ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ mia-2dmyoica-nonrigid-parallel ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
mia-2dmyoica-nonrigid-parallel - ດໍາເນີນການລົງທະບຽນຊຸດຂອງຮູບພາບ 2D.
ສະຫຼຸບສັງລວມ
mia-2dmyoica-nonrigid-ຂະໜານ -i -o [ທາງເລືອກ]
ລາຍລະອຽດ
mia-2dmyoica-nonrigid-ຂະໜານ ໂຄງການນີ້ປະຕິບັດສະບັບ 2D ຂອງການເຄື່ອນໄຫວ
ຂັ້ນຕອນການຊົດເຊີຍທີ່ອະທິບາຍໄວ້ໃນ Wollny G, Kellman P, Santos A, Ledesma-Carbayo MJ,
"ການຊົດເຊີຍການເຄື່ອນໄຫວອັດຕະໂນມັດຂອງການຫາຍໃຈຟຣີໄດ້ຮັບຂໍ້ມູນ Myocardial Perfusion ໂດຍ
ການນໍາໃຊ້ການວິເຄາະອົງປະກອບເອກະລາດ", ການວິເຄາະຮູບພາບທາງການແພດ, 2012,
DOI:10.1016/j.media.2012.02.004.ໂປຣແກຣມສະບັບນີ້ອາດຈະດໍາເນີນການລົງທະບຽນທັງໝົດໃນ
ຂະຫນານ.
OPTIONS
ໄຟລ໌-IO
-i --in-file=(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ຕ້ອງການ); ສາຍ
ຊຸດຂໍ້ມູນ input perfusion
-o --out-file=(ອອກ, ຕ້ອງການ); ສາຍ
ຜົນຜະລິດຊຸດຂໍ້ມູນ perfusion
-r --registered=reg
ພື້ນຖານຊື່ໄຟລ໌ສໍາລັບຮູບພາບທີ່ລົງທະບຽນ. ປະເພດຮູບພາບແລະໂຄງການຈໍານວນ
ໄດ້ຖືກເອົາມາຈາກຮູບພາບການປ້ອນຂໍ້ມູນຕາມທີ່ໄດ້ລະບຸໄວ້ໃນຊຸດຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນ.
--save-cropped=(ຜົນຜະລິດ); ສາຍ
ບັນທຶກການຕັດຕັ້ງໃນໄຟລ໌ນີ້, ໄຟລ໌ຮູບພາບຈະນໍາໃຊ້ລໍາຕົ້ນຂອງຊື່
ເປັນຖານຊື່ໄຟລ໌
--save-feature=(ຜົນຜະລິດ); ສາຍ
ບັນທຶກຮູບພາບຄຸນສົມບັດການແບ່ງສ່ວນ ແລະຕາຕະລາງການປະສົມ ICA ເບື້ອງຕົ້ນ
--save-refs=(ຜົນຜະລິດ); ສາຍ
ສໍາລັບແຕ່ລະໃບລົງທະບຽນບັນທຶກຮູບພາບອ້າງອີງໃສ່ໄຟລ໌ທີ່ມີໃຫ້
ຖານຊື່
--save-regs=(ຜົນຜະລິດ); ສາຍ
ສໍາລັບການລົງທະບຽນແຕ່ລະຜ່ານບັນທຶກຮູບພາບທີ່ລົງທະບຽນລະດັບປານກາງ
ຊ່ວຍເຫຼືອ & ຂໍ້ມູນ
-V --verbose=ຄຳເຕືອນ
verbosity ຂອງຜົນຜະລິດ, ພິມຂໍ້ຄວາມຂອງລະດັບທີ່ໄດ້ຮັບແລະບູລິມະສິດສູງກວ່າ.
ບຸລິມະສິດທີ່ສະໜັບສະໜູນໂດຍເລີ່ມຈາກລະດັບຕໍ່າສຸດແມ່ນ:
ຂໍ້ມູນ - ຂໍ້ຄວາມໃນລະດັບຕ່ໍາ
trace - Function ໂທຕິດຕາມ
ບໍ່ - ລາຍງານຄວາມລົ້ມເຫຼວຂອງການທົດສອບ
ການເຕືອນໄພ - ຄໍາເຕືອນ
ຄວາມຜິດພາດ - ລາຍງານຄວາມຜິດພາດ
debug - ຜົນຜະລິດແກ້ໄຂບັນຫາ
ຂໍ້ຄວາມ - ຂໍ້ຄວາມປົກກະຕິ
ຄວາມຕາຍ - ລາຍງານຄວາມຜິດພາດຕາຍເທົ່ານັ້ນ
--ລິຂະສິດ
ພິມຂໍ້ມູນລິຂະສິດ
-h --help
ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອນີ້
- ? -- ການນໍາໃຊ້
ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອສັ້ນ
- ການປ່ຽນແປງ
ພິມຕົວເລກສະບັບແລະອອກ
ICE
-C --ສ່ວນປະກອບ=0
ອົງປະກອບ ICA 0 = ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ ອົງປະກອບ ICA 0 = ອັດຕະໂນມັດ
ການຄາດຄະເນ
-- ປົກກະຕິ
ICs ປົກກະຕິ
-- ບໍ່ມີທາງອອກ
ຢ່າເອົາຄ່າສະເລ່ຍອອກຈາກເສັ້ນໂຄ້ງປະສົມ
-s --segscale=0
segment and scale the crop box around the LV (0=no segmentation)segment and
ຂະຫຍາຍກ່ອງຕັດຮອບ LV (0=ບໍ່ມີການແບ່ງສ່ວນ)
-k --ຂ້າມ=0
ຂ້າມຮູບພາບໃນຕອນຕົ້ນຂອງຊຸດເຊັ່ນເນື່ອງຈາກວ່າພວກເຂົາເຈົ້າແມ່ນຂອງອື່ນໆ
modalitiesskip ຮູບພາບໃນຕອນຕົ້ນຂອງຊຸດຕົວຢ່າງເຊັ່ນຍ້ອນວ່າພວກເຂົາ
ມີວິທີການອື່ນໆ
-m --max-ica-iter=400
ຈໍານວນສູງສຸດຂອງ iterations ໃນ ICA ຈໍານວນສູງສຸດຂອງ iterations ໃນ ICA
-E --segmethod=ຄຸນສົມບັດ
ວິທີການແບ່ງສ່ວນ
delta-ສູງສຸດ - ຄວາມແຕກຕ່າງຂອງຮູບພາບການປັບປຸງສູງສຸດ
ຄຸນລັກສະນະ - ຮູບພາບຄຸນນະສົມບັດ
ລັກສະນະ delta - ຄວາມແຕກຕ່າງຂອງຮູບພາບຄຸນນະສົມບັດ
-b --min-breathing-frequency=-1
ຄວາມຖີ່ຂອງຄ່າສະເລ່ຍໜ້ອຍທີ່ສຸດ ເສັ້ນໂຄ້ງປະສົມສາມາດຖືກພິຈາລະນາວ່າມາຈາກ
ພີ່ນ້ອງ. ອັດຕາການພັກຜ່ອນທີ່ດີຕໍ່ສຸຂະພາບແມ່ນ 12 ຕໍ່ນາທີ. ຄ່າທາງລົບ
ປິດການນຳໃຊ້ຄວາມຖີ່ຂອງ test.minimal ໝາຍ ຄວາມວ່າເສັ້ນໂຄ້ງປະສົມສາມາດເປັນໄດ້
ຖືວ່າເປັນສາເຫດມາຈາກການຫາຍໃຈ. ອັດຕາການພັກຜ່ອນທີ່ດີຕໍ່ສຸຂະພາບແມ່ນ 12 ຕໍ່
ນາທີ. ຄ່າລົບປິດການໃຊ້ງານການທົດສອບ.
ການປະມວນຜົນ
--ກະທູ້=-1
ຈໍານວນສູງສຸດຂອງກະທູ້ທີ່ຈະນໍາໃຊ້ສໍາລັບການປຸງແຕ່ງ, ຈໍານວນນີ້ຄວນຈະຕ່ໍາ
ຫຼືເທົ່າກັບຈໍານວນຂອງແກນໂຮງງານຜະລິດຕາມເຫດຜົນໃນເຄື່ອງ. (-1:
ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ).ຈໍານວນສູງສຸດຂອງກະທູ້ທີ່ຈະນໍາໃຊ້ສໍາລັບການປຸງແຕ່ງ, ນີ້
ຈໍານວນຄວນຈະຕ່ໍາຫຼືເທົ່າທຽມກັບຈໍານວນຂອງຫຼັກການປະມວນຜົນທີ່ມີເຫດຜົນໃນ
ເຄື່ອງ. (-1: ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ).
ການລົງທະບຽນ
-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
Optimizer ໃຊ້ສໍາລັບການຫຼຸດຫນ້ອຍລົງ. ຄ່າສະຕຣິງຈະຖືກໃຊ້ເພື່ອສ້າງ
ປລັກອິນ. ສໍາລັບປລັກອິນທີ່ຮອງຮັບເບິ່ງ PLUGINS:minimizer/singlecost
-a --start-c-rate=16
ເລີ່ມອັດຕາ coefficinet ໃນກະດູກສັນຫຼັງ, ຖືກແບ່ງອອກໂດຍ --c-rate-divider ກັບ
ອັດຕາ coefficinet pass.start ທຸກຢູ່ໃນກະດູກສັນຫຼັງ, ຖືກແບ່ງອອກໂດຍ
--c-rate-divider ກັບທຸກ pass.
--c-rate-divider=2
ຕົວແບ່ງອັດຕາຄ່າສຳປະສິດສຳລັບແຕ່ລະ pass.Cofficient rate divider ສຳລັບແຕ່ລະ pass.
-d --start-divcurl=10000
ເລີ່ມນ້ໍາຫນັກ divcurl, ແບ່ງອອກໂດຍ --divcurl-divider ກັບທຸກ
pass.Start divcurl ນ້ໍາຫນັກ, ໄດ້ຮັບການແບ່ງອອກໂດຍ --divcurl-divider ກັບທຸກ
ຜ່ານ.
--divcurl-divider=2
ການຂະຫຍາຍນ້ໍາຫນັກ Divcurl ກັບແຕ່ລະ pass.Divcurl ໃຫມ່ການຂະຫຍາຍນ້ໍາກັບແຕ່ລະ
ຜ່ານໃໝ່.
-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd
ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍຂອງຮູບພາບ, ບໍ່ໄດ້ລະບຸຕົວກໍານົດການ src ແລະ ref, ເຫຼົ່ານີ້ຈະຖືກກໍານົດໂດຍ
ໂຄງການ. ຄ່າສະຕຣິງຈະຖືກໃຊ້ເພື່ອສ້າງປລັກອິນ. ສໍາລັບ
ປລັກອິນທີ່ຮອງຮັບເບິ່ງ PLUGINS:2dimage/fullcost
-l --mg-levels=3
ຫຼາຍລະດັບຄວາມລະອຽດຫຼາຍລະດັບ
-P --passes=3
ການລົງທະບຽນ passesregistration passes
ປລັກອິນ: 1d/splinekernel
bspline ການສ້າງ kernel B-spline, ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
d = 3; int ໃນ [0, 5]
ລະດັບ Spline.
omoms OMoms-spline kernel ສ້າງ, ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
d = 3; int ໃນ [3, 3]
ລະດັບ Spline.
ປລັກອິນ: 2dimage/ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ
lncc Localized normalized cross correlation with masking support., ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນ
ແມ່ນ:
w = 5; uint ໃນ [1, 256]
ຄວາມກວ້າງເຄິ່ງຫນຶ່ງຂອງປ່ອງຢ້ຽມທີ່ໃຊ້ສໍາລັບການປະເມີນຂ້າມທ້ອງຖິ່ນ
ຄວາມສຳພັນ.
lsd ການວັດແທກໄລຍະຫ່າງນ້ອຍສຸດ-ສີ່ຫຼ່ຽມ
(ບໍ່ມີຕົວກໍານົດການ)
mi ຂໍ້ມູນເຊິ່ງກັນແລະກັນໂດຍອີງໃສ່ Spline parzen., ຕົວກໍານົດການສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
ການຕັດ = 0; ລອຍຢູ່ໃນ [0, 40]
ເປີເຊັນຂອງ pixels ທີ່ຈະຕັດຢູ່ທີ່ຄວາມເຂັ້ມສູງແລະຕ່ໍາເພື່ອເອົາອອກ
ຄົນນອກ.
ມິນບິນ = 64; uint ໃນ [1, 256]
ຈຳນວນຂອງຖັງເກັບຂໍ້ມູນ histogram ທີ່ໃຊ້ສຳລັບຮູບພາບເຄື່ອນທີ່.
mkernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
Spline kernel ສໍາລັບການເຄື່ອນຍ້າຍຮູບພາບ hinstogram parzen. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນ
ເບິ່ງ PLUGINS:1d/splinekernel
rbins = 64; uint ໃນ [1, 256]
ຈໍານວນຖັງ histogram ທີ່ໃຊ້ສໍາລັບຮູບພາບອ້າງອີງ.
rkernel = [bspline:d=0]; ໂຮງງານ
Spline kernel ສໍາລັບຮູບພາບອ້າງອີງ parzen hinstogram. ສໍາລັບການສະຫນັບສະຫນູນ plug-
ins ເບິ່ງ PLUGINS:1d/splinekernel
ncc normalized cross correlation.
(ບໍ່ມີຕົວກໍານົດການ)
ngf ຟັງຊັນນີ້ປະເມີນຄວາມຄ້າຍຄືກັນຂອງຮູບພາບໂດຍອີງໃສ່ gradient ປົກກະຕິ
ທົ່ງນາ. ແກ່ນການປະເມີນຜົນຕ່າງໆແມ່ນມີຢູ່., ຕົວກໍານົດການທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
ການປະເມີນ = ds; ຄຳສັ່ງ
ປະເພດຍ່ອຍຂອງ plugin. ຄ່າທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
sq - ສີ່ຫຼ່ຽມຂອງຄວາມແຕກຕ່າງ
ds - ສີ່ຫຼ່ຽມຂອງຄວາມແຕກຕ່າງຂະຫນາດ
ຈຸດ - ແກ່ນຜະລິດຕະພັນ scalar
ຂ້າມ - ແກ່ນຜະລິດຕະພັນຂ້າມ
ssd ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ 2D imaga: ຜົນລວມຂອງຄວາມແຕກຕ່າງຂອງການສອງ, ຕົວກໍານົດການສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
ອັດອັດຕະໂນມັດ = 0; ລອຍຢູ່ໃນ [0, 1000]
ໃຊ້ການປິດບັງຮູບພາບທີ່ເຄື່ອນທີ່ໂດຍອັດຕະໂນມັດໂດຍການເອົາຄ່າຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນເທົ່ານັ້ນ
ເຂົ້າໄປໃນບັນຊີທີ່ມີຂະຫນາດໃຫຍ່ກ່ວາເກນທີ່ໄດ້ຮັບ.
ມາດຕະຖານ = 0; ບູລ
ກໍານົດວ່າ metric ຄວນຖືກປັບຕາມຈໍານວນ pixels ຮູບພາບ.
ssd-automask
ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍຂອງຮູບພາບ 2D: ຜົນລວມຂອງຄວາມແຕກຕ່າງສີ່ຫຼ່ຽມ, ມີອັດຕະໂນມັດອີງຕາມການໃຫ້
ເກນ, ຕົວກໍານົດການທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
ນວດ = 0; ສອງເທົ່າ
ຄ່າຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນສຳລັບຮູບພາບອ້າງອີງ.
ຊັກ = 0; ສອງເທົ່າ
ຄ່າຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນສຳລັບຮູບພາບແຫຼ່ງ.
ປລັກອິນ: 2dimage/ລາຄາເຕັມ
ຮູບພາບເລັກນ້ອຍ ຟັງຊັນຄ່າຄວາມຄ້າຍຄືກັນຂອງຮູບພາບທົ່ວໄປທີ່ຍັງຈັດການກັບຄວາມລະອຽດຫຼາຍ
ການປຸງແຕ່ງ. ການວັດແທກຄວາມຄ້າຍຄືກັນຕົວຈິງແມ່ນໃຫ້ es ພາລາມິເຕີພິເສດ.,
ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ = ssd; ໂຮງງານ
ຟັງຊັນຕົ້ນທຶນ. ສໍາລັບປລັກອິນທີ່ຮອງຮັບເບິ່ງ PLUGINS:2dimage/cost
debug = 0; ບູລ
ບັນທຶກ resuts ລະດັບປານກາງສໍາລັບການ debugging.
ການອ້າງອີງຫຼັກ =(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ສະຕຣິງ)
ຮູບພາບອ້າງອີງ.
src =(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ສະຕຣິງ)
ຮູບພາບການສຶກສາ.
ນ້ໍາ = 1; ລອຍ
ນ້ໍາຫນັກຂອງຫນ້າທີ່ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ.
ປ້າຍກຳກັບ
ຟັງຊັນຄ່າໃຊ້ຈ່າຍທີ່ຄ້າຍຄືກັນທີ່ແຜນທີ່ປ້າຍຊື່ຂອງສອງຮູບພາບແລະຈັດການປ້າຍຊື່-
ການປົກປັກຮັກສາການປຸງແຕ່ງຫຼາຍການແກ້ໄຂ., ຕົວກໍານົດການສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
debug = 0; int ໃນ [0, 1]
ຂຽນໄລຍະຫ່າງປ່ຽນເປັນຮູບ 3D.
maxlabel = 256; int ໃນ [2, 32000]
ຈໍານວນປ້າຍສູງສຸດທີ່ຈະພິຈາລະນາ.
ການອ້າງອີງຫຼັກ =(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ສະຕຣິງ)
ຮູບພາບອ້າງອີງ.
src =(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ສະຕຣິງ)
ຮູບພາບການສຶກສາ.
ນ້ໍາ = 1; ລອຍ
ນ້ໍາຫນັກຂອງຫນ້າທີ່ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ.
ຮູບພາບໜ້າກາກ
ຟັງຊັນຄ່າຄວາມຄ້າຍຄືກັນຂອງຮູບພາບໜ້າກາກທົ່ວໄປທີ່ຍັງຈັດການກັບຫຼາຍອັນ.
ການປຸງແຕ່ງຄວາມລະອຽດ. ໜ້າກາກທີ່ໃຫ້ມາຄວນຖືກຕື່ມໃສ່ພື້ນທີ່ຢ່າງໜາແໜ້ນ
ການແກ້ໄຂຫຼາຍຂັ້ນຕອນເພາະວ່າຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນຂໍ້ມູນຫນ້າກາກອາດຈະສູນເສຍໄປ
ເມື່ອຫຼຸດຂະໜາດຮູບພາບ. ຫນ້າກາກກະສານອ້າງອີງແລະຫນ້າກາກທີ່ຫັນປ່ຽນຂອງ
ຮູບພາບການສຶກສາແມ່ນປະສົມໂດຍ binary AND. ການວັດແທກຄວາມຄ້າຍຄືກັນຕົວຈິງແມ່ນໃຫ້
es ຕົວກໍານົດການພິເສດ., ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ = ssd; ໂຮງງານ
ຟັງຊັນຕົ້ນທຶນ. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins: 2dimage/maskedcost
ການອ້າງອີງຫຼັກ =(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ສະຕຣິງ)
ຮູບພາບອ້າງອີງ.
ຫນ້າກາກອ້າງອີງ =(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ສະຕຣິງ)
ຫນ້າກາກຮູບພາບອ້າງອີງ (ຖານສອງ).
src =(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ສະຕຣິງ)
ຮູບພາບການສຶກສາ.
src-ຫນ້າກາກ =(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ສະຕຣິງ)
ການສຶກສາຫນ້າກາກຮູບພາບ (ຖານສອງ).
ນ້ໍາ = 1; ລອຍ
ນ້ໍາຫນັກຂອງຫນ້າທີ່ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ.
ປລັກອິນ: 2dimage/io
bmp ຮອງຮັບ BMP 2D-image input/output
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .BMP, .bmp
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit
ຖານຂໍ້ມູນ Virtual IO ໄປແລະຈາກສະນຸກເກີຂໍ້ມູນພາຍໃນ
ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .@
ດິຄອມ ຮູບພາບ 2D io ສໍາລັບ DICOM
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .DCM, .dcm
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ເຊັນ 16 bit, unsigned 16 bit
exr plugin io 2dimage ສໍາລັບຮູບພາບ OpenEXR
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .EXR, .exr
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
unsigned 32 bit, floating point 32 bit
jpg plugin io 2dimage ສໍາລັບ jpeg ຂະຫນາດສີຂີ້ເຖົ່າ
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
unsigned 8 bit
png plugin io 2dimage ສໍາລັບຮູບພາບ png
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .PNG, .png
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit
ວັດຖຸດິບ ຮອງຮັບຜົນຜະລິດຮູບ RAW 2D
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .RAW, .raw
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, ລົງນາມ 8 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ,
ເຊັນ 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
Bit
typhoid ຮອງຮັບ TIFF 2D-image input/output
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit, unsigned 32 bit
vista plugin io 2dimage ສໍາລັບຮູບພາບ vista
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .V, .VISTA, .v, .vista
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, ລົງນາມ 8 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ,
ເຊັນ 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
Bit
ປລັກອິນ: 2dimage/maskedcost
lncc Localized normalized cross correlation with masking support., ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນ
ແມ່ນ:
w = 5; uint ໃນ [1, 256]
ຄວາມກວ້າງເຄິ່ງຫນຶ່ງຂອງປ່ອງຢ້ຽມທີ່ໃຊ້ສໍາລັບການປະເມີນຂ້າມທ້ອງຖິ່ນ
ຄວາມສຳພັນ.
mi Spline parzen ອີງໃສ່ຂໍ້ມູນເຊິ່ງກັນແລະກັນກັບຫນ້າກາກ.
ການຕັດ = 0; ລອຍຢູ່ໃນ [0, 40]
ເປີເຊັນຂອງ pixels ທີ່ຈະຕັດຢູ່ທີ່ຄວາມເຂັ້ມສູງແລະຕ່ໍາເພື່ອເອົາອອກ
ຄົນນອກ.
ມິນບິນ = 64; uint ໃນ [1, 256]
ຈຳນວນຂອງຖັງເກັບຂໍ້ມູນ histogram ທີ່ໃຊ້ສຳລັບຮູບພາບເຄື່ອນທີ່.
mkernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
Spline kernel ສໍາລັບການເຄື່ອນຍ້າຍຮູບພາບ hinstogram parzen. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນ
ເບິ່ງ PLUGINS:1d/splinekernel
rbins = 64; uint ໃນ [1, 256]
ຈໍານວນຖັງ histogram ທີ່ໃຊ້ສໍາລັບຮູບພາບອ້າງອີງ.
rkernel = [bspline:d=0]; ໂຮງງານ
Spline kernel ສໍາລັບຮູບພາບອ້າງອີງ parzen hinstogram. ສໍາລັບການສະຫນັບສະຫນູນ plug-
ins ເບິ່ງ PLUGINS:1d/splinekernel
ncc normalized cross correlation ກັບການສະຫນັບສະຫນູນຫນ້າກາກ.
(ບໍ່ມີຕົວກໍານົດການ)
ssd ຜົນລວມຂອງຄວາມແຕກຕ່າງທີ່ຮຽບຮ້ອຍດ້ວຍການເຮັດໜ້າກາກ.
(ບໍ່ມີຕົວກໍານົດການ)
ປລັກອິນ: minimizer/singlecost
gdas Gradient descent ດ້ວຍການແກ້ໄຂຂະໜາດຂັ້ນຕອນອັດຕະໂນມັດ., ຕົວກໍານົດການທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
ftolr = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດເຊົາຖ້າການປ່ຽນແປງຂອງເງື່ອນໄຂແມ່ນຂ້າງລຸ່ມນີ້..
ຂັ້ນຕອນສູງສຸດ = 2; double in (0, inf)
ຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຢ່າງແທ້ຈິງສູງສຸດ.
maxiter = 200; uint ໃນ [1, inf)
ເກນການຢຸດ: ຈຳນວນສູງສຸດຂອງການເຮັດຊ້ຳ.
ຂັ້ນຕອນນາທີ = 0.1; double in (0, inf)
ຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຢ່າງແທ້ຈິງຫນ້ອຍທີ່ສຸດ.
xtola = 0.01; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດຖ້າ inf-norm ຂອງການປ່ຽນແປງທີ່ໃຊ້ກັບ x ແມ່ນຕໍ່າກວ່າຄ່ານີ້..
gdsq Gradient descent ດ້ວຍການປະເມີນຂັ້ນຕອນສີ່ຫຼ່ຽມ, ຕົວກໍານົດການທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
ftolr = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດເຊົາຖ້າການປ່ຽນແປງຂອງເງື່ອນໄຂແມ່ນຂ້າງລຸ່ມນີ້..
gtola = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດຖ້າ inf-norm ຂອງ gradient ຕ່ຳກວ່າຄ່ານີ້..
maxiter = 100; uint ໃນ [1, inf)
ເກນການຢຸດ: ຈຳນວນສູງສຸດຂອງການເຮັດຊ້ຳ.
ຂະຫນາດ = 2; double in (1, inf)
Fallback ການປັບຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຄົງທີ່.
ຂັ້ນຕອນ = 0.1; double in (0, inf)
ຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຕົ້ນ.
xtola = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດຖ້າ inf-norm ຂອງ x-update ຕໍ່າກວ່າຄ່ານີ້..
gsl plugin optimizer ອີງໃສ່ multimin optimizers ຂອງຫ້ອງສະຫມຸດວິທະຍາສາດ GNU
(GSL) https://www.gnu.org/software/gsl/, ຕົວກໍານົດການທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
eps = 0.01; double in (0, inf)
gradient based optimizers: ຢຸດເມື່ອ |grad| < eps, simplex: ຢຸດເມື່ອ
ຂະໜາດ simplex < eps..
ເຮັດຊ້ຳ = 100; uint ໃນ [1, inf)
ຈໍານວນການຊໍ້າຄືນສູງສຸດ.
ເລືອກ = gd; ຄຳສັ່ງ
ການເພີ່ມປະສິດທິພາບສະເພາະທີ່ຈະໃຊ້.. ຄ່າທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
bfgs - Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann
bfgs2 - Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann (ສະບັບທີ່ມີປະສິດທິພາບທີ່ສຸດ)
cg-fr - Flecher-Reeves conjugate algorithm gradient
gd - ການສືບເຊື້ອສາຍ Gradient.
Simplex - ສູດການຄິດໄລ່ທີ່ງ່າຍດາຍຂອງ Nelder ແລະ Mead
cg-pr - Polak-Ribiere conjugate algorithm gradient
ຂັ້ນຕອນ = 0.001; double in (0, inf)
ຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຕົ້ນ.
ຊຸກຍູ້ = 0.1; double in (0, inf)
ຕົວກໍານົດການຄວາມທົນທານບາງ.
nlopt ຂັ້ນຕອນການຫຼຸດຜ່ອນການນໍາໃຊ້ຫ້ອງສະຫມຸດ NLOPT, ສໍາລັບລາຍລະອຽດຂອງ
optimizers ກະລຸນາເບິ່ງ 'http://ab-
initio.mit.edu/wiki/index.php/NLopt_Algorithms ', ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
ftola = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ເງື່ອນໄຂການຢຸດເຊົາ: ການປ່ຽນແປງຢ່າງແທ້ຈິງຂອງມູນຄ່າຈຸດປະສົງຂ້າງລຸ່ມນີ້
ຄ່ານີ້.
ftolr = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ເງື່ອນໄຂການຢຸດເຊົາ: ການປ່ຽນແປງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງຂອງມູນຄ່າຈຸດປະສົງຂ້າງລຸ່ມນີ້
ຄ່ານີ້.
ສູງ = inf; ສອງເທົ່າ
ຂອບເຂດທີ່ສູງກວ່າ (ເທົ່າກັບພາລາມິເຕີທັງໝົດ).
local-opt = none; ຄຳສັ່ງ
ຂັ້ນຕອນການຫຼຸດຜ່ອນທ້ອງຖິ່ນທີ່ອາດຈະຕ້ອງການສໍາລັບຕົ້ນຕໍ
ຂັ້ນຕອນການຫຼຸດຫນ້ອຍລົງ.. ຄ່າທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
gn-orig-direct-l - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ການປະຕິບັດຕົ້ນສະບັບ,
ລຳອຽງໃນທ້ອງຖິ່ນ)
gn-direct-l-noscal - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ບໍ່ໄດ້ຂະຫຍາຍ, ລໍາອຽງໃນທ້ອງຖິ່ນ)
gn-isres - ປັບປຸງຍຸດທະສາດການວິວັດທະນາການຈັດອັນດັບ Stochastic
ld-tnewton - ຕັດນິວຕັນ
gn-direct-l-rand - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ອະຄະຕິໃນທ້ອງຖິ່ນ, Random)
ln-newuoa - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບແບບບໍ່ມີຂໍ້ຈຳກັດແບບອະນຸພັນແບບບໍ່ມີຂໍ້ຈຳກັດໂດຍການເຮັດຊ້ຳ
ການກໍ່ສ້າງປະມານສີ່ຫລ່ຽມ
gn-direct-l-rand-noscale - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ບໍ່ມີຂະຫນາດ, ໃນທ້ອງຖິ່ນ
ລຳອຽງ, ແບບສຸ່ມ)
gn-orig-direct - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ການປະຕິບັດຕົ້ນສະບັບ)
ld-tnewton-precond - Preconditioned Truncated Newton
ld-tnewton-restart - ຕັດນິວຕັນດ້ວຍການເລີ່ມຕົ້ນໃໝ່ທີ່ຊັນທີ່ສຸດ
gn-ໂດຍກົງ - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ
ln-neldermead - ສູດການຄິດໄລ່ Nelder-Mead simplex
ln-cobyla - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບແບບຈຳກັດໂດຍການປະມານເສັ້ນຊື່
gn-crs2-lm - ການຄວບຄຸມການຊອກຫາ Random ກັບການປ່ຽນແປງທ້ອງຖິ່ນ
ld-var2 - Shifted Limited-Memory Variable-Metric, ອັນດັບ 2
ld-var1 - Shifted Limited-Memory Variable-Metric, ອັນດັບ 1
ld-mma - ວິທີການຍ້າຍ Asymptotes
ld-lbfgs-nocedal - ບໍ່ມີ
ld-lbfgs - BFGS ການເກັບຮັກສາຕ່ໍາ
gn-direct-l - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ອະຄະຕິໃນທ້ອງຖິ່ນ)
none - ບໍ່ລະບຸລະບຽບການ
ln-bobyqa - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບທີ່ບໍ່ມີຂອບເຂດຈໍາກັດ Derivative-free
ln-sbplx - ຕົວແປຍ່ອຍຂອງ Nelder-Mead
ln-newuoa-bound - Derivative-free Bound-constrained Optimization ໂດຍ
ປະມານສີ່ຫຼ່ຽມທີ່ສ້າງຂຶ້ນຊ້ຳໆ
ln-praxis - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບໃນທ້ອງຖິ່ນທີ່ບໍ່ມີການປ່ຽນສີຜ່ານ Principal-Axis
ວິທີການ
gn-direct-noscal - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ບໍ່ໄດ້ຂະຫຍາຍ)
ld-tnewton-precond-restart - Preconditioned Truncated Newton ກັບ
restarting steepest-descent
ຕ່ໍາ = -inf; ສອງເທົ່າ
ຂອບເຂດຕ່ໍາ (ເທົ່າກັບພາລາມິເຕີທັງຫມົດ).
maxiter = 100; int ໃນ [1, inf)
ເກນການຢຸດ: ຈຳນວນສູງສຸດຂອງການເຮັດຊ້ຳ.
ເລືອກ = ld-lbfgs; ຄຳສັ່ງ
ຂັ້ນຕອນການຫຼຸດຜ່ອນຕົ້ນຕໍ. ຄ່າທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:
gn-orig-direct-l - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ການປະຕິບັດຕົ້ນສະບັບ,
ລຳອຽງໃນທ້ອງຖິ່ນ)
g-mlsl-lds - ຫຼາຍລະດັບການເຊື່ອມຕໍ່ດຽວ (ລໍາດັບຄວາມແຕກຕ່າງຕ່ໍາ,
ຕ້ອງການການເພີ່ມປະສິດທິພາບໂດຍອີງໃສ່ gradient ທ້ອງຖິ່ນແລະຂອບເຂດ)
gn-direct-l-noscal - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ບໍ່ໄດ້ຂະຫຍາຍ, ລໍາອຽງໃນທ້ອງຖິ່ນ)
gn-isres - ປັບປຸງຍຸດທະສາດການວິວັດທະນາການຈັດອັນດັບ Stochastic
ld-tnewton - ຕັດນິວຕັນ
gn-direct-l-rand - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ອະຄະຕິໃນທ້ອງຖິ່ນ, Random)
ln-newuoa - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບແບບບໍ່ມີຂໍ້ຈຳກັດແບບອະນຸພັນແບບບໍ່ມີຂໍ້ຈຳກັດໂດຍການເຮັດຊ້ຳ
ການກໍ່ສ້າງປະມານສີ່ຫລ່ຽມ
gn-direct-l-rand-noscale - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ບໍ່ມີຂະຫນາດ, ໃນທ້ອງຖິ່ນ
ລຳອຽງ, ແບບສຸ່ມ)
gn-orig-direct - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ການປະຕິບັດຕົ້ນສະບັບ)
ld-tnewton-precond - Preconditioned Truncated Newton
ld-tnewton-restart - ຕັດນິວຕັນດ້ວຍການເລີ່ມຕົ້ນໃໝ່ທີ່ຊັນທີ່ສຸດ
gn-ໂດຍກົງ - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ
auglag-eq - ສູດການຄິດໄລ່ Lagrangian ເພີ່ມຂຶ້ນທີ່ມີຂໍ້ຈໍາກັດຄວາມສະເຫມີພາບ
ພຽງແຕ່
ln-neldermead - ສູດການຄິດໄລ່ Nelder-Mead simplex
ln-cobyla - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບແບບຈຳກັດໂດຍການປະມານເສັ້ນຊື່
gn-crs2-lm - ການຄວບຄຸມການຊອກຫາ Random ກັບການປ່ຽນແປງທ້ອງຖິ່ນ
ld-var2 - Shifted Limited-Memory Variable-Metric, ອັນດັບ 2
ld-var1 - Shifted Limited-Memory Variable-Metric, ອັນດັບ 1
ld-mma - ວິທີການຍ້າຍ Asymptotes
ld-lbfgs-nocedal - ບໍ່ມີ
g-mlsl - ການເຊື່ອມໂຍງແບບດຽວຫຼາຍລະດັບ (ຕ້ອງການການເພີ່ມປະສິດທິພາບໃນທ້ອງຖິ່ນແລະ
ຂອບເຂດ)
ld-lbfgs - BFGS ການເກັບຮັກສາຕ່ໍາ
gn-direct-l - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ອະຄະຕິໃນທ້ອງຖິ່ນ)
ln-bobyqa - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບທີ່ບໍ່ມີຂອບເຂດຈໍາກັດ Derivative-free
ln-sbplx - ຕົວແປຍ່ອຍຂອງ Nelder-Mead
ln-newuoa-bound - Derivative-free Bound-constrained Optimization ໂດຍ
ປະມານສີ່ຫຼ່ຽມທີ່ສ້າງຂຶ້ນຊ້ຳໆ
auglag - ສູດການຄິດໄລ່ Lagrangian ເພີ່ມຂຶ້ນ
ln-praxis - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບໃນທ້ອງຖິ່ນທີ່ບໍ່ມີການປ່ຽນສີຜ່ານ Principal-Axis
ວິທີການ
gn-direct-noscal - ການແບ່ງປັນຮູບສີ່ແຈສາກ (ບໍ່ໄດ້ຂະຫຍາຍ)
ld-tnewton-precond-restart - Preconditioned Truncated Newton ກັບ
restarting steepest-descent
ld-slsqp - ການດໍາເນີນໂຄງການສີ່ຫຼ່ຽມນ້ອຍສຸດຕາມລໍາດັບ
ຂັ້ນຕອນ = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຕົ້ນສໍາລັບວິທີການຟຣີ gradient.
ຢຸດ = -inf; ສອງເທົ່າ
ເກນການຢຸດ: ຄ່າຟັງຊັນຕໍ່າກວ່າຄ່ານີ້.
xtola = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ເກນການຢຸດເຊົາ: ການປ່ຽນແປງຢ່າງແທ້ຈິງຂອງຄ່າ x ທັງໝົດແມ່ນຢູ່ລຸ່ມນີ້
ມູນຄ່າ.
xtolr = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ເກນການຢຸດເຊົາ: ການປ່ຽນແປງຂອງຄ່າ x ທັງໝົດແມ່ນຢູ່ລຸ່ມນີ້
ມູນຄ່າ.
EXAMPLE
ລົງທະບຽນຊຸດ perfusion ທີ່ໃຫ້ໄວ້ໃນ 'segment.set' ໂດຍໃຊ້ການປະເມີນ ICA ອັດຕະໂນມັດ.
ຂ້າມສອງຮູບໃນຕອນເລີ່ມຕົ້ນ ແລະຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນຈະໃຊ້ພາລາມິເຕີເລີ່ມຕົ້ນ. ເກັບຮັກສາ
ຜົນໄດ້ຮັບໃນ 'registered.set'.
mia-2dmyoica-nonrigid-parallel -i segment.set -o register.set -k 2
ຜູ້ຂຽນ
Gert Wollny
COPYRIGHT
ຊອບແວນີ້ແມ່ນລິຂະສິດ (c) 1999-2015 Leipzig, ເຢຍລະມັນແລະ Madrid, ສະເປນ. ມັນມາ
ໂດຍບໍ່ມີການຮັບປະກັນຢ່າງແທ້ຈິງແລະທ່ານສາມາດແຈກຢາຍມັນຄືນໃຫມ່ພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂຂອງ GNU
ໃບອະນຸຍາດສາທາລະນະທົ່ວໄປສະບັບ 3 (ຫຼືຫຼັງຈາກນັ້ນ). ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມດໍາເນີນການໂຄງການທີ່ມີ
ທາງເລືອກ '--ລິຂະສິດ'.
ໃຊ້ mia-2dmyoica-nonrigid-parallel ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ການບໍລິການ onworks.net
