ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ High-Throughput Tabular Data Processor ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ htdpinstaller.exe. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ວ່າການປຸງແຕ່ງຂໍ້ມູນສູງຜ່ານ Tabular ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
ໂປເຊດເຊີຂໍ້ມູນ Tabular ຜ່ານທາງສູງ
ລາຍລະອຽດ
HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR (HTDP) ແມ່ນຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ Java ທີ່ມີຈຸດປະສົງເພື່ອອໍານວຍຄວາມສະດວກໃນການສໍາຫຼວດຂໍ້ມູນແລະຫຼຸດຜ່ອນວຽກງານໃນໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມຂະຫນາດໃຫຍ່ທີ່ເປັນຜົນມາຈາກເຕັກໂນໂລຢີທີ່ສູງ, ເຊັ່ນ: ລໍາດັບຂະຫນານຫຼາຍຫຼື microarrays. ຊອບແວໄດ້ຖືກປັບປຸງໃຫ້ເໝາະສົມສຳລັບຂໍ້ມູນການຈັດລຳດັບ microarray ແລະຂະໜານເລິກ, ແນວໃດກໍ່ຕາມ, ມັນສາມາດຮັບເອົາຊຸດຂໍ້ມູນຕາຕະລາງທີ່ຂັ້ນດ້ວຍຕົວອັກສອນໃດນຶ່ງ. HTDP ຍັງສາມາດນໍາເຂົ້າ, ປຸງແຕ່ງແລະປ່ຽນຮູບແບບການໂທຕົວແປ (VCF) ໄຟລ໌ ver. 4.0, 4.1 ແລະ 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HDP ສະໜອງການທໍາງານການກັ່ນຕອງໄວ ແລະສາມາດປະມວນຜົນຂໍ້ມູນປະກອບດ້ວຍໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນດຽວ ຫຼືຫຼາຍໄຟລ໌.
ການອ້າງອີງ: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) ໂປເຊດເຊີຂໍ້ມູນ Tabular ທີ່ມີຄວາມໄວສູງ - ເຄື່ອງມືກຣາຟິກທີ່ເປັນເອກະລາດຂອງເວທີສໍາລັບການປະມວນຜົນຊຸດຂໍ້ມູນຂະຫນາດໃຫຍ່. PLoS ONE 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
ຄຸນລັກສະນະ
- ເຮັດວຽກກ່ຽວກັບຂໍ້ມູນຖັນທີ່ຈໍາກັດຕົວອັກສອນ (ເຊັ່ນ BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- ຮວມໄຟລ໌ຂໍ້ມູນຕາຕະລາງຕາມແນວຕັ້ງ ແລະແນວນອນ
- ຮວມໄຟລ໌ຂໍ້ມູນຕາຕະລາງໃດໜຶ່ງໂດຍໃຊ້ສະຖານທີ່ຂອງ genome ຫຼືຖັນທົ່ວໄປ
- ການກັ່ນຕອງບໍ່ຈໍາກັດແລະຄວາມສາມາດໃນການຫຼຸດຜ່ອນຂໍ້ມູນ
- ໄຟລ໌ທີ່ແຕກຕ່າງກັນກ່ຽວກັບຮູບແບບແລະເນື້ອຫາສາມາດຖືກວິເຄາະໃນເວລາດຽວກັນ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Java
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/htdp/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
