ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ Alphafold ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ Alphafoldv2.3.2.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ Alphafold ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
Alphafold
ລາຍລະອຽດ
ຊຸດນີ້ສະຫນອງການປະຕິບັດຂອງທໍ່ inference ຂອງ AlphaFold v2.0. ນີ້ແມ່ນຮູບແບບໃຫມ່ຫມົດທີ່ໄດ້ເຂົ້າໄປໃນ CASP14 ແລະຈັດພີມມາໃນທໍາມະຊາດ. ສໍາລັບຄວາມງ່າຍດາຍ, ພວກເຮົາອ້າງເຖິງຮູບແບບນີ້ເປັນ AlphaFold ຕະຫຼອດສ່ວນທີ່ເຫຼືອຂອງເອກະສານນີ້. ສິ່ງພິມໃດໆກໍຕາມທີ່ເປີດເຜີຍຜົນການຄົ້ນພົບທີ່ເກີດຈາກການໃຊ້ລະຫັດແຫຼ່ງນີ້ ຫຼືຕົວກໍານົດການຂອງຕົວແບບຄວນອ້າງເຖິງເຈ້ຍ AlphaFold. ກະລຸນາອ້າງອີງເຖິງຂໍ້ມູນເສີມສຳລັບລາຍລະອຽດຂອງວິທີການ. ທ່ານສາມາດໃຊ້ AlphaFold ສະບັບທີ່ງ່າຍດາຍເລັກນ້ອຍກັບປື້ມບັນທຶກ Colab ນີ້ຫຼືສະບັບທີ່ສະຫນັບສະຫນູນຊຸມຊົນ. ຂະໜາດການດາວໂຫຼດທັງໝົດສຳລັບຖານຂໍ້ມູນເຕັມແມ່ນປະມານ 415 GB ແລະຂະໜາດທັງໝົດເມື່ອ unzipped ແມ່ນ 2.2 TB. ກະລຸນາໃຫ້ແນ່ໃຈວ່າທ່ານມີພື້ນທີ່ຮາດດິດຂະຫນາດໃຫຍ່ພຽງພໍ, ແບນວິດແລະເວລາທີ່ຈະດາວໂຫລດ. ພວກເຮົາແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ SSD ສໍາລັບການປະຕິບັດການຊອກຫາທາງພັນທຸກໍາທີ່ດີກວ່າ.
ຄຸນລັກສະນະ
- AlphaFold ຕ້ອງການຖານຂໍ້ມູນພັນທຸກໍາ (ລໍາດັບ) ຫຼາຍເພື່ອດໍາເນີນການ
- ໃນຂະນະທີ່ລະຫັດ AlphaFold ໄດ້ຖືກອະນຸຍາດພາຍໃຕ້ Apache 2.0 License, ຕົວກໍານົດການ AlphaFold ແມ່ນມີໃຫ້ສໍາລັບການນໍາໃຊ້ທີ່ບໍ່ແມ່ນການຄ້າ.
- 5 ຕົວແບບທີ່ຖືກນໍາໃຊ້ໃນລະຫວ່າງ CASP14, ແລະໄດ້ຮັບການຢັ້ງຢືນຢ່າງກວ້າງຂວາງສໍາລັບຄຸນນະພາບການຄາດຄະເນໂຄງສ້າງ
- 5 ຕົວແບບ pTM, ເຊິ່ງໄດ້ຖືກປັບລະອຽດເພື່ອຜະລິດ pTM
- ວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດທີ່ຈະດໍາເນີນການ AlphaFold ແມ່ນການໃຊ້ Docker script ທີ່ສະຫນອງໃຫ້
- ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ, Alphafold ຈະພະຍາຍາມໃຊ້ອຸປະກອນ GPU ທີ່ເຫັນໄດ້ທັງໝົດ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
