Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന codonw കമാൻഡ് ഇതാണ്.
പട്ടിക:
NAME
codonw - കോഡൺ ഉപയോഗത്തിന്റെ കറസ്പോണ്ടൻസ് വിശകലനം
വിവരണം
codonW [inputfile] [outputfile] [bulkoutfile] [ഓപ്ഷനുകൾ] പൊതുവായ ഓപ്ഷനുകളും ഡിഫോൾട്ടുകളും:
-h(എൽപി)
ഈ സഹായ സന്ദേശം
- നാമം
മെനു ഇന്റർഫേസ് പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നത് തടയുക
- ഇപ്പോൾ മുന്നറിയിപ്പ്
സീക്വൻസുകളെക്കുറിച്ചുള്ള മുന്നറിയിപ്പുകൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നത് തടയുക
- നിശബ്ദം
നിശബ്ദമായി ഫയലുകൾ തിരുത്തിയെഴുതുക
-ആകെ
ഇൻപുട്ട് ഫയലിൽ എല്ലാ ജീനുകളും സംയോജിപ്പിക്കുക
- യന്ത്രം
മെഷീൻ റീഡബിൾ ഔട്ട്പുട്ട്
- മനുഷ്യൻ മനുഷ്യർക്ക് വായിക്കാവുന്ന ഔട്ട്പുട്ട്
-കോഡ് N
മെനു 3 ഓപ്ഷൻ 5-ന് കീഴിൽ നിർവചിച്ചിരിക്കുന്ന ജനിതക കോഡ്
-f_type N
മെനു 3 ഓപ്ഷൻ 6 പ്രകാരം നിർവചിച്ചിരിക്കുന്ന Fop/CBI കോഡണുകൾ
-സി_തരം N
മെനു 3 ഓപ്ഷൻ 7 നിർവ്വചിച്ചിരിക്കുന്ന Cai ഫിറ്റ്നസ് മൂല്യങ്ങൾ
-t (ചർ)
ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലുകളിൽ ഉപയോഗിക്കേണ്ട കോളം സെപ്പറേറ്റർ (കോമ, ടാബ്, സ്പേസ്)
കോഡൺ ഉപയോഗ സൂചികകളും അമിനോ ആസിഡ് സൂചികകളും
-കായ് കോഡൺ അഡാപ്റ്റേഷൻ ഇൻഡക്സ് (സിഎഐ) കണക്കാക്കുക
-fop ഒപ്റ്റിമൽ കോഡൺ ഇൻഡക്സിന്റെ (എഫ്ഒപി) ആവൃത്തി കണക്കാക്കുക
-സിബിഐ കോഡൺ ബയസ് ഇൻഡക്സ് (CBI) കണക്കാക്കുക
-enc ഫലപ്രദമായ കോഡണുകളുടെ എണ്ണം (ENc)
-ജിസി ജീനിന്റെ G+C ഉള്ളടക്കം (എല്ലാ 3 കോഡൺ സ്ഥാനങ്ങളും)
-ജിസിഎസ്3 പര്യായമായ കോഡണുകളുടെ ജിസി മൂന്നാം സ്ഥാനങ്ങൾ
-സിൽ_ബേസ്
പര്യായമായ മൂന്നാം കോഡൺ സ്ഥാനങ്ങളിലെ അടിസ്ഥാന ഘടന
-L_sym പര്യായമായ കോഡണുകളുടെ എണ്ണം
-L_aa പര്യായവും അല്ലാത്തതുമായ കോഡണുകളുടെ ആകെ എണ്ണം
-എല്ലാ_സൂചികകളും
മുകളിലുള്ള എല്ലാ സൂചികകളും
-ആരോ പ്രോട്ടീന്റെ സുഗന്ധം കണക്കാക്കുക
-hyd പ്രോട്ടീന്റെ ഹൈഡ്രോപതിസിറ്റി കണക്കാക്കുക
-cai_file
{file} CAI മൂല്യങ്ങളുടെ ഉപയോക്തൃ ഇൻപുട്ട് ഫയൽ
-cbi_file
{file} CBI മൂല്യങ്ങളുടെ ഉപയോക്തൃ ഇൻപുട്ട് ഫയൽ
-fop_file
{file} ഫോപ്പ് മൂല്യങ്ങളുടെ ഉപയോക്തൃ ഇൻപുട്ട് ഫയൽ
കറസ്പോണ്ടൻസ് അനാലിസിസ് (COA) ഓപ്ഷനുകൾ
-coa_cu
കോഡൺ ഉപയോഗ ആവൃത്തികളുടെ COA
-coa_rscu
റിലേറ്റീവ് സിനോണിമസ് കോഡൺ ഉപയോഗത്തിന്റെ COA
-coa_aa
അമിനോ ആസിഡ് ഉപയോഗ ആവൃത്തികളുടെ COA
-coa_വിദഗ്ദ്ധൻ
COA-യിൽ വിശദമായ (വിദഗ്ധ) സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ സൃഷ്ടിക്കുക
-coa_axes N
രേഖപ്പെടുത്താനുള്ള അച്ചുതണ്ടിന്റെ എണ്ണം തിരഞ്ഞെടുക്കുക
-coa_num N
ഒപ്റ്റിമൽ കോഡണുകളുടെ മൂല്യങ്ങൾ മുഴുവനായും തിരിച്ചറിയാൻ ഉപയോഗിക്കേണ്ട ജീനുകളുടെ എണ്ണം തിരഞ്ഞെടുക്കുക
സംഖ്യകൾ അല്ലെങ്കിൽ ഒരു ശതമാനം (5 അല്ലെങ്കിൽ 10%)
ബൾക്ക് ഔട്ട്പുട്ട് ഓപ്ഷനുകൾ | ഒരു വിശകലനത്തിന് ഒരെണ്ണം മാത്രമേ തിരഞ്ഞെടുക്കാനാവൂ
-ഓ അമിനോ ആസിഡ് ഉപയോഗം (AAU)
-raau ആപേക്ഷിക അമിനോ ആസിഡ് ഉപയോഗം (RAAU)
-ക്യു കോഡൺ ഉപയോഗം (CU) (ഡിഫോൾട്ട്)
-കുട്ടബ് കോഡൺ ഉപയോഗത്തിന്റെ പട്ടിക
- കട്ടോട്ട് ഡാറ്റാസെറ്റിന്റെ കോഡൺ ഉപയോഗത്തിന്റെ ടാബുലേഷൻ
-rscu ആപേക്ഷിക സിനോണിമസ് കോഡൺ ഉപയോഗം (RSCU)
- ഫാസ്റ്റ ഫാസ്റ്റ ഫോർമാറ്റ്
-വൃത്തിയായി ഫാസ്റ്റ ഫോർമാറ്റ്
-വായനക്കാരൻ
റീഡർ ഫോർമാറ്റ് (കോഡണുകൾ സ്പെയ്സുകളാൽ വേർതിരിച്ചിരിക്കുന്നു)
-വിവർത്തനം
ഡിഎൻഎയുടെ അമിനോ ആസിഡിലേക്കുള്ള ആശയ വിവർത്തനം
-അടിസ്ഥാനം കോഡൺ G+C ഘടനയുടെ വിശദമായ റിപ്പോർട്ട്
-dinuc മൂന്ന് കോഡൺ പോസിന്റെ ഡൈന്യൂക്ലിയോടൈഡ് ഉപയോഗം.
-noblk ഫയലിലേക്ക് ബൾക്ക് ഔട്ട്പുട്ടൊന്നും എഴുതേണ്ടതില്ല
ഇവിടെ {file} ഒരു ഇൻപുട്ട് ഫയൽനാമത്തെയും N ഒരു പൂർണ്ണസംഖ്യ മൂല്യത്തെയും പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു <>
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് codonw ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക