ນີ້ແມ່ນແອັບ Windows ທີ່ມີຊື່ວ່າ kallisto ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ kallisto_windows-v0.50.0.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ kallisto ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ emulator ອອນ ໄລ ນ ໌ OS OnWorks ຈາກ ເວັບ ໄຊ ທ ໌ ນີ້, ແຕ່ ດີກ ວ່າ Windows ອອນ ໄລ ນ ໌ emulator.
- 5. ຈາກ OnWorks Windows OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກແລະຕິດຕັ້ງມັນ.
- 7. ດາວໂຫລດ Wine ຈາກບ່ອນເກັບມ້ຽນຊອບແວການແຈກຢາຍ Linux ຂອງທ່ານ. ເມື່ອຕິດຕັ້ງແລ້ວ, ທ່ານສາມາດຄລິກສອງຄັ້ງ app ເພື່ອດໍາເນີນການໃຫ້ເຂົາເຈົ້າກັບ Wine. ນອກນັ້ນທ່ານຍັງສາມາດລອງ PlayOnLinux, ການໂຕ້ຕອບທີ່ແປກປະຫຼາດໃນໄລຍະ Wine ທີ່ຈະຊ່ວຍໃຫ້ທ່ານຕິດຕັ້ງໂປລແກລມ Windows ແລະເກມທີ່ນິຍົມ.
ເຫຼົ້າແວງເປັນວິທີການແລ່ນຊອບແວ Windows ໃນ Linux, ແຕ່ບໍ່ມີ Windows ທີ່ຕ້ອງການ. ເຫຼົ້າແວງແມ່ນຊັ້ນຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ຂອງ Windows ແຫຼ່ງເປີດທີ່ສາມາດເອີ້ນໃຊ້ໂຄງການ Windows ໂດຍກົງໃນ desktop Linux ໃດກໍໄດ້. ໂດຍພື້ນຖານແລ້ວ, Wine ກໍາລັງພະຍາຍາມປະຕິບັດໃຫມ່ຢ່າງພຽງພໍຂອງ Windows ຕັ້ງແຕ່ເລີ່ມຕົ້ນເພື່ອໃຫ້ມັນສາມາດດໍາເນີນການຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ Windows ທັງຫມົດໄດ້ໂດຍບໍ່ຕ້ອງໃຊ້ Windows.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
ຄາລິສໂຕ
ລາຍລະອຽດ
kallisto ແມ່ນໂຄງການສໍາລັບປະລິມານທີ່ໃກ້ຄຽງທີ່ດີທີ່ສຸດຂອງຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງ transcript ຈາກຂໍ້ມູນ RNA-Seq, ຫຼືຫຼາຍກວ່ານັ້ນໂດຍທົ່ວໄປຂອງລໍາດັບເປົ້າຫມາຍໂດຍໃຊ້ການອ່ານລໍາດັບທີ່ຜ່ານຄວາມໄວສູງ. ມັນແມ່ນອີງໃສ່ແນວຄວາມຄິດຂອງການນໍາໃຊ້ pseudoalignment ເພື່ອກໍານົດການອ່ານແລະການເຂົ້າກັນໄດ້ຂອງເປົ້າຫມາຍຢ່າງໄວວາ, ບໍ່ຈໍາເປັນຕ້ອງມີການຈັດຕໍາແຫນ່ງ.
ອີງຕາມມາດຕະຖານທີ່ເຮັດຢູ່ໃນຄອມພິວເຕີຕັ້ງໂຕະ Mac, kallisto ສາມາດປະເມີນຈໍານວນ RNA-seq ຂອງມະນຸດຈໍານວນ 30 ລ້ານຄົນທີ່ອ່ານໃນເວລາຫນ້ອຍກວ່າ 3 ນາທີໂດຍມີພຽງແຕ່ລໍາດັບການອ່ານແລະດັດສະນີການຖອດຂໍ້ຄວາມ, ເຊິ່ງໃນຕົວຂອງມັນເອງສາມາດໃຊ້ເວລາຫຼາຍກວ່າ 10 ນາທີເພື່ອສ້າງ. ແລະນັບຕັ້ງແຕ່ມັນໃຊ້ pseudoalignment, ມັນແຂງແຮງຕໍ່ຄວາມຜິດພາດໃນການອ່ານແລະຮັກສາຂໍ້ມູນທີ່ສໍາຄັນທີ່ຈໍາເປັນສໍາລັບການກໍານົດປະລິມານ. ນີ້ເຮັດໃຫ້ kalisto ບໍ່ພຽງແຕ່ໄວແຕ່ມີຄວາມຖືກຕ້ອງສູງເຊັ່ນກັນ. ໃນຫຼາຍມາດຕະຖານ, ມັນຍັງດີກວ່າເຄື່ອງມືທີ່ມີຢູ່.
ຄຸນລັກສະນະ
- ໃຊ້ pseudoalignment
- ໄວແລະຖືກຕ້ອງ
- RNA-Seq ສ່ວນໃຫຍ່ສາມາດວິເຄາະໄດ້ດ້ວຍ sleuth
- ສາມາດໃຊ້ກັບ bustools ເພື່ອປະມວນຜົນຂໍ້ມູນ RNA-seq ເຊລດຽວກ່ອນ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
C
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.