ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ 123NGS ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ 123Fastq_v1.1.rar. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ 123NGS ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
123NGS
ລາຍລະອຽດ
123Fastq, ໃນຖານະສະມາຊິກທໍາອິດຂອງຄອບຄົວ 123NGS, ປະຕິບັດຂະບວນການກ່ອນຫນ້າທັງຫມົດປະມານການອ່ານລໍາດັບຮຸ່ນຕໍ່ໄປ (ໄຟລ໌ FASTQ) ງ່າຍກວ່າທີ່ເຄີຍຢູ່ໃນພາກສະຫນາມຂອງເຄື່ອງມືແຫຼ່ງເປີດ.ດາວໂຫລດຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ດ່ວນ:
http://bit.ly/36uoA2C
ວຽກງານນີ້ໄດ້ຖືກປະຕິບັດພາຍໃຕ້ການຊີ້ນໍາຂອງ
Dr.Javad Zahiri, Bioinformatics and Computational Omics Lab (BioCOOL)
ແລະ
Dr.Masoud Garshasbi, ພະແນກພັນທຸກໍາທາງການແພດ, ຄະນະວິທະຍາສາດການແພດ, ມະຫາວິທະຍາໄລ Tarbiat Modares, ເຕຫະຣ່ານ, ອີຣ່ານ.
ຄຸນລັກສະນະ
- ລໍາດັບລຸ້ນຕໍ່ໄປອ່ານການກວດສອບຄຸນນະພາບ
- ການກວດສອບຄຸນນະພາບຂອງການອ່ານຄູ່
- trimmer ຢືດຢຸ່ນ
- ຕັດຄໍາແນະນໍາໂດຍອີງໃສ່ຜົນການກວດສອບຄຸນນະພາບ
- ອະແດບເຕີ decontamination ໂດຍສອງວິທີການ
- ການປ່ຽນ Fast5 ເປັນ FASTQ
- ການປ່ຽນ SAM/BAM ເປັນ FASTQ
- Demultiplexing FASTQ ອ່ານ
- ຂ້າມເວທີ (unix, windows)
- ຂຽນໃນ java
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
Java Swing
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Java
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/project-123ngs/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.