ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ PhyloTrack ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ PhyTB.v2.1.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ PhyloTrack ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
PhyloTrack ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌
ລາຍລະອຽດ
PhyloTrack ແມ່ນເຄື່ອງມືຊອບແວທີ່ໃຊ້ JavaScript ທີ່ປະສົມປະສານກັບຫ້ອງສະຫມຸດ D3.js ສໍາລັບການເບິ່ງເຫັນຂໍ້ມູນກັບເຄື່ອງມື JBrowse ສໍາລັບການເປັນຕົວແທນຂອງຕົວທ່ອງເວັບຂອງ genome. ມັນຕ້ອງການຕົ້ນໄມ້ phylogenetic ຂອງຮູບແບບຂໍ້ມູນ Newick ທົ່ວໄປເປັນການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບສາມໄຟລ໌ຂໍ້ມູນ meta ສໍາລັບຕົວຢ່າງ, clade-defining nodes ແລະຄໍານິຍາມສີ clade - ທັງຫມົດໃນຮູບແບບ delimited ແຖບ. ການທໍາງານພາຍໃນ PhyloTrack ສະແດງໃຫ້ເຫັນເຄື່ອງຫມາຍທີ່ມີຂໍ້ມູນຢູ່ໃນແຕ່ລະ node ໃນຕົ້ນໄມ້ phylogenetic, ສະນັ້ນການເນັ້ນໃສ່ polymorphism clade-defining. ການທໍາງານນີ້ໄດ້ຖືກປະຕິບັດໂດຍໃຊ້ເຄື່ອງມື tabix ໃນດ້ານເຊີຟເວີ, ສະຫນອງການເຂົ້າເຖິງງ່າຍດາຍແລະລວດໄວຂອງຂໍ້ມູນໃນແຕ່ລະ node ຕົ້ນໄມ້, ລວມທັງຂໍ້ມູນ SNPs ທີ່ເກັບໄວ້ໃນໄຟລ໌ VCF-ຄ້າຍຄືກັນ. ຕົວແປທີ່ໃຫ້ຂໍ້ມູນເຫຼົ່ານີ້ໄດ້ຖືກສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນໂດຍການປຽບທຽບຄວາມຖີ່ຂອງ allele ລະຫວ່າງຊະນິດ strain ໂດຍໃຊ້ການປຽບທຽບ node ບັນພະບຸລຸດແລະການວັດແທກ FST ຂອງຄວາມແຕກຕ່າງຂອງປະຊາກອນ.ຄຸນລັກສະນະ
- ການເປັນຕົວແທນຂອງ Phylogeny ຂອງຕົວຢ່າງ
- ຕົວທ່ອງເວັບຂອງ Genome
- ການແຈກຢາຍແຜນທີ່ຂອງ alleles ແລະ spoligotypes
- ການວິເຄາະຕົວຢ່າງແລະການຈັດຕໍາແຫນ່ງໃນຕົ້ນໄມ້
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python, Perl, PHP, JavaScript
ສະພາບແວດລ້ອມຖານຂໍ້ມູນ
DBMS ທີ່ອີງໃສ່ໄຟລ໌ອື່ນໆ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/phylotrack/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
