ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ miview ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
miview - ຕົວເບິ່ງໄຟລ໌ຮູບພາບທາງການແພດ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
miview [ ທາງເລືອກໃນການ ]
ລາຍລະອຽດ
miview: Viewer ສໍາລັບໄຟລ໌ຮູບພາບທາງການແພດ
ຮູບແບບໄຟລ໌ຖືກລະບຸໂດຍອັດຕະໂນມັດໂດຍການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ຂອງພວກເຂົາ.
Global ຕົວເລືອກ:
- ລະເບີດ: ຂະຫຍາຍຂະໜາດຈໍສະແດງຜົນຕາມປັດໃຈນີ້ (default=1)
- ສົດໃສ: ຄວາມສະຫວ່າງຂອງຈໍສະແດງຜົນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ = 0.0)
- ສີ: ໃຊ້ແຜນທີ່ສີເພື່ອສະແດງຄ່າ
-ກົງກັນຂ້າມ: ຄວາມຄົມຊັດຂອງການສະແດງຜົນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=0.0)
- ຖິ້ມ: ຖິ້ມຮູບພາບທັງໝົດເປັນໄຟລ໌ bitmap(bmp) ແລະອອກ, ໃຊ້ຄໍານໍາໜ້າຊື່ໄຟລ໌ທີ່ໃຫ້ໄວ້
- ນິທານ: ສົ່ງອອກຄວາມຫມາຍເປັນ bitmap ກັບໄຟລ໌ນີ້
- ຕໍ່າ: ຂອບ windowing ລຸ່ມ: ຄ່ານີ້ຈະປະກົດເປັນສີດຳໃນຈໍສະແດງຜົນ
- ແຜນທີ່: ໂຫຼດແຜນທີ່ຊ້ອນກັນ (voxels ສີໃສ່ໃສ່ຮູບ) ຈາກໄຟລ໌ນີ້
- maplegend: ສົ່ງອອກຄວາມຫມາຍແຜນທີ່ເປັນ bitmap ໄປຫາໄຟລ໌ນີ້
- ແຜນທີ່: ຂອບ windowing ລຸ່ມສໍາລັບແຜນທີ່ overlay (default=0.0)
- ແຜນທີ່: ຂະໜາດສົມທຽບຂອງສີ່ຫຼ່ຽມທີ່ສະແດງເຖິງ voxels ຂອງແຜນທີ່ຊ້ອນກັນ
(ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=0.60)
- ແຜນທີ່: ຂອບປ່ອງຢ້ຽມເທິງສຸດສໍາລັບແຜນທີ່ຊ້ອນກັນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=0.0)
- ບໍ່ມີຂະໜາດ: ປິດການນຳໃຊ້ຂະໜາດໃນຈໍສະແດງຜົນ 2D/3D
- ບັນທຶກ: ບັນທຶກຈຸດປະສານງານ ແລະຄ່າທີ່ຄລິກໃສ່ໃນໄຟລ໌ນີ້
-upp: ຂອບ windowing ເທິງ: ຄ່ານີ້ຈະປາກົດເປັນສີຂາວໃນການສະແດງ
-val: ບັນທຶກມູນຄ່າຂອງການເລືອກ ROI/ຈຸດໃສ່ໄຟລ໌ນີ້
-v ຫຼື ສໍາລັບການແກ້ໄຂ / ການຕິດຕາມອົງປະກອບທັງຫມົດຫຼືດຽວ
ອົງປະກອບ, ຕາມລໍາດັບ. ຄ່າທີ່ເປັນໄປໄດ້ສໍາລັບລະດັບບັນທຶກແມ່ນ: 0(noLog), 1(errorLog),
2(warningLog), 3(ບັນທຶກຂໍ້ມູນ).
fMRI ທາງເລືອກໃນການ (ໃຫ້ at ຢ່າງຫນ້ອຍ -ອອກແບບ ແລະ -fmri to ເປີດໃຊ້):
-bonferr: ໃຊ້ການແກ້ໄຂ Bonferroni
-corr: ຄວາມເປັນໄປໄດ້ຄວາມຜິດພາດເກນສໍາລັບການພົວພັນ (default=0.050)
-davg: ເຮັດໃຫ້ຟັງຊັນການອອກແບບລຽບໂດຍໃຊ້ຕົວກອງສະເລ່ຍເຄື່ອນທີ່ຂອງຄວາມກວ້າງ N (TR)
(ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=0)
-ອອກແບບ: ໂຫຼດການອອກແບບ fMRI ຈາກໄຟລ໌ນີ້ (ເຄື່ອງໝາຍຈຸດ ຫຼື ແຍກຊ່ອງອອກ)
-fmask: ໄຟລ໌ຫນ້າກາກ fMRI
-fmri: ໂຫຼດຂໍ້ມູນ fMRI ຈາກໄຟລ໌ນີ້
-hrf: ການທໍາງານຂອງການອອກແບບ convolve ໂດຍການທໍາງານການຕອບສະຫນອງ hemodynamic ກ່ອນທີ່ຈະ correlation (ເບິ່ງ
Glover NeuroImage 9, 416-429)
- ເພື່ອນບ້ານ: ຕໍາ່ສຸດທີ່ປະເທດເພື່ອນບ້ານຕໍ່ໄປທີ່ມີການເປີດໃຊ້ທີ່ສໍາຄັນ (default=1)
-scourse: Dump relative fMRI signal change time course to this file
-smap: Dump ແຜນທີ່ຂອງສັນຍານ fMRI ພີ່ນ້ອງປ່ຽນກັບໄຟລ໌ນີ້
-zmap: ຖິ້ມແຜນທີ່ z-score ໃສ່ໄຟລ໌ນີ້
-zscore: z-Score threshold ສໍາລັບຄວາມສຳພັນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=0.0)
ເອກະສານ ອ່ານ ຕົວເລືອກ:
- ວັນທີ: ວັນທີຂອງການສະແກນ [yyyymmdd] (default=20140807yyyymmdd)
-fp: FOV ໃນທິດທາງໄລຍະ [mm] (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=220.0mm)
-fr: FOV ໃນທິດທາງການອ່ານ [mm] (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=220.0mm)
-fs: FOV ໃນທິດທາງຂອງຕ່ອນ [mm] (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=5.0mm)
- ບໍ່: ຈຳນວນການວັດແທກຕິດຕໍ່ກັນ (default=1)
-nx: ຈຳນວນຈຸດໃນທິດທາງການອ່ານ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=1)
- ນ: ຈຳນວນຈຸດໃນທິດທາງໄລຍະ (default=1)
-nz: ຈຳນວນຈຸດໃນທິດທາງຂອງສະໄລ້ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=1)
- ການເກີດລູກ: ວັນເດືອນປີເກີດຂອງຄົນເຈັບ [yyyymmdd] (default=00000000yyyymmdd)
-pid: ຕົວລະບຸຄົນເຈັບທີ່ບໍ່ຊໍ້າກັນ (default=Unknown)
- ຊື່: ຊື່ຄົນເຈັບເຕັມ (default=Unknown)
-psex: ເພດຂອງຄົນເຈັບ (ທາງເລືອກ=MFO , default=O)
- ນໍ້າໜັກ: ນ້ຳໜັກຄົນເຈັບ [kg] (default=50.0kg)
- ວິທະຍາສາດ: ຊື່ນັກວິທະຍາສາດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=ບໍ່ຮູ້ຈັກ)
-sd: ໄລຍະຫ່າງລະຫວ່າງກັນ (ຈາກກາງຫາກາງ) [mm] (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=10.0mm)
-serd: ລາຍລະອຽດຊຸດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=ບໍ່ຮູ້ຈັກ)
-serno: ໝາຍເລກຊຸດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=1)
-st: ຄວາມຫນາ Slice [mm] (default=5.0mm)
- stud: ລາຍລະອຽດການສຶກສາ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=ບໍ່ຮູ້ຈັກ)
-tcname: ຊື່ຂອງສາຍສົ່ງ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=ບໍ່ຮູ້ຈັກ)
- ຊາ: Time-to-echo ຂອງລຳດັບ [ms] (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ=80.0ms)
ເວລາ: ເວລາສະແກນ [hhmmss] (default=090951hhmmss)
-tr: ເວລາລະຫວ່າງຄວາມຕື່ນເຕັ້ນຕິດຕໍ່ກັນ [ms] (default=1000.0ms)
-cplx: ປະຕິບັດຂໍ້ມູນເປັນຊັບຊ້ອນ ແລະສະກັດອົງປະກອບທີ່ໃຫ້ໄວ້ (options=none abs pha real
imag , default=none)
-ds: ດັດຊະນີຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ຈະແຍກອອກຖ້າຫາກວ່າຊຸດຂໍ້ມູນຫຼາຍຖືກອ່ານ
-ຕົວກັ່ນຕອງ: ອ່ານສະເພາະຊຸດຂໍ້ມູນເຫຼົ່ານັ້ນທີ່ພາຣາມິເຕີໂປຣໂຕຄໍ 'key' ມີສະຕຣິງ
'ຄ່າ' (ໃຫ້ໃນຮູບແບບ 'key=value')
-fmap: ສໍາລັບການນໍາໃຊ້ຄວາມຊົງຈໍາທີ່ຫຼຸດລົງ, ຮັກສາການວາງແຜນໄຟລ໌ຫຼັງຈາກອ່ານຂໍ້ມູນ (ດິບ), ແຕ່ການຂຽນ
ເຂົ້າໄປໃນ array ຈະສົ່ງຜົນໃຫ້ເກີດອຸປະຕິເຫດ
-jdx: ຖ້າມີອາເຣ JDX ຫຼາຍອັນ, ເລືອກອັນນີ້
- ພາສາ: ອ່ານຂໍ້ມູນໂດຍໃຊ້ພາສາຂອງຮູບແບບ. (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນບໍ່ມີພາສາ)
-rf: ອ່ານຮູບແບບ, ໃຊ້ມັນເພື່ອລົບລ້າງການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ (ທາງເລືອກ = autodetect 3db ວິເຄາະ asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=autodetect)
- ຂ້າມ: ຂ້າມຈໍານວນ bytes ນີ້ກ່ອນທີ່ຈະອ່ານຂໍ້ມູນດິບ (default=0)
ການກັ່ນຕອງ:
- ຈັດວາງ : ຈັດຮຽງຂໍ້ມູນໃສ່ກັບເລຂາຄະນິດ (voxel ສະຖານທີ່) ຂອງ
ໄຟລ໌ພາຍນອກ
- ອັດຕະໂນມັດ : ສ້າງໜ້າກາກໂດຍໃຊ້ຈຸດເລີ່ມຕົ້ນທີ່ອີງໃສ່ histogram ອັດຕະໂນມັດ
- ກຸ່ມ : ສ້າງກຸ່ມຂອງ non-zero adjacent/next-neighbours voxels, ຈັດຮຽງຕາມຂະໜາດ
- convolve <convolution kernel (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ),ເສັ້ນຜ່າສູນກາງແກ່ນ [mm]> : ຄວາມສົມດຸນໃນຂະໜາດທາງກວ້າງຂອງພື້ນ
- ດຶງດູດ <ຈໍານວນຂອງອົງປະກອບຄວາມຖີ່ຕ່ໍາທີ່ຈະເອົາອອກ,ສູນສະເລ່ຍຂອງຜົນໄດ້ຮັບ
timecourse > : ດຶງອອກ drift ຊ້າໃນໄລຍະເວລາ
- ແກ້ໄຂ <ຕຳແໜ່ງ/ໄລຍະສະຕຣິງໃນຮູບແບບ (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),ຄ່າໃໝ່
ຂອງ voxel> : ແກ້ໄຂຄ່າ voxel ດຽວ
- ຫນ້າກາກ : ສ້າງຫນ້າກາກລວມທັງ voxels ທັງຫມົດທີ່ມີຄ່າ
ໃນຂອບເຂດທີ່ໃຫ້
- isotrop : ເຮັດໃຫ້ຮູບພາບ voxels isotrop ໂດຍຜ່ານການ interpolation (ຮູບພາບ
ເລຂາຄະນິດຈະບໍ່ປ່ຽນແປງ)
- ທາງລຸ່ມ : ການກັ່ນຕອງ Lowpass
-ສູງສຸດ : ຕັດຄ່າທັງໝົດຂ້າງເທິງຄ່າສູງສຸດ
-maxip : ປະຕິບັດການຄາດຄະເນຄວາມເຂັ້ມສູງສຸດ
ເໜືອທິດທາງ
- ລວມ : ລວມຊຸດຂໍ້ມູນເຂົ້າໄປໃນຊຸດຂໍ້ມູນດຽວໂດຍການຂະຫຍາຍຂະຫນາດເວລາ
- ນາທີ : ຕັດຄ່າທັງໝົດຕ່ຳກວ່າຄ່າຕໍ່າສຸດ
- ນ້ອຍ : ປະຕິບັດການຄາດຄະເນຄວາມເຂັ້ມຂັ້ນຕໍ່າສຸດ
ເໜືອທິດທາງ
-noNaN : ແທນທີ່ທຸກໆ NaN ດ້ວຍຄ່າທີ່ໃຫ້
-pflip : Flip ຂໍ້ມູນໃນທິດທາງໄລຍະ
- prange : ເລືອກຊ່ວງໃນ
ທິດທາງໄລຍະ
- ໂຄງການ : ປະຕິບັດການຄາດຄະເນຄ່າສະເລ່ຍຫຼາຍກວ່າທີ່ໃຫ້
ທິດທາງ
- ຜ້າປິດປາກ : ສ້າງໜ້າກາກລວມທັງ voxels ທັງໝົດຢູ່ເໜືອເສດສ່ວນທີ່ໃຫ້
threshold
- ຕົວຢ່າງ : ປັບຂະໜາດຂໍ້ມູນຮູບພາບຊົ່ວຄາວ
-ຂະຫນາດ : ປັບຂະໜາດພື້ນທີ່ຂອງຂໍ້ມູນຮູບພາບ
- reslice : relices ຮູບພາບທີ່ໃຫ້
ປະຖົມນິເທດ
-rflip : Flip ຂໍ້ມູນໃນທິດທາງການອ່ານ
- ເນົ່າເປື່ອຍ : ການຫມຸນໃນຍົນ
- ຊ່ວງ : ເລືອກຊ່ວງໃນ
ອ່ານທິດທາງ
- ຂະຫນາດ : ປັບຂະໜາດຄ່າຮູບພາບ
-sflip : ປີ້ນຂໍ້ມູນໃນທິດທາງຂອງຊອຍ
- ປ່ຽນ <read Direction shift [pixel],phaseDirection shift [pixel],sliceDirection shift
[pixel]> : ຍ້າຍຂໍ້ມູນເປັນໄລຍະຫ່າງ
- ເວລາຕັດ : ຖືກຕ້ອງສໍາລັບ
ຈຸດເວລາການຊື້ທີ່ແຕກຕ່າງກັນຂອງຕ່ອນ
- ປະສົມ : splices ໄດ້
ຮູບພາບໃນທິດທາງທີ່ໄດ້ຮັບ
-srange : ເລືອກຊ່ວງໃນ
ຕັດທິດທາງ
- swapdim <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : swap/reflect ມິຕິໂດຍການລະບຸທິດທາງ
triple ພ້ອມກັບເຄື່ອງໝາຍສະທ້ອນທາງເລືອກຕໍ່ທ້າຍ
- ກະເບື້ອງ : ສົມທົບການຊອຍເປັນຮູບສີ່ຫຼ່ຽມມົນທົນ
- ແປກ : ເລືອກຊ່ວງໃນ
ທິດທາງທີ່ໃຊ້ເວລາ
-tshift : ປ່ຽນຂໍ້ມູນໃນເວລາ
-typemax : ຕັດຄ່າທັງໝົດຂ້າງເທິງສູງສຸດຂອງປະເພດຂໍ້ມູນສະເພາະ
- typemin : ຕັດຄ່າທັງໝົດລຸ່ມສຸດຂອງປະເພດຂໍ້ມູນສະເພາະ
- ຫນ້າກາກ : ສ້າງຊຸດຂໍ້ມູນ 1D ລວມທັງຄ່າທັງໝົດພາຍໃນໜ້າກາກຈາກໄຟລ໌
ສະຫນັບສະຫນູນ ເອກະສານ ສ່ວນຂະຫຍາຍ(ຮູບແບບ):
3db (ຂໍ້ມູນຖານສອງ Iris3D)
ວິເຄາະ
(NIFTI/ການວິເຄາະ, ພາສາ: fsl )
asc (ASCII, ພາສາ: tcourse)
coi (ຊຸດຂໍ້ມູນ JCAMP-DX)
dat (ເມທຣິກຂໍ້ມູນ Matlab ascii 2D)
dcm (DICOM, ພາສາ: siemens)
double (ຂໍ້ມູນດິບສອງເທົ່າ)
float (ຂໍ້ມູນດິບທີ່ເລື່ອນໄດ້)
gz (GNU-Zip container ສໍາລັບຮູບແບບອື່ນໆ)
hdr (Interfile, ພາສາ: neurostat)
hdr (NIFTI/ALALYZE, ພາສາ: fsl)
idx (ດັດຊະນີ 3D ຂອງທີ່ບໍ່ແມ່ນສູນໃນ ASCII)
ima (DICOM, ພາສາ: siemens)
ອິນເຕີເຟດ
(Interfile, ພາສາ: neurostat)
jdx (ຮູບແບບຮູບພາບ JCAMP-DX)
mag (DICOM, ພາສາ: siemens)
mhd (MetaImage)
nii (NIFTI/ANALYZE, ພາສາ: fsl)
ph (DICOM, ພາສາ: siemens )
png (ກາຟິກເຄືອຂ່າຍແບບພົກພາ)
pos (ຕໍາແໜ່ງ xy ຂອງທີ່ບໍ່ແມ່ນສູນໃນ ASCII)
pro (ໂປໂຕຄອນການວັດແທກ ODIN)
reg (Ansoft HFSS ASCII)
s16bit (ເຊັນຊື່ຂໍ້ມູນດິບ 16 bit)
s32bit (ເຊັນຊື່ຂໍ້ມູນດິບ 32 bit)
s8bit (ເຊັນຊື່ຂໍ້ມູນດິບ 8 bit)
smp (ຊຸດຂໍ້ມູນ JCAMP-DX)
u16bit (ຂໍ້ມູນດິບ 16 bit ທີ່ບໍ່ໄດ້ເຊັນ)
u32bit (ຂໍ້ມູນດິບ 32 bit ທີ່ບໍ່ໄດ້ເຊັນ)
u8bit (ຂໍ້ມູນດິບ 8 bit ທີ່ບໍ່ໄດ້ເຊັນ)
ໃຊ້ miview ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
