ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ BLAST Ring Image Generator ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ BRIG-0.95-dist.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ BLAST Ring Image Generator ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
ຜູ້ຜະລິດຮູບພາບວົງ BLAST
ລາຍລະອຽດ
BRIG ເປັນແອັບພລິເຄຊັນຂ້າມແພລດຟອມ (Windows/Mac/Unix) ທີ່ສາມາດສະແດງການປຽບທຽບແບບວົງກົມລະຫວ່າງ genomes ຈໍານວນຫລາຍ, ໂດຍເນັ້ນໃສ່ການຈັດການຂໍ້ມູນການປະກອບ genome.ກະລຸນາອ້າງເຖິງເຈ້ຍ BRIG ຖ້າ BRIG ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອສ້າງຕົວເລກສໍາລັບສິ່ງພິມ: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): ການປຽບທຽບ genome prokaryote ງ່າຍໆ, BMC Genomics, 12:402. PMID: 21824423
ຄຸນລັກສະນະ
- ຮູບພາບສະແດງໃຫ້ເຫັນຄວາມຄ້າຍຄືກັນລະຫວ່າງລໍາດັບການອ້າງອິງກາງແລະລໍາດັບອື່ນໆທີ່ເປັນວົງແຫວນທີ່ຕັ້ງໄວ້.
- BRIG ຈະປະຕິບັດການປຽບທຽບ BLAST ທັງໝົດ ແລະການວິເຄາະໄຟລ໌ໂດຍອັດຕະໂນມັດຜ່ານ GUI ງ່າຍໆ.
- ຂອບເຂດ contig ແລະການຄຸ້ມຄອງການອ່ານສາມາດສະແດງໄດ້ສໍາລັບ genomes ຮ່າງ; ກຣາຟແລະຄໍາບັນຍາຍທີ່ກໍາຫນົດເອງສາມາດສະແດງໄດ້.
- ການນໍາໃຊ້ຊຸດ genes ທີ່ກໍານົດໂດຍຜູ້ໃຊ້ເປັນການປ້ອນຂໍ້ມູນ, BRIG ສາມາດສະແດງການມີ gene, ບໍ່ມີ, ການຕັດອອກຫຼືການປ່ຽນແປງລໍາດັບໃນຊຸດຂອງ genomes ຄົບຖ້ວນ, genomes ສະບັບຮ່າງຫຼືແມ້ກະທັ້ງວັດຖຸດິບ, unassembled ຂໍ້ມູນລໍາດັບ.
- BRIG ຍັງຍອມຮັບໄຟລ໌ແຜນທີ່ການອ່ານທີ່ມີຮູບແບບ SAM ທີ່ເຮັດໃຫ້ພາກພື້ນ genomic ທີ່ມີຢູ່ໃນຂໍ້ມູນລໍາດັບທີ່ບໍ່ໄດ້ປະກອບມາຈາກຫຼາຍຕົວຢ່າງເພື່ອປຽບທຽບພ້ອມກັນ.
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Java
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/brig/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
