ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ MITP ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ MITP-1.1.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ MITP ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
MITP
ລາຍລະອຽດ
miRNA ເປັນ RNA ທີ່ບໍ່ແມ່ນລະຫັດຂະຫນາດນ້ອຍທີ່ຮູ້ຈັກກັນຢ່າງກວ້າງຂວາງເຊິ່ງສາມາດໄກ່ເກ່ຍລະບຽບ gene ຂອງຂະບວນການທາງຊີວະພາບທີ່ສໍາຄັນທີ່ສຸດໃນພືດແລະສັດ. ດັ່ງນັ້ນ, ການກໍານົດການອະນຸລັກແລະ miRNA ໃຫມ່ແລະພັນທຸກໍາເປົ້າຫມາຍຂອງພວກມັນຢູ່ໃນຕົວແບບແລະສາຍພັນໃຫມ່ແມ່ນຫລີກລ້ຽງບໍ່ໄດ້. MITP ຖືກອອກແບບມາເພື່ອລະບຸ miRNA ໄດ້ງ່າຍ ແລະໄວຂຶ້ນໂດຍອີງໃສ່ຜົນແຜນທີ່ຕາມລໍາດັບຈາກຊອບແວແຜນທີ່ທີ່ຜະລິດຜົນອອກຂອງຮູບແບບ SAM, ຜົນໄດ້ຮັບ blast (ຜົນອອກໃນຕອນຕົ້ນ) ຫຼືຜົນໄດ້ຮັບ blat (ຜົນໄດ້ຮັບເລີ່ມຕົ້ນ). ໂຄງການດັ່ງກ່າວສະຫນອງການ praramter ຂັ້ນຕອນທີ (8 ຂັ້ນຕອນ) ທີ່ສາມາດອະນຸຍາດໃຫ້ໂຄງການແລ່ນຈາກຂັ້ນຕອນໃດຫນຶ່ງແລະສໍາເລັດທຸກຂັ້ນຕອນທີ່ຍັງເຫຼືອ. ນອກນັ້ນທ່ານຍັງສາມາດດໍາເນີນການຂັ້ນຕອນໂດຍຂັ້ນຕອນໂດຍໃຊ້ແຕ່ລະໂຄງການຂັ້ນຕອນ. ກະລຸນາດໍາເນີນການໂຄງການຂັ້ນຕອນເຫຼົ່ານີ້ຢູ່ໃນໄດເລກະທໍລີດຽວກັນສໍາລັບການແລ່ນໂຄງການຕົ້ນຕໍ MITP.pl. ບາງຂັ້ນຕອນແມ່ນທາງເລືອກ (ອ່ານການກັ່ນຕອງ, ການສະແດງອອກ, ຫ້ອງຮຽນ miRNA ແລະເປົ້າຫມາຍ). ເມື່ອທ່ານເລືອກຕົວກໍານົດການທີ່ກ່ຽວຂ້ອງເປັນຂອງຂັ້ນຕອນທາງເລືອກເຫຼົ່ານີ້, ໂຄງການຈະດໍາເນີນຂັ້ນຕອນເຫຼົ່ານີ້. ຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນ, ມັນຂ້າມຂັ້ນຕອນເຫຼົ່ານີ້.
ຄຸນລັກສະນະ
- ກໍານົດການອະນຸລັກ miRNA ອີງຕາມຜົນໄດ້ຮັບ BLAST ລະຫວ່າງ miRNA ທີ່ຮູ້ຈັກແລະລໍາດັບ genome
- ກໍານົດ miRNA ໃຫມ່ໂດຍອີງໃສ່ຜົນໄດ້ຮັບການຈັດຕໍາແຫນ່ງໃນ BLAST output ເລີ່ມຕົ້ນ, ຜົນໄດ້ຮັບ BLAT ຫຼືໄຟລ໌ຮູບແບບ SAM
- ກໍານົດພາກພື້ນ RNA ຂອງ Samll
- ຄາດເດົາພັນທຸກໍາຂອງ miRNA
- ປຽບທຽບ miRNA ໃນຊະນິດຕ່າງໆ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Perl
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/mitp/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
