ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ pymvpa2-mkevds ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
pymvpa2-mkevds - ສະກັດເຫດການ (ຫຼາຍຕົວຢ່າງ) ຈາກຊຸດຂໍ້ມູນ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
pymvpa2 mkevds [- ການປ່ຽນແປງ] [-h] -i DATASET [DATASET ... ] [--event-attrs ATTR [ATTR ... ] |
--ເລີ່ມຕົ້ນ [ເວລາ [ເວລາ ...]] | --csv-ເຫດການ ຊື່ເອກະສານ | --fsl-ev3 ຊື່ເອກະສານ [ຊື່ເອກະສານ ...]]
[--time-attr ATTR] [--onset-ຖັນ ATTR] [-- ຊົດເຊີຍ ມູນຄ່າ] [--ໄລຍະເວລາ ມູນຄ່າ] [--ການແຂ່ງຂັນ-
ແຜນຍຸດທະສາດ {ກ່ອນໜ້າ, ຕໍ່ໄປ, ໃກ້ທີ່ສຸດ}] [--event-compression {mean,median,min,max}] [--add-sa ມູນຄ່າ
[ມູນຄ່າ ...]] [--add-fa ມູນຄ່າ [ມູນຄ່າ ...]] [--add-sa-txt ມູນຄ່າ [ມູນຄ່າ ...]] [--add-fa-txt
ມູນຄ່າ [ມູນຄ່າ ...]] [--add-sa-attr ຊື່ເອກະສານ] [--add-sa-npy ມູນຄ່າ [ມູນຄ່າ ...]] [--add-fa-npy
ມູນຄ່າ [ມູນຄ່າ ...]] -o OUTPUT [--hdf5-ບີບອັດ TYPE]
ລາຍລະອຽດ
ສະກັດເຫດການ (ຫຼາຍຕົວຢ່າງ) ຈາກຊຸດຂໍ້ມູນ
ຈຳນວນຊຸດຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນໂດຍກຳນົດເອງແມ່ນຖືກໂຫລດມາຈາກບ່ອນເກັບຂໍ້ມູນ HDF5. ຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ໂຫລດທັງໝົດແມ່ນ
concatenated ຕາມແກນຕົວຢ່າງ. ອີງຕາມຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບການເລີ່ມຕົ້ນແລະໄລຍະເວລາຂອງ a
ລໍາດັບເຫດການທີ່ສອດຄ້ອງກັນຕົວຢ່າງຖືກສະກັດອອກຈາກຊຸດຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນແລະ
ປ່ຽນເປັນຕົວຢ່າງເຫດການ. ມັນເປັນໄປໄດ້ສໍາລັບຕົວຢ່າງເຫດການທີ່ຈະປະກອບດ້ວຍຫຼາຍ
ຕົວຢ່າງການປ້ອນຂໍ້ມູນ (ເຊັ່ນ: ປ່ອງຢ້ຽມຊົ່ວຄາວ).
ເຫດການແມ່ນຖືກກໍານົດໂດຍ ID ຕົວຢ່າງເລີ່ມຕົ້ນແລະຈໍານວນຕົວຢ່າງຕິດຕໍ່ກັນທີ່ປະກອບດ້ວຍ
ເຫດການ. ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ເຫດການຍັງສາມາດຖືກກໍານົດເປັນການເລີ່ມຕົ້ນຊົ່ວຄາວແລະໄລຍະເວລາ, ເຊິ່ງຈະເປັນ
ແປເປັນ IDs ຕົວຢ່າງໂດຍໃຊ້ຂໍ້ມູນສະແຕມເວລາໃນຊຸດຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນ.
ການປຽບທຽບກັບຄໍາສັ່ງ 'mkds', ຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບເຫດການສາມາດຂະຫຍາຍອອກດ້ວຍຕົວຕົນ.
ຄຸນລັກສະນະແລະຕົວຢ່າງ (ຫນຶ່ງຄ່າຕໍ່ເຫດການສໍາລັບການຫຼັງ).
ຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບເຫດການສໍາເລັດແລ້ວຖືກຂຽນໃສ່ໄຟລ໌ HDF5.
OPTIONS
- ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງສະບັບຂອງໂຄງການແລະຂໍ້ມູນໃບອະນຸຍາດແລະອອກ
-h, - ຊ່ວຍ, --help-np
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ. --help-np ບັງຄັບປິດການນຳໃຊ້ pager
ສໍາລັບການສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອ.
-i DATASET [DATASET...], --ການປ້ອນຂໍ້ມູນ DATASET [DATASET ...]
ເສັ້ນທາງໄປຫາໜຶ່ງ ຫຼືຫຼາຍໄຟລ໌ຊຸດຂໍ້ມູນ PyMVPA. ຊຸດຂໍ້ມູນທັງໝົດຈະຖືກລວມເຂົ້າເປັນ
ຊຸດຂໍ້ມູນດຽວ (vstack'ed) ຕາມລໍາດັບຂອງສະເພາະ. ໃນບາງກໍລະນີທາງເລືອກນີ້ອາດຈະ
ຈໍາເປັນຕ້ອງໄດ້ລະບຸຫຼາຍກວ່າຫນຶ່ງຄັ້ງຖ້າຫາກວ່າຫຼາຍ, ແຕ່ແຍກຕ່າງຫາກ, ຊຸດຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນແມ່ນ
ຕ້ອງການ.
ທາງເລືອກໃນການ ສໍາລັບການ ກໍານົດ ກິດຈະກໍາ (ເລືອກ ຫນຶ່ງ):
--event-attrs ATTR [ATTR ...]
ກໍານົດເຫດການເປັນການລວມຄ່າທີ່ເປັນເອກະລັກຈາກຊຸດຂອງຄຸນລັກສະນະຕົວຢ່າງ.
ໂດຍຜ່ານຕົວຢ່າງທັງຫມົດໃນລໍາດັບທີ່ພວກເຂົາປາກົດຢູ່ໃນຊຸດຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນ,
ການເລີ່ມຕົ້ນຂອງເຫດການແມ່ນຖືກກໍານົດໂດຍການປ່ຽນແປງໃນການປະສົມປະສານຂອງຄຸນຄ່າຂອງຄຸນລັກສະນະ.
ຄວາມຍາວຂອງເຫດການໃດຫນຶ່ງແມ່ນກໍານົດໂດຍຈໍານວນຂອງຄ່າຕິດຕໍ່ກັນທີ່ດຽວກັນ
ການປະສົມ.
--ເລີ່ມຕົ້ນ [TIME [TIME ...]]
ອ່ານບັນຊີລາຍການຂອງເຫດການເລີ່ມຕົ້ນ (ທີ່ເລື່ອນໄດ້) ຈາກບັນຊີຄໍາສັ່ງ (space-separated). ຖ້າ
ຕົວເລືອກນີ້ຖືກມອບໃຫ້, ແຕ່ບໍ່ມີການໂຕ້ຖຽງໃດໆ, ການເລີ່ມຕົ້ນຈະຖືກອ່ານຈາກ STDIN
(ຫນຶ່ງຕໍ່ແຖວ). ຖ້າ --time-attr ແມ່ນໃຫ້, onsets ຈະຖືກຕີຄວາມຫມາຍຕາມເວລາ
ສະແຕມ, ຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນພວກມັນຈະຖືກປະຕິບັດເປັນ ID integer ຂອງຕົວຢ່າງ.
--csv-ເຫດການ ຊື່ເອກະສານ
ອ່ານຂໍ້ມູນເຫດການຈາກຕາຕະລາງ CSV. ຫຼາກຫຼາຍພາສາແມ່ນໄດ້ຮັບການສະໜັບສະໜູນ. CSV
ໄຟລ໌ຕ້ອງມີແຖວຫົວທີ່ມີຊື່ພາກສະຫນາມເປັນແຖວທໍາອິດ. ຕາຕະລາງຕ້ອງ
ປະກອບມີຖັນ 'ເລີ່ມຕົ້ນ', ແລະທາງເລືອກສາມາດປະກອບມີຈໍານວນ arbitrary ຂອງ
ຖັນເພີ່ມເຕີມ (ເຊັ່ນ: ໄລຍະເວລາ, ເປົ້າໝາຍ). ຄ່າທັງຫມົດແມ່ນຖືກສົ່ງໄປຫາ
ຕົວຢ່າງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບເຫດການ. ຖ້າ '-' ຖືກໃຫ້ເປັນຄ່າຕາຕະລາງ CSV ຈະຖືກອ່ານຈາກ STDIN.
--fsl-ev3 FILENAME [FILENAME ...]
ອ່ານຂໍ້ມູນເຫດການຈາກໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມໃນຮູບແບບ EV3 ຂອງ FSL (ເຫດການໜຶ່ງຕໍ່ແຖວ,
ສາມຖັນ: ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄລຍະເວລາ, ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນ). ໜຶ່ງໃນຫຼາຍຊື່ໄຟລ໌ສາມາດໃຫ້ໄດ້.
ທາງເລືອກໃນການ ສໍາລັບການ ການແກ້ໄຂ or ການປ່ຽນແປງ ເຫດການ:
--time-attr ATTR
ຄຸນລັກສະນະຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ມີສະແຕມເວລາສໍາລັບຕົວຢ່າງການປ້ອນຂໍ້ມູນ. ການເລີ່ມຕົ້ນແລະໄລຍະເວລາສໍາລັບທຸກຄົນ
ເຫດການຈະຖືກປ່ຽນໂດຍໃຊ້ຂໍ້ມູນນີ້. ຄ່າທັງໝົດແມ່ນສົມມຸດວ່າເປັນຂອງ
ໜ່ວຍງານດຽວກັນ.
--onset-ຖັນ ATTR
ຊື່ຂອງຖັນໃນຕາຕະລາງເຫດການ CSV ທີ່ຊີ້ໃຫ້ເຫັນເຫດການເລີ່ມຕົ້ນ
-- ຊົດເຊີຍ ມູນຄ່າ
ການຊົດເຊີຍເຫດການເອກະພາບຄົງທີ່ສໍາລັບເຫດການທັງຫມົດ. ຖ້າບໍ່ມີ --time-attr ທາງເລືອກແມ່ນໃຫ້, ນີ້
ຄ່າສະແດງເຖິງຈໍານວນຕົວຢ່າງການປ້ອນຂໍ້ມູນ ເຫດການເລີ່ມຕົ້ນທັງໝົດຈະຖືກປ່ຽນ. ຖ້າ
--time-attr ໄດ້ຖືກມອບໃຫ້, ນີ້ແມ່ນຖືວ່າເປັນການຊົດເຊີຍທາງໂລກທີ່ຕ້ອງໄດ້ຮັບການໃຫ້
ໃນໜ່ວຍດຽວກັນກັບຄຸນລັກສະນະສະແຕມເວລາ (ເບິ່ງ --time-attr).
--ໄລຍະເວລາ ມູນຄ່າ
ກຳນົດໄລຍະເວລາທີ່ເປັນເອກະພາບສຳລັບເຫດການທັງໝົດ. ຖ້າບໍ່ມີ --timeattr ທາງເລືອກແມ່ນໃຫ້, ຄ່ານີ້
ຊີ້ບອກຈໍານວນຂອງຕົວຢ່າງການປ້ອນຂໍ້ມູນຕິດຕໍ່ກັນຫຼັງຈາກການເລີ່ມຕົ້ນທີ່ເປັນຂອງ
ເຫດການ. ຖ້າ --time-attr ແມ່ນໃຫ້, ນີ້ແມ່ນຖືວ່າເປັນໄລຍະເວລາຊົ່ວຄາວທີ່
ຈໍາເປັນຕ້ອງໄດ້ມອບໃຫ້ຢູ່ໃນຫນ່ວຍດຽວກັນກັບຄຸນລັກສະນະສະແຕມເວລາ (ເບິ່ງ --time-attr).
--ຍຸດທະສາດການແຂ່ງຂັນ {ກ່ອນໜ້າ, ຕໍ່ໄປ, ໃກ້ທີ່ສຸດ}
ຍຸດທະສາດທີ່ໃຊ້ເພື່ອຈັບຄູ່ການເລີ່ມຕົ້ນໂດຍອີງໃສ່ເວລາເພື່ອຕົວຢ່າງຕົວຊີ້ວັດ. 'ກ່ອນຫນ້ານີ້' ເລືອກເອົາ
ປິດຕົວຢ່າງກ່ອນໜ້າ, 'ຕໍ່ໄປ' ຕົວຢ່າງຕໍ່ໄປນີ້ທີ່ໃກ້ຄຽງທີ່ສຸດ ແລະ 'ໃກ້ທີ່ສຸດ' ກັບ
ຕົວຢ່າງທີ່ໃກ້ຄຽງທີ່ສຸດ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 'ກ່ອນໜ້າ'
--event-compression {mean,median,min,max}
ລະບຸວ່າເຫດການທີ່ແຜ່ຫຼາຍຕົວຢ່າງການປ້ອນຂໍ້ມູນຈະຖືກບີບອັດແນວໃດ.
ຈໍານວນຂອງວິທີການສາມາດເລືອກ. ສໍາລັບຕົວຢ່າງ, ການເລືອກ 'ຫມາຍຄວາມວ່າ' ຈະໃຫ້ຜົນໄດ້ຮັບ
ຄ່າສະເລ່ຍຂອງຕົວຢ່າງການປ້ອນຂໍ້ມູນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງທັງໝົດສໍາລັບເຫດການໃດໜຶ່ງ. ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ (ເມື່ອທາງເລືອກນີ້ແມ່ນ
ບໍ່ໄດ້ໃຫ້) ເຫດການໃດໜຶ່ງຈະປະກອບດ້ວຍຕົວຢ່າງການປ້ອນຂໍ້ມູນເຂົ້າກັນທັງໝົດ.
ທາງເລືອກໃນການ ສໍາລັບການ attributes ຈາກ ໄດ້ ຄໍາສັ່ງ line:
--add-sa VALUE [VALUE ...]
ປະກອບຄຸນລັກສະນະຕົວຢ່າງຈາກການປ້ອນເສັ້ນຄໍາສັ່ງ. ຄ່າທໍາອິດແມ່ນ
ຊື່ຄຸນລັກສະນະທີ່ຕ້ອງການ, ຄ່າທີສອງແມ່ນລາຍການທີ່ຂັ້ນດ້ວຍເຄື່ອງໝາຍຈຸດ (ຕາມຄວາມເໝາະສົມ
quoted) ຂອງຄຸນຄ່າທີ່ແທ້ຈິງ. ສາມາດໃຫ້ຄ່າທີສາມທີ່ເປັນທາງເລືອກເພື່ອລະບຸ
ປະເພດຂໍ້ມູນ. ຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບການກໍານົດຄຸນລັກສະນະຂອງຊຸດຂໍ້ມູນໃນຄໍາສັ່ງ
ເສັ້ນແມ່ນໃຫ້ຢູ່ໃນພາກ "ປະກອບຄຸນລັກສະນະໃນເສັ້ນຄໍາສັ່ງ.
--add-fa VALUE [VALUE ...]
ປະກອບຄຸນສົມບັດຄຸນສົມບັດຈາກການປ້ອນເສັ້ນຄໍາສັ່ງ. ຄ່າທໍາອິດແມ່ນ
ຊື່ຄຸນລັກສະນະທີ່ຕ້ອງການ, ຄ່າທີສອງແມ່ນລາຍການທີ່ຂັ້ນດ້ວຍເຄື່ອງໝາຍຈຸດ (ຕາມຄວາມເໝາະສົມ
quoted) ຂອງຄຸນຄ່າທີ່ແທ້ຈິງ. ສາມາດໃຫ້ຄ່າທີສາມທີ່ເປັນທາງເລືອກເພື່ອລະບຸ
ປະເພດຂໍ້ມູນ. ຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບການກໍານົດຄຸນລັກສະນະຂອງຊຸດຂໍ້ມູນໃນຄໍາສັ່ງ
ເສັ້ນແມ່ນໃຫ້ຢູ່ໃນພາກ "ປະກອບຄຸນລັກສະນະໃນເສັ້ນຄໍາສັ່ງ.
ທາງເລືອກໃນການ ສໍາລັບການ attributes ຈາກ ຂໍ້ຄວາມ ແຟ້ມ:
--add-sa-txt VALUE [VALUE ...]
ໂຫຼດຄຸນລັກສະນະຕົວຢ່າງຈາກໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມ. ຄ່າທໍາອິດແມ່ນຄຸນລັກສະນະທີ່ຕ້ອງການ
ຊື່, ຄ່າທີສອງແມ່ນຊື່ໄຟລ໌ທີ່ຄຸນລັກສະນະຈະຖືກໂຫລດຈາກ.
ຄ່າເພີ່ມເຕີມແກ້ໄຂວິທີການໂຫຼດຂໍ້ມູນໄດ້ຖືກອະທິບາຍຢູ່ໃນພາກ
"ໂຫຼດຂໍ້ມູນຈາກໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມ".
--add-fa-txt VALUE [VALUE ...]
ໂຫຼດຄຸນສົມບັດຄຸນສົມບັດຈາກໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມ. ຄ່າທໍາອິດແມ່ນຄຸນລັກສະນະທີ່ຕ້ອງການ
ຊື່, ຄ່າທີສອງແມ່ນຊື່ໄຟລ໌ທີ່ຄຸນລັກສະນະຈະຖືກໂຫລດຈາກ.
ຄ່າເພີ່ມເຕີມແກ້ໄຂວິທີການໂຫຼດຂໍ້ມູນໄດ້ຖືກອະທິບາຍຢູ່ໃນພາກ
"ໂຫຼດຂໍ້ມູນຈາກໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມ".
--add-sa-attr ຊື່ເອກະສານ
ໂຫຼດຄ່າຄຸນລັກສະນະຕົວຢ່າງຈາກ 'ໄຟລ໌ຄຸນລັກສະນະ' ແບບເກົ່າ. ຂໍ້ມູນຖັນຖືກອ່ານ
ເປັນ "ຕົວຫນັງສື". ມີພຽງແຕ່ສອງໄຟລ໌ຖັນ ('ເປົ້າຫມາຍ' + 'chunks') ທີ່ບໍ່ມີສ່ວນຫົວ
ສະຫນັບສະຫນູນ. ຕົວເລືອກນີ້ອະນຸຍາດໃຫ້ອ່ານໄຟລ໌ຄຸນລັກສະນະຈາກ PyMVPA ຕົ້ນ
ຮຸ່ນ
ທາງເລືອກໃນການ ສໍາລັບການ attributes ຈາກ ເກັບໄວ້ ເລກ arrays:
--add-sa-npy VALUE [VALUE ...]
ໂຫຼດຕົວຢ່າງຄຸນສົມບັດຈາກໄຟລ໌ Numpy .npy. ໄຟລ໌ທີ່ຖືກບີບອັດ (ie .npy.gz) ແມ່ນ
ສະຫນັບສະຫນູນເຊັ່ນດຽວກັນ. ຄ່າທໍາອິດແມ່ນຊື່ຄຸນລັກສະນະທີ່ຕ້ອງການ, ຄ່າທີສອງ
ແມ່ນຊື່ໄຟລ໌ທີ່ຂໍ້ມູນຈະຖືກໂຫລດມາຈາກ. ມູນຄ່າເພີ່ມເຕີມແກ້ໄຂວິທີການ
ຂໍ້ມູນທີ່ຖືກໂຫຼດແມ່ນໄດ້ອະທິບາຍໃນພາກສ່ວນ "ການໂຫຼດຂໍ້ມູນຈາກໄຟລ໌ NPY Numpy".
--add-fa-npy VALUE [VALUE ...]
ໂຫຼດຄຸນສົມບັດຄຸນສົມບັດຈາກໄຟລ໌ Numpy .npy. ໄຟລ໌ທີ່ຖືກບີບອັດ (ie .npy.gz) ແມ່ນ
ສະຫນັບສະຫນູນເຊັ່ນດຽວກັນ. ຄ່າທໍາອິດແມ່ນຊື່ຄຸນລັກສະນະທີ່ຕ້ອງການ, ຄ່າທີສອງ
ແມ່ນຊື່ໄຟລ໌ທີ່ຂໍ້ມູນຈະຖືກໂຫລດມາຈາກ. ມູນຄ່າເພີ່ມເຕີມແກ້ໄຂວິທີການ
ຂໍ້ມູນທີ່ຖືກໂຫຼດແມ່ນໄດ້ອະທິບາຍໃນພາກສ່ວນ "ການໂຫຼດຂໍ້ມູນຈາກໄຟລ໌ NPY Numpy".
ຜົນຜະລິດ ຕົວເລືອກ:
-o ອອກ, -- ຜົນຜະລິດ OUTPUT
output filename (ນາມສະກຸນ '.hdf5' ຈະຖືກເພີ່ມໂດຍອັດຕະໂນມັດຖ້າຈໍາເປັນ). ຫມາຍເຫດ: ໄດ້
ຮູບແບບຜົນຜະລິດແມ່ນເຫມາະສົມສໍາລັບການແລກປ່ຽນຂໍ້ມູນລະຫວ່າງຄໍາສັ່ງ PyMVPA, ແຕ່ບໍ່ແມ່ນ
ແນະນໍາໃຫ້ເກັບຮັກສາໃນໄລຍະຍາວຫຼືການແລກປ່ຽນເນື່ອງຈາກວ່າເນື້ອໃນສະເພາະຂອງມັນອາດຈະແຕກຕ່າງກັນ
ຂຶ້ນກັບສະພາບແວດລ້ອມຂອງຊອບແວຕົວຈິງ. ສໍາລັບການເກັບຮັກສາໃນໄລຍະຍາວພິຈາລະນາ
ການປ່ຽນເປັນຮູບແບບຂໍ້ມູນອື່ນໆ (ເບິ່ງຄໍາສັ່ງ 'dump').
--hdf5-ບີບອັດ TYPE
ປະເພດການບີບອັດສໍາລັບການເກັບຮັກສາ HDF5. ຄ່າທີ່ມີຢູ່ແມ່ນຂຶ້ນກັບ HDF5 ສະເພາະ
ການຕິດຕັ້ງ. ຄ່າປົກກະຕິແມ່ນ: 'gzip', 'lzf', 'szip', ຫຼືຈຳນວນເຕັມຈາກ 1 ຫາ 9
ຊີ້ບອກລະດັບການບີບອັດ gzip.
ຕົວຢ່າງ
ສະກັດສອງເຫດການທີ່ປະກອບດ້ວຍສີ່ຕົວຢ່າງຕິດຕໍ່ກັນຈາກຊຸດຂໍ້ມູນ.
$ pymvpa2 mkevds --onsets 3 9 --duration 4 -o evds.hdf5 -i 'mydata*.hdf5'
ໃຊ້ pymvpa2-mkevds ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
