ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ iMSAT ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ SSRs.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ iMSAT ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
iMSAT ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌
ລາຍລະອຽດ
iMSAT ເປັນຕົວແທນຂອງການປັບປຸງອັນເຕັມທີ່ຂອງໂຄງການ vcf2MSAT. ໂປຣແກຣມ python ເສັ້ນຄໍາສັ່ງນີ້ອະນຸຍາດໃຫ້ຜູ້ໃຊ້ໃຊ້ຂໍ້ມູນ polymorphism ທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍໃຊ້ SAM- ແລະ BAM-tools ແລະໄຟລ໌ການຈັດຕໍາແຫນ່ງ .fasta ເພື່ອຊອກຫາເຄື່ອງຫມາຍ microsatellite polymorphic (MSATs ຫຼື STRs). ໂດຍການກໍານົດຜູ້ຜະລິດ polymorphic, ແທນທີ່ຈະເປັນພື້ນທີ່ຊ້ໍາຊ້ອນທີ່ໂຄງການທີ່ຜ່ານມາໄດ້ເຮັດ, iMSAT ເພີ່ມຄວາມໄວຢ່າງຫຼວງຫຼາຍທີ່ MSATs polymorphic ທີ່ສາມາດຖືກກໍານົດ - ປະຫຍັດເວລາແລະເງິນຂອງນັກຄົ້ນຄວ້າ. ຢ້ຽມຢາມ http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract ສໍາລັບບົດຄວາມ pdf ທີ່ອະທິບາຍເຖິງຜົນປະໂຫຍດຂອງ iMSAT ແລະຖ້າທ່ານໃຊ້ໂປລແກລມກະລຸນາອ້າງເຖິງບົດຄວາມນີ້ຄື: Andersen ແລະ Mills: iMSAT: ວິທີການໃຫມ່ໃນການພັດທະນາຂອງ microsatellite loci ໂດຍໃຊ້ barcoded Illumina libraries. BMC Genomics 2014 15:858.ຄຸນລັກສະນະ
- ການລະບຸຕົວຕົນຂອງດາວທຽມ Polymorphic
- ການຈັດລໍາດັບ Illumina
- ການວິເຄາະທາງພັນທຸກໍາ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/imsat/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
