectrometry
(MS) ການກໍານົດ peptide ເຂົ້າໄປໃນສາຍຕາຂອງ genomic ສະຫນອງໃຫ້ໂດຍ genome browser ເຊັ່ນ
ເປັນ UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG ໃຊ້ PSMs ຈາກຮູບແບບມາດຕະຖານ MS mzIdentML (*.mzid) ຫຼືໃນຮູບແບບຂໍ້ຄວາມ ແລະ
ສະຫນອງຜົນໄດ້ຮັບໃນຮູບແບບການຕິດຕາມ genome (ໄຟລ໌ BED ແລະ GFF3), ຊຶ່ງສາມາດໄດ້ຢ່າງງ່າຍດາຍ
ນໍາເຂົ້າເຂົ້າໄປໃນຕົວທ່ອງເວັບຂອງ genome.

OPTIONS


<psm ໄຟລ໌>
ຊີ້ບອກໄຟລ໌ທີ່ມີ peptide spectrum matches (mzid/txt)

-g, -gui
ເລີ່ມຕົ້ນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້ແບບກາຟິກຂອງ iPiG

-c, - ການ​ຄວບ​ຄຸມ​
ເລີ່ມຕົ້ນການຄວບຄຸມ gene, ໄຟລ໌ທີ່ຈໍາເປັນຕ້ອງໄດ້ຮັບການຊີ້ບອກໃນການຕັ້ງຄ່າ
ເອກະສານ

-cg, -controlgui
ເລີ່ມຕົ້ນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້ແບບກາຟິກຂອງການຄວບຄຸມ gene

-d, - ດາວ​ໂຫຼດ​
ເລີ່ມການດາວໂຫຼດ gui


ໄຟລ໌ການຕັ້ງຄ່າທີ່ແຕກຕ່າງກັນສາມາດໄດ້ຮັບການຊີ້ບອກ (ຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນ ipig.conf ຈະຖືກໂຫລດໂດຍ
ເລີ່ມຕົ້ນ)

ຄວາມຕ້ອງການເພີ່ມເຕີມ:

ການນໍາໃຊ້ຮູບແບບທີ່ບໍ່ແມ່ນ gui, ໄຟລ໌ config (ipig.conf ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ) ຕ້ອງມີຫຼາຍໆອັນ
ຕົວກໍານົດການເພີ່ມເຕີມ, ເຊັ່ນ: ການຊີ້ບອກ genome ອ້າງອີງແລະອື່ນໆ.

ໃນ​ຮູບ​ແບບ gui (-g ແລະ -cg), ຕົວກໍານົດການເພີ່ມເຕີມສາມາດໄດ້ຮັບການຊີ້ບອກສອງວິທີ, ພາຍໃນ
ການໂຕ້ຕອບຫຼືກັບໄຟລ໌ config ເຊັ່ນດຽວກັນ.

ເຂົ້າໄປເບິ່ງ readme.txt ແລະ ipig.conf ສໍາລັບຕົວຢ່າງ ແລະລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບ
ຕົວກໍານົດການເພີ່ມເຕີມ

ໃຊ້ ipig ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net


Ad


Ad