ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ msconvert ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
msconvert - ປ່ຽນຮູບແບບໄຟລ໌ຂໍ້ມູນ spectrometry massive.
ສະຫຼຸບສັງລວມ
msconvert [ທາງເລືອກ] [ໜ້າກາກໄຟລ໌]
ລາຍລະອຽດ
ຫນ້າຄູ່ມືນີ້ເອກະສານສັ້ນໆກ່ຽວກັບ msconvert ຊອບແວທີ່ສົ່ງໄປພາຍໃນ libpwiz-ເຄື່ອງມື
ຊຸດ. ໂຄງການນີ້ອະນຸຍາດໃຫ້ຫນຶ່ງເພື່ອປ່ຽນໄຟລ໌ຂໍ້ມູນ spectrometry ຕັ້ງມະຫາຊົນຈາກຮູບແບບຫນຶ່ງ
ກັບຄົນອື່ນ. ເນື່ອງຈາກວ່າສະບັບນີ້ແມ່ນສ້າງຂຶ້ນໃນເວທີ Debian ຊອບແວຟຣີ, ເທົ່ານັ້ນ
ການປ່ຽນແປງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຊອບແວຟຣີສາມາດໄດ້ຮັບການປະຕິບັດໄດ້ [ນັ້ນແມ່ນ, * ບໍ່ * ມີສ່ວນຮ່ວມຂອງການເປັນເຈົ້າຂອງ
ຫ້ອງສະໝຸດການເຊື່ອມໂຍງແບບເຄື່ອນໄຫວທີ່ອີງໃສ່ Microsoft Windows (dlls)].
OPTIONS
-v | -- verbose
ສະແດງຂໍ້ມູນຄວາມຄືບໜ້າການປະມວນຜົນລະອຽດ.
--help ສະແດງຂໍ້ຄວາມນີ້, ມີລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບຕົວເລືອກການກັ່ນຕອງ.
-f | --filelist ຊື່ເອກະສານ
ໃຊ້ເນື້ອໃນຂອງ ຊື່ເອກະສານ ເຊິ່ງລາຍຊື່ໄຟລ໌.
-o | -- outdir dir
ກໍານົດໄດເລກະທໍລີຜົນຜະລິດ ('-' ສໍາລັບ stdout) ເປັນ dir. ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ, ຜົນຜະລິດ
ໄດເລກະທໍລີແມ່ນ '.' (ນັ້ນແມ່ນ, ໄດເລກະທໍລີທີ່ເຮັດວຽກໃນປະຈຸບັນ).
-c | --config ຊື່ເອກະສານ
ຕັ້ງໄຟລ໌ການຕັ້ງຄ່າເປັນ ຊື່ເອກະສານ.
--outfile ຊື່ເອກະສານ
ລົບລ້າງຊື່ຂອງໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ.
-e | --ຕໍ່ ext
ກໍານົດການຂະຫຍາຍຂອງໄຟລ໌ຜົນຜະລິດໄດ້ ext. ສາມາດເປັນ mzML ຫຼື mzXML ຫຼື mgf ຫຼື
txt.
--mzML ຂຽນ mzML ຮູບແບບ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ).
--mzXML ຂຽນ mzXML ຮູບແບບ.
--mgf ຂຽນ mgf Mascot ຮູບແບບທົ່ວໄປ.
--text ຂຽນ ProteoWizard ພາຍໃນ ຂໍ້ຄວາມ ຮູບແບບ.
--ms1 ຂຽນ MS1 ຮູບແບບ.
--cms1 ຂຽນ CMS1 ຮູບແບບ.
--ms2 ຂຽນ MS2 ຮູບແບບ.
--cms2 ຂຽນ CMS2 ຮູບແບບ.
--64 ຕັ້ງການເຂົ້າລະຫັດຖານສອງໃນຕອນຕົ້ນເປັນຄວາມແມ່ນຍໍາ 64-bit (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ).
--32 ຕັ້ງການເຂົ້າລະຫັດຖານສອງໃນຕອນຕົ້ນເປັນ 32-bit ຄວາມແມ່ນຍໍາ.
--mz64 ເຂົ້າລະຫັດຄ່າ m/z ໃນຄວາມແມ່ນຍໍາ 64-bit (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ).
--mz32 ເຂົ້າລະຫັດຄ່າ m/z ໃນຄວາມແມ່ນຍໍາ 32-bit.
--inten64 ຄ່າຄວາມເຂັ້ມຂອງການເຂົ້າລະຫັດໃນຄວາມແມ່ນຍໍາ 64-bit.
--inten32 ຄ່າຄວາມເຂັ້ມຂອງການເຂົ້າລະຫັດໃນຄວາມແມ່ນຍໍາ 32-bit (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ).
--noindex ຢ່າຂຽນດັດສະນີ.
-i | --ຂໍ້ມູນຕິດຕໍ່ ຊື່ເອກະສານ
ການນໍາໃຊ້ ຊື່ເອກະສານ ສໍາລັບຂໍ້ມູນຕິດຕໍ່.
-z | --zlib
ໃຊ້ການບີບອັດ zlib ສໍາລັບຂໍ້ມູນຖານສອງ.
-g | --gzip
gzip ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທັງໝົດ (ເພີ່ມ .gz ໃສ່ຊື່ໄຟລ໌).
--ການກັ່ນຕອງ arg
ເພີ່ມຕົວກອງລາຍການ spectrum.
--merge ສ້າງໄຟລ໌ຜົນຜະລິດດຽວຈາກຫຼາຍໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນໂດຍການລວມໄຟລ໌ລະດັບ
metadata ແລະ concatenating spectrum lists.
--simAsSpectra
ຂຽນການກວດສອບ ion ທີ່ເລືອກເປັນ spectra, ບໍ່ແມ່ນ chromatograms.
--srmAsSpectra
ຂຽນການຕິດຕາມຕິກິຣິຍາທີ່ເລືອກເປັນ spectra, ບໍ່ແມ່ນ chromatograms.
ຕົວຢ່າງ
ປ່ຽນ data.RAW ເປັນ data.mzXML
msconvert data.RAW --mzXML
ເອົາໄຟລ໌ຜົນຜະລິດໃນ my_output_dir
msconvert data.RAW -o my_output_dir
ສະກັດດັດຊະນີ 5...10 ແລະ 20...25
msconvert data.RAW --ການກັ່ນຕອງ "ດັດຊະນີ [5,10] [ປີ 20,25] "
ສະກັດການສະແກນ MS1 ເທົ່ານັ້ນ
msconvert data.RAW --ການກັ່ນຕອງ "msLevel 1"
ສະກັດການສະແກນ MSn ສໍາລັບ n>1
msconvert data.RAW --ການກັ່ນຕອງ "msLevel 2-"
ໃຊ້ໄຟລ໌ການຕັ້ງຄ່າ
msconvert data.RAW -c config.txt
ກັບຄືນ ມູນຄ່າ
ຈໍານວນໄຟລ໌ທີ່ລົ້ມເຫລວ.
ໃຊ້ msconvert ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
