ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ PLEK ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ PLEK.1.2.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ PLEK ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
PLEK
Ad
ລາຍລະອຽດ
ການຕິດຕັ້ງຂໍ້ກໍານົດເບື້ອງຕົ້ນ:
1. ລີນຸກ
2. C/C++ compiler (ເຊັ່ນ: gcc, g++)
3. ເວີຊັ່ນ Python 2.5.0 ຫຼື ໃໝ່ກວ່າ (http://www.python.org/)
ຂັ້ນຕອນ:
1. ດາວໂຫຼດ PLEK.1.2.tar.gz ຈາກ https://sourceforge.net/projects/plek/files/
ແລະ decompress ມັນ.
$ tar zvxf PLEK.1.2.tar.gz
2. ລວບລວມ PLEK.
$cd PLEK.1.2
$ python PLEK_setup.py
ການນໍາໃຊ້
python PLEK.py -fasta fasta_file -output_file -thread number_of_threads
-minlength min_length_of_sequence -isoutmsg 0_or_1 -isrmtempfile 0_or_1
ຕົວຢ່າງ:
1. $ python PLEK.py -fasta PLEK_test.fa -out ຄາດ -thread 10
2. $ python PLEK.py -fasta PLEK_test.fa -out ຄາດຄະເນ -thread 10 -minlength 150
=========================
Aimin Li, ປະລິນຍາເອກ
ໂຮງຮຽນວິທະຍາສາດຄອມພິວເຕີ ແລະ ວິສະວະກຳສາດ,
ມະຫາວິທະຍາໄລເຕັກໂນໂລຊີ Xi'an,
5 ຖະຫນົນ Jinhua ພາກໃຕ້,
Xi'an, Shaanxi 710048, PR ຈີນ
liaiminmail AT gmail.com
emanlee815 AT 163com
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/plek/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
