bowtie-build - ഓൺലൈനിൽ ക്ലൗഡിൽ

പട്ടിക:

NAME

ബൗട്ടി-ബിൽഡ് - ബൗട്ടിക്ക് ഒരു കളർസ്പേസ് ഇൻഡക്സ് നിർമ്മിക്കുക

സിനോപ്സിസ്

bowtie-build [ഓപ്ഷനുകൾ]*

വിവരണം

റഫറൻസ്_ഇൻ
റെഫ് സീക്വൻസുകളുള്ള ഫയലുകളുടെ കോമയാൽ വേർതിരിച്ച ലിസ്റ്റ്

ebwt_outfile_base
ഈ dir/അടിസ്ഥാന നാമമുള്ള ഫയലുകളിലേക്ക് Ebwt ഡാറ്റ എഴുതുക

ഓപ്ഷനുകൾ

-f റഫറൻസ് ഫയലുകൾ ഫാസ്റ്റയാണ് (സ്ഥിരസ്ഥിതി)

-c cmd ലൈനിൽ നൽകിയിരിക്കുന്ന റഫറൻസ് സീക്വൻസുകൾ (അതുപോലെ )

--വലിയ സൂചിക
ref 4 ബില്ല്യണിൽ താഴെ ആണെങ്കിൽ പോലും ജനറേറ്റഡ് ഇൻഡക്സ് 'വലുത്' ആകാൻ നിർബന്ധിക്കുന്നു
ഏകകോശ

-C/--നിറം
ഒരു കളർസ്പേസ് ഇൻഡക്സ് നിർമ്മിക്കുക

-a/--noauto
ഓട്ടോമാറ്റിക് പ്രവർത്തനരഹിതമാക്കുക -p/--bmax/--dcv മെമ്മറി-ഫിറ്റിംഗ്

-p/--പാക്ക് ചെയ്തു
പായ്ക്ക് ചെയ്ത സ്ട്രിംഗുകൾ ആന്തരികമായി ഉപയോഗിക്കുക; പതുക്കെ, കുറച്ച് മെം ഉപയോഗിക്കുന്നു

--bmax
ബ്ലോക്ക്വൈസ് സഫിക്സ്-അറേ ബിൽഡറിനുള്ള പരമാവധി ബക്കറ്റ് sz

--bmaxdivn
പരമാവധി ബക്കറ്റ് sz, ref len ന്റെ വിഭജനം (ഡിഫോൾട്ട്: 4)

--dcv
ബ്ലോക്ക്വൈസിനുള്ള ഡിഫ്-കവർ കാലയളവ് (സ്ഥിരസ്ഥിതി: 1024)

--nodc ഡിഫ്-കവർ പ്രവർത്തനരഹിതമാക്കുക (അൽഗോരിതം ക്വാഡ്രാറ്റിക് ആയി മാറുന്നു)

-r/--നോറഫ്
.3/.4.ebwt (പാക്ക് ചെയ്ത റഫറൻസ്) ഭാഗം നിർമ്മിക്കരുത്

-3/--justref
.3/.4.ebwt (പാക്ക് ചെയ്ത റഫറൻസ്) ഭാഗം നിർമ്മിക്കുക

-o/--ഓഫ്റേറ്റ്
SA ഓരോ 2^ഓഫ്‌റേറ്റ് BWT ചാറുകളും സാമ്പിൾ ചെയ്യുന്നു (ഡിഫോൾട്ട്: 5)

-t/--ftabchars
പ്രാരംഭ ലുക്കപ്പിൽ ഉപയോഗിച്ച അക്ഷരങ്ങളുടെ # എണ്ണം (ഡിഫോൾട്ട്: 10)

--ntoa Ns-നെ As-ലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യുക

--വിത്ത്
റാൻഡം നമ്പർ ജനറേറ്ററിനുള്ള വിത്ത്

-q/--നിശബ്ദമായി
വെർബോസ് ഔട്ട്പുട്ട് (ഡീബഗ്ഗിംഗിന്)

-h/--സഹായം
ഉപകരണത്തിന്റെയും അതിന്റെ ഓപ്ഷനുകളുടെയും വിശദമായ വിവരണം അച്ചടിക്കുക

--ഉപയോഗം
ഈ ഉപയോഗ സന്ദേശം അച്ചടിക്കുക

--പതിപ്പ്
പതിപ്പ് വിവരങ്ങൾ അച്ചടിച്ച് പുറത്തുകടക്കുക

64-ബിറ്റ് നിർമ്മിച്ചത് lgw01-11 വ്യാഴം നവംബർ 26 11:11:03 UTC 2015 കമ്പൈലർ: gcc പതിപ്പ് 5.2.1 20151123
(ഉബുണ്ടു 5.2.1-25ubuntu1) ഓപ്ഷനുകൾ: -O3 -Wl,--ഹാഷ്-ശൈലി=രണ്ടും -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -O2
-fstack-protector-strong - ഫോർമാറ്റ് -വെറർ=ഫോർമാറ്റ്-സുരക്ഷ -g -O2 -fstack-protector-strong
- ഫോർമാറ്റ് -വെറർ=ഫോർമാറ്റ്-സുരക്ഷ -Wl,-സിംബോളിക്-ഫംഗ്ഷനുകൾ -Wl,-z, relro Sizeof {int, long,
നീളം, ശൂന്യം*, size_t, off_t}: {4, 8, 8, 8, 8, 8}

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് bowtie-build ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക