ພາສາອັງກິດພາສາຝຣັ່ງແອສປາໂຍນ

Ad


OnWorks favicon

iMSAT ເພື່ອແລ່ນຢູ່ໃນ Linux ດາວໂຫຼດອອນໄລນ໌ສໍາລັບ Linux

ດາວໂຫຼດ iMSAT ຟຣີເພື່ອແລ່ນໃນແອັບ Linux ອອນໄລນ໌ Linux ເພື່ອແລ່ນອອນໄລນ໌ໃນ Ubuntu ອອນໄລນ໌, Fedora ອອນໄລນ໌ ຫຼື Debian ອອນໄລນ໌

ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ iMSAT ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ SSRs.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.

ດາວ​ນ​໌​ໂຫລດ​ແລະ​ດໍາ​ເນີນ​ການ​ອອນ​ໄລ​ນ​໌ app ນີ້​ມີ​ຊື່ iMSAT ເພື່ອ​ດໍາ​ເນີນ​ການ​ໃນ Linux ອອນ​ໄລ​ນ​໌​ກັບ OnWorks ໄດ້​ຟຣີ​.

ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:

- 1. ດາວ​ໂຫຼດ​ຄໍາ​ຮ້ອງ​ສະ​ຫມັກ​ນີ້​ໃນ PC ຂອງ​ທ່ານ​.

- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.

- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.

- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.

- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.

- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.

ໜ້າ ຈໍ

Ad


iMSAT ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌


ລາຍລະອຽດ

iMSAT ເປັນຕົວແທນຂອງການປັບປຸງອັນເຕັມທີ່ຂອງໂຄງການ vcf2MSAT. ໂປຣແກຣມ python ເສັ້ນຄໍາສັ່ງນີ້ອະນຸຍາດໃຫ້ຜູ້ໃຊ້ໃຊ້ຂໍ້ມູນ polymorphism ທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍໃຊ້ SAM- ແລະ BAM-tools ແລະໄຟລ໌ການຈັດຕໍາແຫນ່ງ .fasta ເພື່ອຊອກຫາເຄື່ອງຫມາຍ microsatellite polymorphic (MSATs ຫຼື STRs). ໂດຍການກໍານົດຜູ້ຜະລິດ polymorphic, ແທນທີ່ຈະເປັນພື້ນທີ່ຊ້ໍາຊ້ອນທີ່ໂຄງການທີ່ຜ່ານມາໄດ້ເຮັດ, iMSAT ເພີ່ມຄວາມໄວຢ່າງຫຼວງຫຼາຍທີ່ MSATs polymorphic ທີ່ສາມາດຖືກກໍານົດ - ປະຫຍັດເວລາແລະເງິນຂອງນັກຄົ້ນຄວ້າ. ຢ້ຽມຢາມ http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract ສໍາລັບບົດຄວາມ pdf ທີ່ອະທິບາຍເຖິງຜົນປະໂຫຍດຂອງ iMSAT ແລະຖ້າທ່ານໃຊ້ໂປລແກລມກະລຸນາອ້າງເຖິງບົດຄວາມນີ້ຄື: Andersen ແລະ Mills: iMSAT: ວິທີການໃຫມ່ໃນການພັດທະນາຂອງ microsatellite loci ໂດຍໃຊ້ barcoded Illumina libraries. BMC Genomics 2014 15:858.

ຄຸນ​ລັກ​ສະ​ນະ

  • ການລະບຸຕົວຕົນຂອງດາວທຽມ Polymorphic
  • ການຈັດລໍາດັບ Illumina
  • ການວິເຄາະທາງພັນທຸກໍາ


Audience

ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ


ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້

ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ


ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ

Python



ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/imsat/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.


Ad