ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ maskseqe ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຟຣີຫຼາຍອັນຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
maskseq - ຂຽນລໍາດັບທີ່ມີພື້ນທີ່ຫນ້າກາກ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ຫນ້າກາກ - ລໍາດັບ ລໍາດັບ - ພາກພື້ນ ລະດັບ [- ລຸ່ມ toggle] - ໜ້າກາກ string
- outseq sequout
ຫນ້າກາກ -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
ຫນ້າກາກ ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນແມ່ນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງ "ແກ້ໄຂ" ກຸ່ມຄໍາສັ່ງ.
OPTIONS
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ ລໍາດັບ
ທີ່ກໍານົດໄວ້ ສ່ວນ
- ພາກພື້ນ ລະດັບ
ພາກພື້ນທີ່ຈະເຮັດຫນ້າກາກ. ຊຸດຂອງພາກພື້ນແມ່ນຖືກກໍານົດໂດຍຊຸດຂອງຄູ່ຕໍາແຫນ່ງ. ໄດ້
ຕຳແໜ່ງແມ່ນຈຳນວນເຕັມ. ພວກມັນຖືກແຍກອອກດ້ວຍຕົວອັກສອນທີ່ບໍ່ແມ່ນຕົວເລກ, ບໍ່ແມ່ນອັກຂະລະ.
ຕົວຢ່າງຂອງສະເພາະພາກພື້ນແມ່ນ: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
ເພີ່ມເຕີມ ສ່ວນ
- ລຸ່ມ toggle
ພາກພື້ນສາມາດຖືກ 'ປິດບັງ' ໂດຍການປ່ຽນຕົວອັກສອນຕາມລໍາດັບໄປຫາຕົວພິມນ້ອຍ, ບາງ
ໂຄງການທີ່ບໍ່ແມ່ນ EMBOSS ຕົວຢ່າງເຊັ່ນ fasta ສາມາດຕີຄວາມຫມາຍນີ້ເປັນພື້ນທີ່ຫນ້າກາກ. ລໍາດັບແມ່ນ
ບໍ່ປ່ຽນແປງນອກຈາກການປ່ຽນແປງກໍລະນີ. ທ່ານອາດຈະຕ້ອງການໃຫ້ແນ່ໃຈວ່າລໍາດັບທັງຫມົດ
ຢູ່ໃນຕົວພິມໃຫຍ່ກ່ອນທີ່ຈະປິດບັງພາກພື້ນທີ່ລະບຸໄວ້ເປັນຕົວພິມນ້ອຍໂດຍການໃຊ້
ທຸງ '-supper'. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
- ໜ້າກາກ string
ລັກສະນະທີ່ຈະໃຊ້ໃນເວລາທີ່ເຮັດຫນ້າກາກ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ 'X' ສໍາລັບລໍາດັບທາດໂປຼຕີນ, 'N' ສໍາລັບ nucleic
ລໍາດັບ. ຖ້າຕົວລະຄອນໜ້າກາກຖືກຕັ້ງເປັນຕົວອັກສອນ SPACE ຫຼື ຕົວອັກສອນ null,
ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ລໍາດັບແມ່ນ 'ຫນ້າກາກ' ໂດຍການປ່ຽນແປງມັນເປັນຕົວພິມນ້ອຍ, ຄືກັນກັບ
ທຸງ '-ຕົວພິມນ້ອຍ'. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @($(acdprotein)?X:N)
ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
- outseq sequout
ໃຊ້ maskseqe ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net