เบเบตเปเปเบกเปเบเปเบญเบฑเบ Linux เบเบตเปเบกเบตเบเบทเปเบงเปเบฒ PASHA: Parallelized Short Read Assembly เปเบเบดเปเบเบฅเบธเปเบเบซเบผเปเบฒเบชเบธเบเบชเบฒเบกเบฒเบเบเบฒเบงเปเบซเบผเบเปเบเปเปเบเบเบฒเบก Pasha-1.0.10.tar.bz2. เบกเบฑเบเบชเบฒเบกเบฒเบเบเปเบฒเปเบเบตเบเบเบฒเบเบญเบญเบเปเบฅเบเปเบขเบนเปเปเบเบเบนเปเปเบซเปเบเปเบฅเบดเบเบฒเบเปเบฎเบเบเบดเปเบเบเบฃเบต OnWorks เบชเปเบฒเบฅเบฑเบเบชเบฐเบเบฒเบเบตเปเบฎเบฑเบเบงเบฝเบ.
เบเบฒเบงโเบโเปโเปเบซเบฅเบโเปเบฅเบฐโเบเปเบฒโเปเบเบตเบโเบเบฒเบโเบญเบญเบโเปเบฅโเบโเป app เบเบตเปโเบกเบตโเบเบทเป PASHAโ: Parallelized Short Read Assembly เบเบฑเบ OnWorks เปเบเปโเบเบฃเบตโ.
เบเบฐเบเบดเบเบฑเบเบเบฒเบกเบเปเบฒเปเบเบฐเบเปเบฒเปเบซเบผเบปเปเบฒเบเบตเปเปเบเบทเปเบญเบเปเบฒเปเบเบตเบเบเบฒเบ app เบเบตเป:
- 1. เบเบฒเบงโเปเบซเบผเบโเบเปเบฒโเบฎเปเบญเบโเบชเบฐโเบซเบกเบฑเบโเบเบตเปโเปเบ PC เบเบญเบโเบเปเบฒเบโ.
- 2. เปเบชเปเปเบเบเบปเบงเบเบฑเบเบเบฒเบเปเบเบฅเปเบเบญเบเบเบงเบเปเบฎเบปเบฒ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX เบเปเบงเบเบเบทเปเบเบนเปเปเบเปเบเบตเปเบเปเบฒเบเบเปเบญเบเบเบฒเบ.
- 3. เบญเบฑเบเปเบซเบฅเบเปเบญเบฑเบเบเบฅเบดเปเบเบเบฑเบเบเบตเปเบขเบนเปเปเบเบเบปเบงเบเบฑเบเบเบฒเบเปเบเบฅเปเบเบฑเปเบเบเปเบฒเบง.
- 4. เปเบฅเบตเปเบก OnWorks Linux เบญเบญเบเบฅเบฒเบ เบซเบผเบท Windows online emulator เบซเบผเบท MACOS online emulator เบเบฒเบเปเบงเบฑเบเปเบเบเปเบเบตเป.
- 5. เบเบฒเบ OnWorks Linux OS เบเบตเปเปเบเบปเปเบฒเบซเบฒเบเปเปเปเบฅเบตเปเบกเบเบปเปเบ, เปเบเบเบตเปเบเบปเบงเบเบฑเบเบเบฒเบเปเบเบฅเปเบเบญเบเบเบงเบเปเบฎเบปเบฒ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX เบเปเบงเบเบเบทเปเบเบนเปเปเบเปเบเบตเปเบเปเบฒเบเบเปเบญเบเบเบฒเบ.
- 6. เบเบฒเบงเบเปเปเบซเบฅเบเบเปเบฒเบฎเปเบญเบเบชเบฐเบซเบกเบฑเบ, เบเบดเบเบเบฑเปเบเบกเบฑเบเปเบฅเบฐเบเปเบฒเปเบเบตเบเบเบฒเบ.
PASHA: Parallelized Short Read Assembly
Ad
เบฅเบฒเบเบฅเบฐเบญเบฝเบ
PASHA เปเบกเปเบเบเบปเบงเบเบฐเบเบญเบเบเบฒเบเบญเปเบฒเบเบชเบฑเปเบเบเบฐเบซเบเบฒเบเบชเปเบฒเบฅเบฑเบ genomes เบเบฐเบซเบเบฒเบเปเบซเบเปเปเบเบเปเบเป de Bruijn graphs. เบเบฒเบเปเบเปเบเบฐเปเบเบเบเบฒเบเบเบฑเบเบชเบญเบ CPUs multi-core เบเบตเปเปเบเปเบฎเปเบงเบกเบเบฑเบเปเบฅเบฐเบเบธเปเบกเบเบญเบกเบเบดเบงเปเบเบตเปเบเบงเบฒเบกเบเปเบฒเบเบตเปเปเบเบเบขเบฒเบ, PASHA เปเบเปเบชเบฐเปเบเบเปเบซเปเปเบซเบฑเบเบเปเบฒเปเบฎเบเบเบญเบเบเบปเบเปเบเบเบฒเบเบเบฐเบเบดเบเบฑเบเบเบฒเบเบเบฐเบเบญเบ de-novo เบเบตเปเบกเบตเบเบธเบเบเบฐเบเบฒเบเบชเบนเบเบเบญเบ genomes เบเบฐเบซเบเบฒเบเปเบซเบเปเปเบเปเบงเบฅเบฒเบเบตเปเปเบซเบกเบฒเบฐเบชเบปเบกเบเบฑเบเบเบฑเบเบเบฐเบเบฒเบเบญเบเบเบญเบกเบเบดเบงเปเบเบตเปเปเบฅเบฑเบเบเปเบญเบ. เบเบฒเบเบเบฐเปเบกเบตเบเบเบปเบเบเบญเบเบเบงเบเปเบฎเบปเบฒเปเบเบเบเปเบฒเปเบเปเบเบธเบเบเปเปเบกเบนเบเบเบนเปเบเบตเปเปเบเปเบเบดเบเบชเบฒเบกเบเบธเบเบชเบฐเปเบเบเปเบซเปเปเบซเบฑเบเบงเปเบฒ PASHA เบชเบฒเบกเบฒเบเบเบฐเบฅเบดเบเบเบฒเบเบเบฐเบเบญเบเบเบตเปเบเบตเบเบงเปเบฒเบเบตเปเบกเบตเบเบฒเบเบเบธเปเบกเบเบญเบ genome เบเบฝเบเบเบฝเบเปเบฅเบฐเบญเบฑเบเบเบฒเบเบฒเบเบเบฐเบเบญเบเบเบตเปเบเบดเบเบเบฒเบเปเบกเบทเปเบญเบเบฝเบเบเบฑเบเบชเบฒเบกเบเบปเบงเบเบฐเบเบญเบเบเบฑเปเบเบเปเบฒ: Velvet, ABySS เปเบฅเบฐ SOAPdenovo. เบเบดเปเบเปเบเบเบงเปเบฒเบเบฑเปเบ, PASHA เบเบฑเบเบฅเบธเบเบงเบฒเบกเปเบงเบเบตเปเปเบงเบเบตเปเบชเบธเบเบชเปเบฒเบฅเบฑเบเบเบธเบเบเปเปเบกเบนเบเบเบฑเบเบชเบฒเบกเปเบ CPU เบเบฝเบง. เบชเปเบฒเบฅเบฑเบ genome เบเบญเบเบกเบฐเบเบธเบ, PASHA เบเบฑเบเบฅเบธเบเบธเบเบเบฐเบเบฒเบเบเบฒเบเบเบฐเบเบญเบเบเบฒเบเปเบเปเบเบเบฑเบเบเบฑเบ ABySS เปเบฅเบฐเบชเบฒเบกเบฒเบเบชเปเบฒเปเบฅเบฑเบเบเบฒเบเบเบฐเบเบญเบเปเบเบเบฐเบกเบฒเบ 21 เบเบปเปเบงเปเบกเบ, เปเบเบดเปเบเบเบฐเบกเบฒเบ 2.38 ร เปเบงเบเปเบงเบฒ ABySS เปเบเบเบฒเบเบเบฑเปเบเบเปเบฒเบฎเบฒเบเปเบงเบเบฝเบงเบเบฑเบ.
เปเบเบเบฒเบเปเบเปเบเบญเบเบเบนเปเปเบเป
Console/Terminal
เบเบฒเบชเบฒเบเบฒเบเบเบฝเบเปเบเบฃเปเบเบฃเบก
C ++
เบเบฐเปเบเบ
เบเบตเปเปเบกเปเบเปเบญเบฑเบเบเบฅเบดเปเบเบเบฑเบเบเบตเปเบเบฑเบเบชเบฒเบกเบฒเบเปเบญเบปเบฒเบกเบฒเบเบฒเบ https://sourceforge.net/projects/pasha/. เบกเบฑเบเปเบเปเบเบทเบเบเบฑเบเบขเบนเปเปเบ OnWorks เปเบเบทเปเบญเปเบซเปเบเปเบฒเปเบเบตเบเบเบฒเบเบญเบญเบเปเบฅเบเปเปเบเบงเบดเบเบตเบเบตเปเบเปเบฒเบเบเบตเปเบชเบธเบเบเบฒเบเบซเบเบถเปเบเปเบเบฅเบฐเบเบปเบเบเบฐเบเบดเบเบฑเบเบเบฒเบเบเบฃเบตเบเบญเบเบเบงเบเปเบฎเบปเบฒ.