ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ MCPerm: Monte Carlo SNP permutation ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ MCPerm_1.1.2.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ MCPerm: Monte Carlo SNP permutation ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
MCPerm: ການປ່ຽນແປງຂອງ Monte Carlo SNP
Ad
ລາຍລະອຽດ
MCPerm: ວິທີການ permutation Monte Carlo ສໍາລັບການເຊື່ອມໂຍງການທົດສອບຫຼາຍໃນການສຶກສາສະມາຄົມການຄວບຄຸມກໍລະນີ
ການທົດສອບການປ່ຽນແປງແບບດັ້ງເດີມ (TradPerm) ແມ່ນວິທີການວິເຄາະທີ່ບໍ່ແມ່ນ parametric ທີ່ສໍາຄັນທີ່ສາມາດປະຕິບັດເປັນມາດຕະຖານຄໍາສໍາລັບການແກ້ໄຂການທົດສອບຫຼາຍໃນການສຶກສາສະມາຄົມຄວບຄຸມກໍລະນີ. ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ມັນອີງໃສ່ genotypes ແລະຂໍ້ມູນ phenotypes nucleotide ດຽວຕົ້ນສະບັບ (SNP) ເພື່ອປະຕິບັດການສຸ່ມແບບສຸ່ມຈໍານວນຫລາຍ, ແລະດັ່ງນັ້ນມັນຈຶ່ງມີຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນທາງດ້ານການຄໍານວນ, ໂດຍສະເພາະສໍາລັບການສຶກສາສະມາຄົມ genome-wide (GWAS). ເພື່ອປັບປຸງຄວາມໄວການຄິດໄລ່ໂດຍບໍ່ມີການປ່ຽນແປງຂະຫນາດຂອງ TradPerm p-value, ພວກເຮົາໄດ້ພັດທະນາວິທີການ Monte Carlo permutation (MCPerm) ເປັນທາງເລືອກທີ່ມີປະສິດທິພາບຂອງ TradPerm.
ວິທີການ: MCPerm ບໍ່ຈໍາເປັນຕ້ອງ shuffle ຂໍ້ມູນ genotypes ແລະ phenotypes ຕົ້ນສະບັບ. ມັນໃຊ້ວິທີການ Monte Carlo, ໃຊ້ການແຈກຢາຍ hypergeometric ສອງຂັ້ນຕອນເພື່ອສ້າງຈໍານວນ Random ຂອງ genotypes (AA, Aa ແລະ aa) ໃນກໍລະນີແລະການຄວບຄຸມ.
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
S/R
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/mcperm/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
